تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,532 |
تعداد مقالات | 70,500 |
تعداد مشاهده مقاله | 124,086,837 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 97,190,063 |
بررسی تنوع ژنتیکی در برخی از ارقام تجاری سیب زمینی ایران با استفاده ازتکنیکRAPD-PCR | ||
مجله علوم کشاورزی ایران | ||
مقاله 25، دوره 34، شماره 4 - شماره پیاپی 1459، تیر 1382 اصل مقاله (350.13 K) | ||
نویسندگان | ||
غلامرضا صالحی جوزانی؛ سیروس عبد میشانی؛ عبدالهادی حسین زاده؛ بدرالدین ابراهیم سید طباطبائی* | ||
چکیده | ||
به منظور مطالعه چند شکلی های DNA در 28 رقم سیب زمینی ایران غده های ارقام در گلخانه کشت و در مرحله 4-3 برگی، DNAی ارقام با روش دلاپورتا (مینی پرپ) از برگ استخراج و کمّیت و کیفیت آنها به وسیله دستگاه اسپکتروفتومتری اندازه گیری شد. برای انجام واکنش PCR، 100 آغازگر تصادفی انتخاب و بر روی نمونه ها آزمایش گردیدند. شانزده آغازگر تکثیر DNA ی الگو را به خوبی انجام داده و بین ارقام چند شکلی نشان دادند. نوارهای با وضوح بالا و با اندازه مناسب ( 2400-300 جفت باز) که دارای تکرار پذیری بالایی بودند، انتخاب و وارد محاسبات شدند. این 16 آغازگر به طور کلی تعداد 190 نشانگر و 1854 نوار در کل ارقام تولید کردند. تجزیه خوشه ای ارقام براساس حضور باند(1) و عدم حضور باند(0) با استفاده از ضرایب تشابه جاکارد و ضریب تطابق ساده به روش UPGMA انجام گرفت. بیشترین تمایز ژنتیکی بین ارقام ولوکس و هرتا- 2 و کمترین تمایز ژنتیکی بین ارقام هرتا - 1 و هرتا - 2 بدست آمد. در نتیجه محاسبات ضریب جاکارد و تطابق ساده در تجزیه خوشه ای ، ارقام به ترتیب در 7و4 گروه قرار گرفتند که این نشاندهنده حساسیت بالاتر ضریب جاکارد می باشد. نتایج این تحقیق تابعیت تنوع ژنتیکی از تنوع جغرافیایی در ارقام سیب زمینی را نشان داد و ارقام آمریکایی، هلندی و آلمانی در گروههای جداگانه قرارگرفتند. بنابراین میتوان گفت که روش RAPD-PCR برای دسته بندی ژرم پلاسم و شناسایی گروههای هتروژن سیب زمینی مفید و یک تکنیک مؤثر در برنامههای اصلاحی این گیاه میباشد. | ||
کلیدواژهها | ||
تنوع ژنتیکی؛ سیب زمینی؛ نشانگرهای مولکولی | ||
عنوان مقاله [English] | ||
- | ||
چکیده [English] | ||
The RAPD procedure was used to evaluate genetic diversity of 28 commercial potato cultivars in Iran. DNA of genotypes was extracted from leaves at 3-4 leafy stage by miniprep method. One hundred decamer primers were selected randomly and tested on each sample genotype. Sixteen primers yielded 194 polymorphic DNA fragments (marker), ranging in size from 300 to 2400 bp. A total of 1854 bands were observed among the 28 potato genotypes. Cluster analysis of cultivars was performed based on presence (1) and absence (0) of bands using Jaccards (j.s.c) and Simple Matching Similarity Coefficient (S.M.S.C.) by UPGMA method. These analyses indicated that the greatest genetic difference & similarity was between vlox & herta-2 and herta-1 & herta-2 (plus fersco & ajiba), respectively. Cluster analysis of j.s.c. indicated 7 groupe and that of S.M.S.C indicated 4 groups. Therefore, it was concluded that, j.s.c is more sensitive than S.M.C and is more suitable for comparing cultivar bands produced by RAPD. It was concluded that genetic diversity of potato cultivars was related to their geographical distance and RAPD is useful for classification of germplasm as well as identification of divergent groups. | ||
کلیدواژهها [English] | ||
DNA, Genetic diversity, PCR, Polymorphism, potato, RAPD | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,506 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,516 |