پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 162 |
| تعداد شماره‌ها | 6,694 |
| تعداد مقالات | 72,250 |
| تعداد مشاهده مقاله | 129,267,586 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 102,110,775 |
بررسی چندشکلی ژن TNF-alpha و تأثیر آن در اندازۀ دنبه و چربی در گوسفندان نژاد ماکویی، قزل و رومانوف | ||
| علمی- ترویجی (حرفه‌ای) دامِستیک | ||
| دوره 24، شماره 1 - شماره پیاپی 28، خرداد 1403، صفحه 39-46 اصل مقاله (1.56 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی- ترویجی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/domesticsj.2024.372764.1147 | ||
| نویسندگان | ||
| دانیال نیکزاد* 1؛ مجید کریمی1؛ علی هاشمی2؛ مختار غفاری2 | ||
| 1دانشجوی کارشناسی‌ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام و طیور، گروه مهندسی علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه، آذربایجان غربی، ارومیه، ایران | ||
| 2دانشیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام و طیور، گروه مهندسی علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه، آذربایجان غربی، ارومیه، ایران | ||
| چکیده | ||
| عامل نکروز تومور آلفا (TNF-alpha) یک سیتوکین پیش التهابی است که در تنظیم پاسخ ایمنی از جمله فعالیت ماکروفاژها و مرگ سلولی از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. تحقیق حاضر به منظور بررسی وجود چندشکلی یا عدم وجود چندشکلی در گوسفندان نژاد قزل، ماکویی و رومانوف با استفاده از روش واکنش زنجیره‌ایی پلیمراز (PCR) و تفاوت فرم فضائی رشته‌های منفرد (SSCP) انجام گرفت. برای این منظور برای تعیین چندشکلی ژن TNF-alpha در جمعیت گوسفندان نژاد ماکویی، قزل و رومانوف، از تعداد 50 رأس از گوسفندان نژاد ماکویی، 50 رأس از گوسفندان نژاد قزل و 50 رأس از گوسفندان نژاد رومانوف خون‌گیری شد. برای استخراج DNA از روش بهینه یافته نمکی استفاده شد. کیفیت DNA با استفاده از ژل آگارز یک درصد و کمیّت آن با دستگاه اسپکتروفتومتری مورد بررسی قرار گرفت. از دستگاه ترموسایکلر به منظور تکثیر قطعهای از ژن TNF-alpha استفاده شد. واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 273 جفت بازی اگزون شماره 4 ژن TNF-alpha انجام گرفت. تعیین ژنوتیپ بر روی ژل پلی‌آکریل‌آمید 12 درصد صورت گرفت و نمونه‌ها در دستگاه ترموسایکلر قرار داده شد، در نهایت آن‌ها را در ژل پلی‌آکریل‌آمیدی که در دستگاه الکتروفورز عمودی جای گذاری گردیده، قرارگرفت. مرحله ظهور و رنگ آمیزی به وسیله محلول نیترات نقره انجام گرفت. تحلیل و بررسی الگوهای ژنی مشاهده شده در ژن TNF-alpha بر روی آکریل‌آمید نشان داد که الگوهای ایجاد شده در نژاد قزل، رومانوف و ماکویی تک شکل بوده، که نشان‌دهندۀ عدم وجود چندشکلی در این جایگاه می‌باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| چندشکلی؛ چربی و دنبه؛ ژن TNF-alpha؛ PCR-SSCP | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Investigating polymorphism of TNF-alpha genes and their effect on tail fat trait in Makoi, Qezel and Romanov sheep | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Daniel Nikzad1؛ Majid Karimi1؛ Ali Hashemi2؛ Mokhtar Ghaffari2 | ||
| 1M.Sc. Student of Animal and Poultry Breeding & Genetics, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture at the Urmia University, West Azerbaijan, Urmia, Iran | ||
| 2Associate Professor of Animal and Poultry Breeding & Genetics, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture at the Urmia University, West Azerbaijan, Urmia, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha) is a pro-inflammatory cytokine that is particularly important in regulating the immune response, including macrophage activity and cell death. The present research was conducted in order to investigate the presence or absence of polymorphism in Qezel, Makoi and Romanov sheep by using the polymerase chain reaction (PCR) method and the spatial form difference of single strands (SSCP). For this purpose, to determine the TNF-ALPHA gene polymorphism in Makoi, Qezel and Romanov sheep population, blood was taken from 50 Makoi sheep, 50 Qezel sheep and 50 Romanov sheep. An optimized saline method was used for DNA extraction. The quality of DNA was checked using 1% agarose gel and its quantity was checked with a spectrophotometer. A thermocycler was used to amplify a fragment of the TNF-alpha gene. Polymerase chain reaction was performed to amplify the 273 bp fragment of exon number 4 of TNF-alpha gene. Genotyping was done on a 12% polyacrylamide gel and the samples were placed in a thermocycler, finally they were placed in a polyacrylamide gel placed in a vertical electrophoresis machine. The appearance and coloring stage was done by silver nitrate solution. The analysis and analysis of the gene patterns observed in the TNF-alpha gene on acrylamide showed that the patterns created in Qezel, Romanov and Makoi breeds were monomorphic, which indicates the absence of polymorphism in this locus. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Fat and tail, PCR-SSCP, Polymorphism, TNF-alpha gene | ||
| مراجع | ||
|
بزازپریخانی، ا.، صادقی، م.، و مرادی شهربابک. ح. (1396). "ارتباط چندشکلی های اگزون 2 ژن فاکتور رونویسی 7 با صفات چربی خون و دنبه در گوسفندان لری بختیاری و زل." پژوهش‌های تولیدات دامی، 8(17)، 88-92. بیابانی، پ.، هاشمی، ع.، خاکپور، ک.، پوربایرامیان، ف. و برومند، ج. (1391). "بررسی تنوع آللی ژن فاکتور نکروز تومور آلفا (TNF-alpha) در گوسفند نژاد ماکویی." پنجمین کنگره علوم دامی، شهریور (1391). زارع، م.، صادقی، م.، و مرادی شهر بابک م. (1395). "شناسایی چندشکلی‌های تک‌نوکلئوتیدی ژن PPP2CA و اثر آن بر صفات لاشه، رشد و ذخیره چربی در گوسفندان لری‌بختیاری و زل." تحقیقات تولیدات دامی، 5(4)، 70-78. زمانی افشار، س.، هرکی نژاد، ط.، بهاری، ع.، و شهیر، م.ح. (1397). "بررسی چندشکلی ژن‌های Wnt10a و Wnt10b در گوسفند آمیخته افشاری برولامرینو." تولیدات دامی، 20(2)، 213-224. سیّد شریفی، ر.، بادبرین، ن.، بهمنی، ا.، و مجتهدین. ع. (1396). "بررسی چند شکلی ژن GDF9 در گوسفند قره گل و ارتباط آن با چند قلوزایی." فیزیولوژی و تکوین جانوری، 10، 23-29. هدایتی‌فر، ر. (1396). "بررسی میزان ایزومرهای ترانس و درصد اسیدهای چرب در روغن‌های حیوانی و دنبه مصرفی در استان لرستان." مجله علمی پژوهشی یافته، 19(2)، 1-8. Alvarez-Busto, J., Ruiz-Nuñez, A., Mazon, L.I., and Jugo, B.M. (2004). "Detection of polymorphisms in the tumour necrosis factor alpha candidate gene in sheep." European Journal of Immunogenetics, 31(4), 155-158. Bakhtiarizadeh, M.R., and Alamouti, A.A. (2020). "RNA-Seq based genetic variant discovery provides new insights into controlling fat deposition in the tail of sheep." Scientific Reports, 10(1), 13525. Chessa, B., Pereira, F., Arnaud, F., Amorim, A., Goyache, F., and et al. (2009). "Revealing the history of sheep domestication using retrovirus integrations." Science, 324(5926), 532-536. Cheng, S., Fockler, C., Barnes, W.M., and Higuchi, R. (1994). "Effective amplification of long targets from cloned inserts and human genomic DNA." Proceedings of the National Academy of Sciences, 91(12), 5695-5699. Goto, R.M., Afanassieff, M., Ha, J., Iglesias, G.M., Ewald, S.J., and et al. (2002). "Single-strand conformation polymorphism (SSCP) assays for major histocompatibility complex B genotyping in chickens." Poultry Science, 81(12), 1832-1841. Kabeya, H., Ohashi, K., and Onuma, M. (2001). "Host immune responses in the course of bovine leukemia virus infection." Journal of Veterinary Medical Science, 63(7), 703-708. do Prado Paim, T., dos Santos, C.A., de Faria, D.A., Paiva, S.R., and McManus, C. (2022). "Genomic selection signatures in Brazilian sheep breeds reared in a tropical environment." Livestock Science, 258, 104865. Erlich, H.A. (1989). "PCR Technology." Stockton Press, New York. Flamant, J.C. (1998). "The impact of socio-economic aspects on the development and outcome of animal recording systems." ICAR Technical Series, 1, 267-318. Hiendleder, S., Mainz, K., Plante, Y., and Lewalski, H. (1998). "Analysis of mitochondrial DNA indicates that domestic sheep are derived from two different ancestral maternal sources: no evidence for contributions from urial and argali sheep." Journal of Heredity, 89(2), 113-120. Jang, D.I., Lee, A.H., Shin, H.Y., Song, H.R., Park, J.H., and et al. (2021). "The role of tumor necrosis factor alpha (TNF-α) in autoimmune disease and current TNF-α inhibitors in therapeutics." International Journal of Molecular Sciences, 22(5), 2719. Moradi, M.H., Nejati-Javaremi, A., Moradi-Shahrbabak, M., Dodds, K.G., Brauning, R. and et al. (2021). "Fine mapping of candidate regions associated with fat deposition in thin and fat tail sheep breeds suggests new insights into molecular aspects of fat tail selection." McRae, K.M., McEwan, J.C., Dodds, K.G., and Gemmell, N.J. (2014). "Signatures of selection in sheep bred for resistance or susceptibility to gastrointestinal nematodes." BMC Genomics, 15, 1-13. Negahdary, M., Majdi, S., Biabani, P., and Hajihosseinlo, A. (2014). "Relationship of TNF-α Gene Polymorphism with fat‐tail measurements (fat-tail dimensions) and wool weights in fat-tail Makooei breed of Iranian sheep." Journal of Biology and Today's World, 3(4), 77-82. Orita, M., Iwahana, H., Kanazawa, H., Hayashi, K., and Sekiya, T. (1989). "Detection of polymorphisms of human DNA by gel electrophoresis as single-strand conformation polymorphisms." Proceedings of the National Academy of Sciences, 86(8), 2766-2770. Postal, M., and Appenzeller, S. (2011). "The role of tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) in the pathogenesis of systemic lupus erythematosus." Cytokine, 56(3), 537-543. Williams, T.L., Monday, S.R., Feng, P.C., and Musser, S.M. (2005). "Identifying new PCR targets for pathogenic bacteria using top-down LC/MS protein discovery." Journal of Biomolecular Techniques: JBT, 16(2), 134. Zhao, F., Deng, T., Shi, L., Wang, W., Zhang, Q., and et al. (2020). "Genomic scan for selection signature reveals fat deposition in Chinese indigenous sheep with extreme tail types." Animals, 10(5), 773. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 142 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 37 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب