تشخیص سریع کوی هرپس ویروس (CyHV-3) به روش تکثیر همدما به واسطه حلقه (LAMP) و مقایسه با PCR PCR | ||
| شیلات | ||
| دوره 75، شماره 4، پاییز 1401، صفحه 565-580 اصل مقاله (985.23 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jfisheries.2022.345426.1337 | ||
| نویسندگان | ||
| میثم باورصاد1؛ امیر عابد علم دوست* 2؛ محمد رضا تابنده3؛ حمید فرحمند4؛ علیرضا میرواقفی4؛ مجتبی علیشاهی5 | ||
| 1دانشجوی دکتری گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 2استادیار گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 3استادیارگروه علوم پایه، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران | ||
| 4. استاد گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 5استاد گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران | ||
| چکیده | ||
| هرپس ویروس نوع 3 کپورماهیان (CyHV-3) یا کوی هرپسویروس (KHV)، یک ویروس نوظهور به شدت مسری و با حدت بالا است که سبب ایجاد تلفات سنگین و ناگهانی در ماهی کپور معمولی و کوی و هیبریدهای آنها میشود. روش LAMP یک تکنیک مولکولی مبتنی بر تکثیر بسیار اختصاصی اسید نوکلئیک اجرام پاتوژن در شرایط همدما و بدون نیاز به تجهیزات گرانقیمت میباشد که در سالهای اخیر به منظور تشخیص پاتوژنهای انسان و حیوانات توسعه یافته است. با توجه به اهمیت تشخیص سریع بیماری کوی هرپسویروس در مزارع مشکوک به آلودگی و پایش دایمی مزارع پرورش کپورماهیان کشور، این مطالعه با هدف ارزیابی روش تلفیقی LAMP با پروبهای نانوطلا در تشخیص سریع این ویروس صورت گرفت. در این مطالعه با استفاده از 6 آغازگر اختصاصی، بخشی از ژن تیمیدین کیناز (TK) کوی هرپسویروس با روش بهینه شده LAMP، تکثیر و برای تشخیص رقتهای مختلف DNA ژنومیک و DNA در نمونههای بافتی کپور معمولی، آزمایش اختصاصیت و حساسیت مورد بررسی قرار گرفت و آزمایش سرعت و حساسیت نسبت به روش PCR معمولی نیز مقایسه گردید. نتایج بیانگر اختصاصی بودن صد درصدی و حساسیت تشخیص بر اساس رقت استوک 8-10 معادل 25/1 فمتوگرم در میکرولیتر برای DNA ژنومیک ویروس و 7-10 معادل 2/8 فمتوگرم در میکرولیتر برای DNA ویروسی آمیخته شده در نمونه بافتی بود. همچنین بر اساس نتایج حاصله، روش LAMP پیشنهادی در مقایسه با PCR معمولی سه برابر سریعتر و 8000 برابر دقیقتر بود. با توجه به کارایی بالا، روش LAMP میتواند به عنوان یک ابزار قدرتمند و دقیق و سریع جهت شناسایی مولکولی کوی هرپسویروس در آزمایشگاههای تشخیصی با تجهیزات اندک مورد استفاده قرار گیرد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| هرپس ویروس نوع 3 کپورماهیان؛ LAMP؛ PCR؛ تشخیص سریع؛ تکثیر همدما؛ تیمیدین کیناز | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,080 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 631 |
||