پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 163 |
| تعداد شماره‌ها | 6,711 |
| تعداد مقالات | 72,498 |
| تعداد مشاهده مقاله | 130,319,878 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 102,774,345 |
تجزیه و تحلیل تلفیقی و مقایسه‌ای پروفایل رونویسی و شبکه‌های تنظیمی RNA درون‌زای رقابتی به منظور شناسایی ژن‌های کلیدی مرتبط با تنش حرارتی در جوجه‌های گوشتی | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 26 فروردین 1404 اصل مقاله (1.21 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2025.391124.654061 | ||
| نویسندگان | ||
| فائزه حصاری1؛ مصطفی صادقی* 2؛ سیدرضا میرائی آشتیانی1؛ فرزاد غفوری1 | ||
| 1گروه مهندسی علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران. | ||
| 2نویسنده مسئول، گروه مهندسی علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران. | ||
| چکیده | ||
| در حال حاضر، جوجه‌های گوشتی امروزی نسبت به گرما حساس هستند، به‌گونه‌ای که مواجه با دمای بالا می‌تواند آثار زیان‌باری روی رفاه و عملکرد تولیدی آن‌ها داشته باشد. در این راستا، هدف از پژوهش حاضر، ادغام تجزیه و تحلیل پروفایل‌های رونویسی و استفاده مرور منابع پیشین به‌همراه با تجزیه شبکه تنظیمی RNA درون‌زای رقابتی برای شناسایی RNAهای پیام‌رسان کلیدی و RNAهای غیرکدکنندۀ دخیل در تنظیم مولکولی سلول‌های بافت غدۀ هیپوفیز و بافت قشری مغز برای تنش حرارتی در جوجه‌های گوشتی بود. بدین منظور، در مجموع، 2 lncRNA، 11 miRNA و 426 mRNA ژن مشترک دارای تفاوت بیان معنی‌دار بین دو بافت شناسایی شدند. در این راستا خروجی تجزیه‌و‌تحلیل‌ها، 12 ژن هاب (HSP90AA1، HSPA5، HSP90B1، HSPA4، HYOU1، AHSA2، ALB، DNAJA1، DNAJA4، DNAJB4، HSPA4L و HSPH1) شناسایی و معرفی شدند که از نظر بیانی این ژن‌ها در جوجه‌های گوشتی تحت تنش حرارتی در مقایسه با جوجه‌های گوشتی گروه کنترل، افزایش بیان از خود نشان داده بودند. علاوه بر این، پس از بازسازی شبکه تنظیمی RNA درون‌زا رقابتی و ماژول کاندیدای مرتبط، مسیرهای متابولیکی معنی‌دار شناسایی شده شامل تاشدن پروتئین به وسیله چپرون، سازماندهی اجزاء سلولی، اتصال پروتئین شوک حرارتی، کمپلکس چپرون شبکه آندوپلاسمی و مسیر سیگنالینگ پردازش پروتئین در شبکه آندوپلاسمی بودند. در نهایت با توجه به RNAهای شناسایی شدۀ دخیل در شبکه تنظیمی ceRNA که زمینه‌ساز تفاوت‌های فنوتیپی در شدت بروز تنش حرارتی هستند، این مطالعه می‌تواند زمینه‌ساز ارائۀ بینش جدیدی در مورد سازوکارهای تنظیم ژنی مرتبط با میزان شدت و مقاومت نسبت به تنش حرارتی در جوجه‌های گوشتی باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تنش حرارتی؛ ترانسکریپتوم؛ جوجه‌های گوشتی؛ ژن‌های هاب؛ شبکه تنظیمی درون‌زای رقابتی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Integrative and comparative analysis of transcriptional profiles and competitive endogenous RNA regulatory networks to identify key genes associated with heat stress in broiler chickens | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Faezeh Hesari1؛ Mostafa Sadeghi2؛ Seyed Reza Miraei-Ashtiani1؛ Farzad Ghafouri1 | ||
| 1Department of Animal Science, University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Alborz, Iran. | ||
| 2Corresponding Author, Department of Animal Science, University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Alborz, Iran. | ||
| چکیده [English] | ||
| Broilers are particularly sensitive to high ambient temperatures, which may have a negative impact on their welfare and production efficiency. The aim of the study was to combine a literature review analysis of transcriptional profiling and a competitive analysis of endogenous regulatory network (CERNA) to identify the key messenger and non-coding RNAs involved in the molecular regulation of the cells of the pituitary gland and the brain in heat stress broiler chickens. Overall, two long non-coding RNA, 11 microRNAs and 426 common mRNAs and genes were identified that showed significant differences in expression between the two tissues. From the analysis, 12 major genes (HSP90A1, HSPA5, HSP90B1, HSPA4, HUSY1, AHSA2, ALB, DNAJA1, DNAJA4, HSPA4L, and HSPH1) were found to be more extensively expressed in broiler chickens under heat stress than in control chickens. In addition, after reconstructing the competitive endogenous RNA regulatory network and the associated candidate modules, the main important metabolic signalling pathways identified were protein-folding chaperones, cellular component organisation, protein-binding to heat shock proteins, the endoplasmic reticulum chaperone complex, and protein-processing signalling pathways in the endoplasmic reticulum. Overall, considering the identified RNAs involved in the ceRNA regulatory network that underlie phenotypic differences in the severity of heat stress, this study may provide new insights into the molecular mechanisms underlying the control of heat stress severity and resistance in broiler chickens. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Broiler chickens, Competitive endogenous regulatory network, Heat stress, Hub genes, Transcriptome | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 52 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 40 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب