تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,495 |
تعداد مقالات | 70,191 |
تعداد مشاهده مقاله | 123,353,531 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 96,574,034 |
Plasmid Profile and Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR Characterization of Salmonella Infantis Isolates Recovered From Poultry Sources | ||
Iranian Journal of Veterinary Medicine | ||
مقاله 3، دوره 17، شماره 1، فروردین 2023، صفحه 27-36 اصل مقاله (1.21 M) | ||
نوع مقاله: Infectious agents- Diseases | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijvm.17.1.1005073 | ||
نویسندگان | ||
Seyed Mostafa Peighambari* 1؛ Azam Yazdani1؛ Hanieh Taheri1؛ Fereshteh Shahcheraghi2 | ||
1Department of Avian Diseases Faculty of Veterinary Medicine University of Tehran Tehran, Iran | ||
2Department of Bacteriology, Microbiology Centre, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran | ||
چکیده | ||
Background: Salmonella is known as one of the most important bacterial agents infecting both humans and animals. Salmonella Infantis has been reported as one of the 15 most prevalent serovars worldwide. Despite its clinical importance, there is little information on the molecular characteristics of S. Infantis in Iran. Objectives: This study was conducted to characterize S. Infantis isolates collected from poultry sources in the last decade. The isolates were typified by plasmid profile and enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR). Methods: Forty S. Infantis isolates from poultry sources were subjected to plasmid profile and ERIC-PCR characterization. We used a commercial plasmid extraction kit to extract and purify plasmid DNA which then was separated by gel electrophoresis and viewed under a UV transilluminator. For ERIC-PCR, a commercial bacterial chromosomal DNA extraction kit was used. In this study, we chose ERIC2 primer for the ERIC-PCR test. Results: The plasmid profile revealed that 35% of isolates did not contain any plasmids, but the rest (65%) carried a variable number of plasmids with different molecular weights. Six plasmid profiles were found among 40 S. Infantis isolates. Using ERIC2 primer, 7 profiles were found among 40 S. Infantis isolates in ERIC-PCR. Bands with molecular weights ranging from 400 to 3000 bp were observed. Conclusion: This study provided some genetic data on S. Infantis isolates recovered from poultry sources, and these data can be used for a broader epidemiological study nationwide. These findings showed that although plasmid and ERIC profiles are valuable in epidemiological studies, they have some limitations, too. | ||
کلیدواژهها | ||
Epidemiological study؛ Enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC)-PCR؛ Molecular typing؛ Plasmid profile؛ Salmonellosis | ||
عنوان مقاله [English] | ||
مطالعه خصوصیات جدایههای سالمونلا اینفنتیس بدست آمده از منابع طیوری با استفاده از تعیین الگوی پلاسمیدی و ERIC-PCR | ||
نویسندگان [English] | ||
سید مصطفی پیغمبری1؛ اعظم یزدانی1؛ هانیه طاهری1؛ فرشته شاهچراغی2 | ||
1گروه بیماریهای طیور، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران، تهران، ایران | ||
2گروه میکروبشناسی، مرکز میکروب شناسی، موسسه پاستور ایران، تهران، ایران. | ||
چکیده [English] | ||
زمینه مطالعه: سالمونلا به عنوان یکی از مهمترین عوامل باکتریایی که هم انسان و هم حیوانات را آلوده مینماید، شناخته شده است. سالمونلا اینفنتیس به عنوان یکی از 15 سرووار شایع سالمونلا در سراسر جهان گزارش شده است. علیرغم اهمیت بالینی آن، اطلاعات محدودی مورد ویژگی های سالمونلا اینفنتیس در ایران موجود است. هدف: هدف از این مطالعه بیشتر دستهبندی نمودن سالمونلا اینفنتیس جدا شده از گله های مختلف در ایران در دهه گذشته با استفاده از تکنیکهای تعیین محتوی پلاسمیدی و ERIC-PCR بود. روش کار: تعداد 40 جدایه سالمونلا اینفنتیس، از منبع مختلف مرتبط با طیور در ایران، با استفاده از تکنیکهای تعیین محتوی پلاسمیدی و ERIC-PCR مورد مطالعه قرار گرفتند. یک کیت تجاری استخراج پلاسمید برای استخراج و خالص سازی پلاسمید از جدایه ها مورد استفاده قرار گرفت. سپس، پلاسمیدها با ژل الکتروفورز از هم جدا شدند و با اشعه ماوراء بنفش در یک دستگاه ترانس ایلومیناتور مشاهده شدند. برای انجام ERIC-PCR، کیت تجاری استخراج DNA کروموزومی مورد استفاده قرار گرفت. نتایج: از پرایمر ERIC2 برای ازمایش ERIC-PCR استفاده شد. تعیین محتوی پلاسمیدی جدایه ها مشخص نمود که 35% جدایهها فاقد پلاسمید بودند و 65% بقیه دارای تعداد متنوعی پلاسمید در اوزان ملکولی متفاوت بودند. با استفاده از آغازگر ERIC2 تعداد هفت الگو در بین 40 جدایه سالمونلا اینفنتیس مورد آزمایش در ERIC-PCR مشاهده شد. باندهای با دامنه وزنی بین 400 تا 3000 جفت باز مشاهده شدند. نتیجهگیری نهایی: این مطالعه برخی از داده های ژنتیکی در مورد جدایه های سالمونلا اینفنتیس با منشاء طیوری را ارائه داده است. این دادهها را می توان برای یک مطالعه اپیدمیولوژیک گسترده تر در سراسر کشور مورد استفاده قرار داد. این یافته ها نشان داد که هر دو روش تعیین پروفایل پلاسمیدی و ERIC در مطالعات اپیدمیولوژیک با ارزش هستند، اما برخی از محدودیت ها را نیز دارا میباشند. | ||
کلیدواژهها [English] | ||
پروفایل پلاسمیدی, تایپینگ ملکولی, سالمونلوز, مطالعه اپیدمیولوژیک, ERIC-PCR | ||
اصل مقاله | ||
1. Introduction
| ||
مراجع | ||
Abbasoglu, D., & Akcelık, M. (2011). Phenotypic and genetic characterization of multidrug-resistant Salmonella Infantis strains isolated from broiler chicken meats in Turkey. Biologia, 66(3), 406-410. [Link] Almeida, F., Pitondo-Silva, A., Oliveira, M. A., & Falcão, J. P. (2013). Molecular epidemiology and virulence markers of Salmonella Infantis isolated over 25 years in São Paulo State, Brazil. Infection, Genetics and Evolution : Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics In Infectious Diseases, 19, 145–151. [PMID] [DOI:10.1016/j.meegid.2013.07.004] Alzwghaibi, A. B., Yahyaraeyat, R., Fasaei, B. N., Langeroudi, A. G., & Salehi, T. Z. (2018). Rapid molecular identification and differentiation of common Salmonella serovars isolated from poultry, domestic animals and foodstuff using multiplex PCR assay. Archives of Microbiology, 200(7), 1009–1016.[DOI:10.1007/s00203-018-1501-7] [PMID] Anonymous. (2018). Findings from the global burden of disease study, 2017. Seattle: Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME); 2018. [Link] Crump, J. A., Sjölund-Karlsson, M., Gordon, M. A., & Parry, C. M. (2015). Epidemiology, clinical presentation, laboratory diagnosis, antimicrobial resistance, and antimicrobial management of invasive Salmonella infections. Clinical Microbiology Reviews, 28(4), 901-937. [PMID] [PMCID] Emadi, C. S., Hasanzadeh, M., Bozorg, M. M., & Mirzaei, S. (2009). Characterization of the Salmonella isolates from backyard chickens in north of Iran, by serotyping, multiplex PCR and antibiotic resistance analysis. Archives of Razi Institute, 64(2), 77-83. [Link] Fendri, I., Ben Hassena, A., Grosset, N., Barkallah, M., Khannous, L., & Chuat, V., et al (2013). Genetic diversity of food-isolated Salmonella strains through pulsed field gel electrophoresis (PFGE) and enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR). PloS one, 8(12), e81315. [PMID] [PMCID] Ferrari, R. G., Rosario, D., Cunha-Neto, A., Mano, S. B., Figueiredo, E., & Conte-Junior, C. A. (2019). Worldwide epidemiology of Salmonella serovars in animal-based foods: A Meta-analysis. Applied and Environmental Microbiology, 85(14), e00591-19. [PMID] [PMCID] Galanis, E., Lo Fo Wong, D. M., Patrick, M. E., Binsztein, N., Cieslik, A., & Chalermchikit, T., et al. (2006). Web-based surveillance and global Salmonella distribution, 2000-2002. Emerging Infectious Diseases, 12(3), 381-388. [DOI:10.3201/eid1203.050854] [PMID] [PMCID] Gast, R. K., Porter, Jr., R. E. (2020). Salmonella infections. In: Diseases of poultry. Swayne, D. E., Boulianne, M., Logue, C.M., McDougald, L.R., Nair, V., Suarez, D. L. John Wiley & Sons, Inc., NJ, USA. p. 719-753. Ghoddusi, A., Nayeri Fasaei, B., Karimi, V., Ashrafi Tamai, I., Moulana, Z., & Zahraei Salehi, T. (2015). Molecular identification of Salmonella Infantis isolated from backyard chickens and detection of their resistance genes by PCR. Iranian Journal of Veterinary Research, 16(3), 293-297. [PMID] Ghoddusi, A., Nayeri Fasaei, B., Zahraei Salehi, T., & Akbarein, H. (2019). Serotype distribution and antimicrobial resistance of Salmonella isolates in human, chicken, and cattle in Iran. Archives of Razi Institute, 74(3), 259-266. [PMID] Golab, N., Khaki, P., & Noorbakhsh, F. (2014). Molecular typing of Salmonella isolates in poultry by pulsed-field gel electrophoresis in Iran. International Journal of Enteric Pathogens, 2(4):e21485. [DOI:10.17795/ijep21485] Jajere, S. M. (2019). A review of Salmonella enterica with particular focus on the pathogenicity and virulence factors, host specificity and antimicrobial resistance including multidrug resistance. Veterinary World, 12(4), 504–521. [PMID] [PMCID] Johnson, J. R., Clabots, C., Azar, M., Boxrud, D. J., Besser, J. M., & Thurn, J. R. (2001). Molecular analysis of a hospital cafeteria-associated salmonellosis outbreak using modified repetitive element PCR fingerprinting. Journal of Clinical Microbiology, 39(10), 3452-3460. [PMID] [PMCID] Kariuki, S., Gordon, M. A., Feasey, N., & Parry, C. M. (2015). Antimicrobial resistance and management of invasive Salmonella disease. Vaccine, 33 (Suppl 3), C21-C29. [PMID] [PMCID] Lukinmaa, S., Nakari, U. M., Eklund, M., & Siitonen, A. (2004). Application of molecular genetic methods in diagnostics and epidemiology of food-borne bacterial pathogens. Apmis : Acta Pathologica, Microbiologica, et Immunologica Scandinavica, 112(11-12), 908-929. [PMID] Morshed, R., & Peighambari, S. M. (2010). Salmonella infections in poultry flocks in the vicinity of Tehran. International Journal of Veterinary Research, 4, 273-276. [Link] Mukherjee, S., Anderson, C. M., Mosci, R. E., Newton, D. W., Lephart, P., & Salimnia, H., et al. (2019). Increasing frequencies of antibiotic resistant non-typhoidal Salmonella infections in Michigan and risk factors for disease. Frontiers in Medicine, 6, 250. [PMID] [PMCID] Nógrády, N., Kardos, G., Bistyák, A., Turcsányi, I., Mészáros, J., & Galántai, Z., et al. (2008). Prevalence and characterization of Salmonella Infantis isolates originating from different points of the broiler chicken-human food chain in Hungary. International Journal of Food Microbiology, 127(1-2), 162-167. [PMID] Peighambari, S. M., Vaillancourt, J. P, Wilson, R. A., & Gyles, C. L. (1995) Characteristics of Escherichia coli isolates from avian cellulitis. Avian Diseases, 39, 116‑124. [PMID] Peighambari, S. M., Akbarian, R., Morshed, R., & Yazdani, A. (2013). Characterization of Salmonella isolates from poultry sources in Iran. Iranian. Iranian Journal of Veterinary Medicine , 7(1), 35-41. [Link] Peighambari, S. M., Sorahi Nobar, M., & Morshed, R. (2015). [Detection of Salmonella Enterica Serovar Infantis among serogroup C Salmonella isolates from poultry using PCR and determination of drug resistance patterns (Persian)]. Iranian Veterinary Journal, 11(2), 54-60. [DOI:10.22055/IVJ.2015.10112] Peighambari, S. M., Morshed, R., Baziar, M., Sharifi, A., & Sadrzadeh. A. (2018). [Salmonellosis in broiler flocks of Golestan province: frequency, serogroups and antimicrobial resistance patterns of Salmonella isolates (Persian)]. New Findings in Veterinary Microbiology, 1(1), 70-78. [Link] Peighambari, S. M., Morshed, R., Shojadoost, B., Nikpiran, H., Haghbin Nazarpak, H., & Khakpour, M., et al. (2019a). [Survey of non-typhoid Salmonella infections among some broiler flocks of Mazandaran and Gilan provinces, 2010-2015 (Persian)]. Iranian Journal of Veterinary Clinical Sciences, 12(2), 69-80. [Link] Peighambari, S. M., Qorbaniun, E., Morshed, R., & Haghbin Nazarpak, H. (2019b). [A survey on Salmonella infection in broiler farms around Mashhad city: Determination of serogroups and antimicrobial resistance pattern of the Salmonella isolates (Persian)]. Iranian Veterinary Journal, 15(1), 34-43. [Link] Rahmani, M., Peighambari, S. M., Svendsen, C. A., Cavaco, L. M., Agersø, Y., & Hendriksen, R. S. (2013). Molecular clonality and antimicrobial resistance in Salmonella enterica Serovars Enteritidis and Infantis from broilers in three Northern regions of Iran. BMC Veterinary Research, 9, 66. [PMID] [PMCID] Ranjbar, R., Mirzaie, A., Sadeghifard, N., & Jonaidi, N. (2014). [Molecular typing of Salmonella Infantis clinical strains isolated in Tehran (Persian)]. Journal of Military Medicine, 16(1), 17-22. [Link] Rašeta, M., Teodorović, V., Bunčić, O., Katić, V., Branković Lazić, I., & Polaček, V., et al. (2014). Antibiotic resistance and molecular studies on Salmonella enterica subspecies Enterica Serovar Infantis isolated in human cases and broiler carcasses. Acta Veterinaria, 64(2), 257-268. [DOI:10.2478/acve-2014-0024] Shah, D. H., Paul, N. C., Sischo, W. C., Crespo, R., & Guard, J. (2017). Population dynamics and antimicrobial resistance of the most prevalent poultry-associated Salmonella serotypes. Poultry Science, 96(3), 687-702. [PMID] Ungvári, A., Kardos, G., Nógrády, N. O. É. M. I., Turcsányi, I. B. O. L. Y. A., Pászti, J. U. D. I. T., & Kiss, I., et al. (2007). DNA-fingerprinting and pulsed-field gel electrophoresis of Salmonella Enterica Serotype Infantis strains isolated from poultry. Lucrări Ştiinłifice Medicină Veterinară, 40, 182-186. [Link] Versalovic, J., Koeuth, T., Lupski, R. (1991). Distribution of repetitive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes. Nucleic Acids Research, 19(24), 6823–6831. [PMID] [PMCID] | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,014 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 889 |