سامانه پشتیبانی خدمات اطلاعات

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات163
تعداد شماره‌ها6,823
تعداد مقالات73,545
تعداد مشاهده مقاله134,620,095
تعداد دریافت فایل اصل مقاله105,170,757
عبداللهی, محسن, مرادی, محمدحسین, خلت آبادی فراهانی, امیرحسین, محمدی, حسین. (1404). پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی. , (), -. doi: 10.22059/ijas.2025.386966.654049
محسن عبداللهی; محمدحسین مرادی; امیرحسین خلت آبادی فراهانی; حسین محمدی. "پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی". , , , 1404, -. doi: 10.22059/ijas.2025.386966.654049
عبداللهی, محسن, مرادی, محمدحسین, خلت آبادی فراهانی, امیرحسین, محمدی, حسین. (1404). 'پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی', , (), pp. -. doi: 10.22059/ijas.2025.386966.654049
عبداللهی, محسن, مرادی, محمدحسین, خلت آبادی فراهانی, امیرحسین, محمدی, حسین. پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی. , 1404; (): -. doi: 10.22059/ijas.2025.386966.654049

پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژن های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی

علوم دامی ایران
مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 26 فروردین 1404    اصل مقاله (1023 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2025.386966.654049
نویسندگان
محسن عبداللهی؛ محمدحسین مرادی* ؛ امیرحسین خلت آبادی فراهانی؛ حسین محمدی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک، اراک، ایران
چکیده
پژوهش حاضر به منظور مطالعه پویش پیوستگی ژنومی جهت شناسایی ژن‌های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی‌سازی مجموعه‌های ژنی انجام شده است. به این منظور از اطلاعات مجموع، 1355 رأس گاو هلشتاین (685 حیوان بیمار و 670 حیوان شاهد) از 178 گله استفاده شد که پس از انجام مراحل مختلف کنترل کیفیت، اطلاعات ژنوتیپی 592 نمونه گاو بیمار و 559 نمونه گاو سالم در آنالیزهای نهایی استفاده شدند. تعیین ژنوتیپ این حیوانات با استفاده از تراشه‌های ژنومیIllumina BovineHD 700k BeadChip برای 727252 جایگاه نشانگری SNP انجام شد. پویش پیوستگی ژنومی (GWAS) با استفاده از مدل‌های خطی مختلط لجستیک مورد بررسی قرار گرفت و مناطقی از ژنوم که در سطح 05/0 با بیماری سل گاوی در ارتباط بودند به منظور شناسایی ژن‌های کاندیدا و مسیرهای زیستی مرتبط با مقاومت به بیماری سل گاوی بر پایه آنالیز غنی‌سازی مجموعه‌های ژنی استفاده شد. نتایج این تحقیق در نهایت منجر به شناسایی مسیرهایی شد که به طور معنی‌داری با بیماری سل گاوی در ارتباط بودند. بررسی این مسیرها نشان داد که اغلب آنها با سیستم ایمنی، کنترل استرس و مقاومت در برابر بیماری‌ها در ارتباط هستند. همچنین ارزیابی عملکرد ژن‌های موجود در این مسیرها نشان داد که ارتباط مستقیم یا غیر مستقیم برخی از این ژن‌ها مانند HSPD1، BCL6، KCNMA1، SPP1، CD24، CD80، MYO1B، CCL20، SLC11A1، LCP2 و SLC2A2 با مقاومت به بیماری‌ها و سل گاوی در تحقیقات گذشته نیز تأیید شده است.
کلیدواژه‌ها
پویش کل ژنومی؛ غنی سازی مجموعه ژنی؛ سل گاوی؛ گاو شیری هلشتاین
عنوان مقاله [English]
Genome-wide association study to identify genes and biological pathways related to resistance to bovine tuberculosis based on gene set enrichment analysis
نویسندگان [English]
Mohsen Abdollahi؛ Mohammad Hossein Moradi؛ Amir Hossein Khaltabadi Farahani؛ Hossein Mohammadi
Department of Animal Science, Faculty of Agriculture and Natural Resources, Arak University, Arak, Iran.
چکیده [English]
The aim of the present study was to conduct a genome-wide association study (GWAS) to identify the genes and biological pathways related to resistance to bovine tuberculosis based on gene set enrichment analysis. In total, the information of 1355 cows (consisting 685 cases and 670 controls) from 178 herds were used, of which 592 cases and 559 controls (healthy cows) were passed different quality control steps. These animals were genotyped by using Illumina BovineHD 700k BeadChip for 727252 SNP markers. Genome-wide association study (GWAS) was investigated using mixed linear logistic models, and regions of the genome that were associated with bovine tuberculosis at the 0.05 level were used for identifying the candida genes and biological pathways associated with bovine tuberculosis based on gene set enrichment analysis. The results of this study finally led to the identification of the pathways that were significantly associated with bovine tuberculosis. Further investigation of these pathways showed that most of them are related to the immune system, stress and disease resistance. Also, study of function of the genes that were located in these pathways revealed that some of these genes such as HSPD1, BCL6, KCNMA1, SPP1, CD24, CD80, MYO1B, CCL20, SLC11A1, LCP2 and SLC2A2, have also been confirmed to be directly or indirectly associated with disease resistance and bovine tuberculosis in previous studies.
کلیدواژه‌ها [English]
Genome-wide association study (GWAS), Gene set enrichment, Bovine Tuberculosis, Holstein dairy cattle
مراجع
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 113
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 65





سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب