سامانه پشتیبانی خدمات اطلاعات

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات161
تعداد شماره‌ها6,533
تعداد مقالات70,518
تعداد مشاهده مقاله124,133,396
تعداد دریافت فایل اصل مقاله97,239,414
نصیری فر, احسان, اسمعیلی زاده کشکوئیه, علی, مرادیان, حسن, سهرابی, سعید. (1394). شناسایی جایگاه‌های صفات کمّی مؤثر بر صفات لاشه و اندام‌های داخلی کروموزوم شمارۀ دو بلدرچین ژاپنی. , 46(3), 223-233. doi: 10.22059/ijas.2015.56417
احسان نصیری فر; علی اسمعیلی زاده کشکوئیه; حسن مرادیان; سعید سهرابی. "شناسایی جایگاه‌های صفات کمّی مؤثر بر صفات لاشه و اندام‌های داخلی کروموزوم شمارۀ دو بلدرچین ژاپنی". , 46, 3, 1394, 223-233. doi: 10.22059/ijas.2015.56417
نصیری فر, احسان, اسمعیلی زاده کشکوئیه, علی, مرادیان, حسن, سهرابی, سعید. (1394). 'شناسایی جایگاه‌های صفات کمّی مؤثر بر صفات لاشه و اندام‌های داخلی کروموزوم شمارۀ دو بلدرچین ژاپنی', , 46(3), pp. 223-233. doi: 10.22059/ijas.2015.56417
نصیری فر, احسان, اسمعیلی زاده کشکوئیه, علی, مرادیان, حسن, سهرابی, سعید. شناسایی جایگاه‌های صفات کمّی مؤثر بر صفات لاشه و اندام‌های داخلی کروموزوم شمارۀ دو بلدرچین ژاپنی. , 1394; 46(3): 223-233. doi: 10.22059/ijas.2015.56417

شناسایی جایگاه‌های صفات کمّی مؤثر بر صفات لاشه و اندام‌های داخلی کروموزوم شمارۀ دو بلدرچین ژاپنی

علوم دامی ایران
مقاله 2، دوره 46، شماره 3، مهر 1394، صفحه 223-233    اصل مقاله (631.95 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2015.56417
نویسندگان
احسان نصیری فر* 1؛ علی اسمعیلی زاده کشکوئیه2؛ حسن مرادیان3؛ سعید سهرابی4
1دانشجوی دکتری دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات تهران، گروه علوم دامی، تهران
2دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان
3کارشناس ارشد گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان
4دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان
چکیده
برای مکان‌یابی جایگاه‌های صفات کمّی (QTL) مؤثر بر صفات لاشه و اندام‌های داخلی کروموزوم شمارۀ دو بلدرچین ژاپنی، با استفاده از تلاقی متقابل دو سویۀ پرندۀ سفید (تخم‌گذار) و وحشی (گوشتی)، پرندگان نسل F1 ایجاد شدند. 422 پرندۀ نسل F2 حاصل از تلاقی تصادفی پرندگان نسل F1 در پایان دورۀ 35 روزۀ پرورش کشتار شدند و رکوردبرداری فنوتیپی صفات مربوط به لاشه انجام گرفت و نمونه‌های خون آن‌ها برای تعیین ژنوتیپ چهار نشانگر ریزماهواره واقع روی کروموزوم دو جمع‌آوری شد. داده‌های مربوط به تعیین ژنوتیپ و رکوردبرداری فنوتیپی با روش نقشه‌یابی درون فاصله‌ای مبتنی بر تابعیت و با استفاده از 3 مدل آماری متفاوت مورد تجزیه و تحلیل QTL قرار گرفتند و در مجموع 15 جایگاه معنا‌دار مربوط به این صفات شناسایی شدند. در مدل اول تمامی صفات با اثر غلبه معنا‌دار شدند. در مدل دوم تمامی صفات نزدیک نشانگر GUJ0084 قرار داشتند و اغلب صفات QTLهای معنا‌داری با اثرات غلبه و ایمپرینتینگ داشتند. در مدل سوم نیز بیشتر صفات در جنس ماده و با اثر غلبه معنا‌دار شدند. نتایج این پژوهش نقش توارث غیر مندلی (ایمپرینتینگ ژنومی) و اثرات پلیوتروپی و تک‌‌‌‌‌‌‌‌‌ژنی را روی بعضی صفات نشان می‌دهد.
کلیدواژه‌ها
ایمپرینتینگ؛ بلدرچین ژاپنی؛ نشانگر ریزماهواره؛ نقشه‌یابی QTL
عنوان مقاله [English]
Identification of quantitative trait loci affecting carcass traits and internal organs on chromosome two in Japanese quail
نویسندگان [English]
Ehsan Nasirifar1؛ Ali K. Esmailizadeh2؛ Hasan Moradian3؛ Saeed Sohrabi4
1Ph. D. Student, Department of Animal Science, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
2Associate Professor, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran
3Former M. Sc. Student, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran
4Ph. D. Student, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran
چکیده [English]
The aim of present research was to locate genomic loci (QTL) on chromosome 2. Itis associated with the carcass traits in Japanese quail. The F1 population was created by using reciprocal crosses between two strains of white birds (layer) and wild (broiler) birds. The F2 birds (422 birds) were derived by random mating of the F1 birds. All of the F2 birds were slaughtered at 35 days of age and recorded for carcass traits. Blood samples were collected at slaughtering time to genotype for four microsatellite markers on chromosome 2. Genotypic and phenotypic data were analyzed for QTL mapping with interval mapping method based on regression applying three different genetic models. A total number of 15 loci was found to be significantly associated with carcass traits. In the first model all traits with dominance effect were significant. The second model often had significant QTL with dominance and imprinting effects and all the traits were closest to the GUJ0084 marker. When it comes to the third model, most of the traits were significant in the female with dominance effect. Results of this study showed the role of Non-Mendelian inheritance (genomic imprinting) and pleiotropy as well as single gene effects in some traits.
کلیدواژه‌ها [English]
imprinting, Japanese quail, microsatellite markers, QTL mapping
مراجع
  1. Aslam, M.L., Bastiaansen, JWM., Crooijmans, RPMA., Vereijken, A., Megens, H-J. & Groenen, M.A.M. (2011). Whole genome QTL mapping for growth, meat quality and breast meat yield traits in turkey. BMC Genetics, 12, 61.
  2. Ayatollahi-Mehrgardi, A. (2008). Divergent selection for growth and reproduction traits in Japanese quail. Ph. D. dissertation, University of Tehran. (in Farsi)
  3. Ayatollahi A. (2012) Divergent selection for four-week body weight in Japanese quail (Coturnix coturnix japonica): response to selection and realized heritability. Journal of Livestock Science and Technologies, 1(1), 61-64.
  4. Baron, E.E., Moura, A.S.A.M.T., Ledur, M.C., Pinto, L.F.B., Boschiero, C., Ruy, D.C., Nones, K., Zanella, E.L., Rosa rio, M.F., Burt, D.W. & Coutinho, L.L. (1991). QTL for percentage of carcass and carcass parts in a broiler x layer cross. Animal Genetics, 1365-2052.2010.02105.
  5. Bassam, B.J., Caetano-Anollés, G. & Gresshoff, PM. (1991). Fast and sensitive silver staining of DNA in polyacrylamide gels. Analytical Biochemistry, 196, 80-83.
  6. Charati, H. & Esmailizadeh, A.K. (2013). Carcass traits and physical characteristics of eggs in Japanese quail as affected by genotype, sex and hatch. Journal of Livestock Science and Technologies, 2 (1), 59-64.
  7.  Churchill, GA. & Doerge, RW. (1994). Empirical threshold values for quantitative trait mapping. Genetics, 138, 963-971.
  8. Dadpasand, M. (2010). Principles of animal breeding. (1st ed.), Shiraz University Publications. (In Farsi)
  9. Davison, F (Ed.), Kaspers, B (Ed.) & Karel, A. (Ed.) (2008) Avian Immunology. (1th ed.) Academic Press is an imprint of Elsevier, ISBN: 978-0-12-370634-8.
  10. Dekkers, J. C. (2004). Commercial application of marker- and gene-assisted selection in livestock: Strategies and lessons. Journal of Animal Science, 82(E-Suppl.), E313–E328.
  11. De Koning, D J., Haley, C S., Windsor, D., Hocking, P M., Griffin, H., Morris, A., Vincent, J. & Burt, D W. (2004). Segregation of QTL for production traits in commercial meat-type chickens. Genetical research, 83 (3), 211-20.
  12. Esmailizadeh, A.K., Baghizadeh, A. & Ahmadizadeh, M. (2012). Genetic mapping of quantitative trait loci affecting bodyweight on chromosome 1 in a commercial strain of Japanese quail. Animal Production Science, 52, 64-68.
  13. Gil, A., Shula, B., Marc, F., Avigdor, C., Uri, L. & Jossi, H. (2008). QTLs detected in a multigenerational resource chicken population. The Journal of heredity, 99 (5), 528-38.
  14. Glick, B., Timothy, S., Chang, R. & Jaap, G. (1956). The bursa of fabricius and antibody production. Poultry Science, 35(1), 224-225.
  15. Glick, B. (1994). The bursa of fabricius: the evolution of a discovery. Poultry Science, 73(7):979-83.
  16. Haley, CS., Knott, SA. & Elsen, JM. (1994) Mapping quantitative trait loci in crosses between outbred lines using least squares. Genetics, 136, 1195-1207.
  17. Jabbari Ori, R., Esmailizadeh, AK ., Charati,H., Mohammadabadi, MR. & Sohrabi, SS. (2014). Identification of QTL for live weight and growth rate using DNA markers on chromosome 3 in an F2 population of Japanese quail. Molecular Biology Reports, 41, 1049-1057.
  18. Jenne D.G.J., Vereijken, A.L.J., Bovenhuis, H., Crooijmans, R.M.P.A., van der Poel, J.J. & Groenen, M. A.M. (2005). Confirmation of quantitative trait loci affecting fatness in chickens. Genetics Selection Evolution, 37, 215-228.
  19. Kayang, B.B., Inoue-Murayama, M., Nomura A., Kimura K., Takahashi H., Mizutani M. & Ito S. (2000). Fifty microsatellite markers for Japanese quail. The Journal of Heredity, 91, 502-5.
  20. Kayang, B. B., Fillon, V., Inoue-Murayama, M., Miwa, M., Leroux, S., Fève, K., Monvoisin, J. L., Pitel, F., Vignoles, M., Mouilhayrat, C., Beaumont, C., Ito, S. I., Minvielle F. & Vignal A. (2006). Integrated maps in quail (Coturnix japonica) confirm the high degree of synteny conservation with chicken (Gallus gallus) despite 35 million years of divergence. BMC Genomics, 7, 101.
  21. Khaldari, M., Pakdel, A., Mehrabani Yegane, H., Nejati Javaremi, A. & Berg P. (2010). Response to selection and genetic parameters of body and carcass weights in Japanese quail selected for 4 week body weight. Poultry Science, 89, 1834-1841.
  22. Lei, Z., Mai-Qing, Z., Ran-Ran, L., Jie, W., Dan, W., Yao-Dong, H., Yan-Fa, S., Peng, L., Li, L. & Gui-ping, Z. (2012). Genome-Wide Association of Thymus and Spleen Mass in Chicken. Scientia Agricultura Sinica, 45(15), 3165-3175
  23. Liu, X., Li, H., Wang, S., Hu, X., Gao, Y., Wang, Q., Li, N., Wang, Y. & Zhang, H. (2007). Mapping quantitative trait loci affecting body weight and abdominal fat weight on chicken chromosome one. Poultry science, 86 (6), 1084-9.
  24. McElroy, J.P., Kim, J.J., Harry, D.E., Brown, S.R., Dekkers, JCM. & Lamont SJ. (2006). Identification of trait loci affecting white meat percentage and other growth and carcass traits in commercial broiler chickens. Poultry Science, 85, 593-605.
  25. Miller, S.A., Dykes, D.D. & Polesky, HF. (1988). A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research, 16, 1215.
  26. Minvielle, F., Kayang, B., Inoue-Murayama, M., Miwa, M., Vignal, A., Gourichon, D., Neau, A., Monvoisin, J. & Ito, S. (2005) Microsatellite mapping of QTL affecting growth, feed consumption, egg production, tonic immobility and body temperature of Japanese quail. BMC Genomics 6, 87.
  27. Moradian, H., Esmailizadeh, A.K., Sohrabi, S.S. & Nasirifar, E. (2014a). Effect of reciprocal cross on growth related traits and carcass characteristics in an F2 intercross between two strains of Japanese quail. Animal Production Research, 2 (4), 61-68. (in Farsi)
  28. Moradian, H., Esmailizadeh, AK., Sohrabi, SS., Nasirifar, E., Askari, N., Mohammadabadi, MR. & Baghizadeh, A. (2014b). Genetic analysis of an F2 intercross between two strains of Japanese quail provided evidence for quantitative trait loci affecting carcass composition and internal organs. Molecular Biology Reports, 41, 4455-4462.
  29. Moradian, H., Esmailizadeh, A.K., Mohammadabadi, MR. & Sohrabi, SS. (2015). Identification of quantitative trait loci associated with weight and percentage of internal organs on chromosome 1 in Japanese quail. Agricultural Biotechnology, 6(4), 143-158. (in Farsi)
  30.  Navarro, P., Visscher, PM., Knott, S.A., Burt, D.W., Hocking, PM. & Haley, CS. (2005) Mapping of quantitative trait loci affecting organ weights and blood variablesin a broiler layer cross. British Poultry Science. 46(4):430-42.
  31. Park, H.B., Jacobsson, L., Wahlberg, P., Siegel, P.B. & Andersson, L. (2006). QTL analysis of body composition and metabolic traits in an intercross between chicken lines divergently selected for growth. Physiological Genomics, 25(2), 216-23
  32. Primmer, C.R., Raudsepp, T., Chowdhary, B.P., Møller, A.P. & Ellegren, H. (1997). Low frequency of microsatellites in the avian genome. Genome Research, 7, 471-82.
  33. Reik, W. & Walter, J. (2001). Genomic imprinting: paternal influence on the genome. Macmillan Magazines Ltd .Volume 2, January nature reviews.
  34. Rezvannejad E. (2014) Productive, reproductive performance and biochemical parameters of short-term divergently selected Japanese quail lines and their reciprocal crosses. Journal of Livestock Science and Technologies, 1 (2), 35-42.
  35. Schmid, M., Nanda, I. & Guttenbach, M. (2000). First report on chicken genes and chromosomes. Cytogenetics and Cell Genetics, 90, 169-218.
  36. Sohrabi, SS., Esmailizadeh, A.K., Baghizadeh, A., Moradian, H., Mohammadabadi, M.R., Askari, N. & Nasirifar, E. (2012). Quantitative trait loci underlying hatching weight and growth traits in an F2 intercross between two strains of Japanese quail. Animal Production Science, 2012, 52, 1012-1018.
  37. Sohrabi, SS., Esmailizadeh, AK., Mohammadabadi, MR. & Moradian, H. (2014). Mapping Quantitative Trait Loci underlying Kleiber ratio and identification of their mode of action in an F2 population of Japanese quail (Coturnix coturnix japonica). Agricultural Biotechnology, 6(1), 111-122. (in Farsi)
  38. Vali, N., Edriss, MA & Rahmani HR. (2005) Genetic parameters of body and some carcass traits in two quail strains. International Journal of Poultry Science, 4(5), 296-300.
  39. Wakasugi, N. (1984). Japanese quail. In: Evolution of Domesticated Animals (Ed. by I.L. Mason), pp. 319–21. Longman, London.
  40. Zhan, A., Bao, Z., Lu, W., Hu, X., Peng, W., Wang & M., Hu, J. (2007). Development and characterization of 45 novel microsatellite markers for sea cucumber (apostichopus japonicus). Molecular Ecology, Notes 7, 1345-1348.
  41. Zhou, H., Deeb, N., Evock-Clover, CM., Ashwell, CM. & Lamont, SJ. (2006). Genome-wide linkage analysis to identify chromosomal regions affecting phenotypic traits in the chicken. II. Body composition. Poultry Science, 85, 1712-1721.
 

آمار
تعداد مشاهده مقاله: 1,879
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 680


سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب