بررسی تحلیلی نقش miRNAهای شناسایی شده بر ژنهای هدف مرتبط با ورم پستان در گاوهای شیری | ||
| علوم دامی ایران | ||
| دوره 57، شماره 2، تابستان 1405، صفحه 213-232 اصل مقاله (2.62 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2025.398979.654091 | ||
| نویسنده | ||
| مصطفی قادری زفره ایی* | ||
| گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران. | ||
| چکیده | ||
| با توجه به اهمیت شناسایی زودهنگام و مدیریت مؤثر ورم پستان، پژوهش حاضر با رویکرد In silco به کنکاش نقش تعدادی از ریزRNAها یا miRNAها در بیماری زایی ورم پستان در ژنوم گاو می پردازد. در این پژوهش، انتخاب miRNAهای کاندید بر اساس یک سری معیار های چند مرحله ای انجام شد. در ابتدا، یک مرور نظاممند از پژوهش های پیشین که به طور تجربی (از طریق RNA-Seq، qPCR یا ریز آرایه DNA) بیان اختصاصی miRNAها را در نمونههای التهابی یا عفونی ورم پستان گاو گزارش کرده بودند، صورت گرفت. سپس، miRNAهایی که در حداقل دو پژوهش مستقل و یا در بیش از یک پایگاه داده معتبر(miRBase، NCBI GEO ،miRTarBase ) به عنوان miRNAهای دخیل در پاسخ التهابی یا ایمنی شناسایی شده بودند، مورد توجه قرار گرفتند. با استفاده از تحلیل های بیو انفورماتیکی و پایگاه های داده معتبری نظیر Mirtar Base، TargetScan، DAVID و NCBI، ژن های کاندید مرتبط با ورم پستان شناسایی و مسیرهای پیام دهی هدف آن ها مورد بررسی قرار گرفتند. این فرآیند انتخاب چند مرحله ای به منظور اطمینان از دقت و اعتبار miRNAهای انتخاب شده به کار گرفته شد. نتایج این تحلیل ها منجر به شناسایی پنج miRNA کلیدی شامل bta-mir-146a، bta-mir-16a، bta-mir-181، bta-mir-21-5p و bta-mir-223 گردید که هر یک در مسیرهای زیستی مهمی مانند TLR4/NF- κB، MAPK، PI3K-AKT، TGFβ و پیام دهی هورمونی استروژن و پروژسترون نقش دارند. همچنین، نتایج – بر اساس نمره context++ score ≤ –0.2 و conservation ≥ 0.7 - نشان دادند که bta-mir-146a، bta-mir-21-5p و bta-mir-223 به ترتیب بر 7، 9 و 11 پروتئین مهم در این مسیرهای زیستی تأثیر می گذارند. این مسیرها در تنظیم ژنی پاسخ ایمنی، التهاب، رشد، تمایز و مرگ سلولی مؤثر بودند که احتمالا اختلال در آنها می تواند منجر به بروز یا تشدید ورم پستان گردد. هر یک از این miRNAها با هدف قرار دادن چندین پروتئین کلیدی، می توانند به عنوان زیست نشانگرهای حساس و اختصاصی برای تشخیص زودهنگام ورم پستان گاو شیری مورد استفاده قرار گیرند. از آنجایی که این miRNAها در شیر و سرم خون نیز قابل شناسایی هستند، امکان طراحی آزمایش های غیر تهاجمی برای غربالگری و پایش سلامت دام فراهم می شود. این یافته ها شاید بتوانند به متخصصان دامپزشکی کمک کند تا با استفاده از آزمونهای مبتنی بر miRNA، ورم پستان را در مراحل اولیه شناسایی و درمان کنند و از گسترش بیماری و خسارات اقتصادی جلوگیری نمایند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| تنظیم ژنی؛ ریزRNAها؛ ژنوم گاو؛ ورم پستان | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 179 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 103 |
||