پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 127 |
| تعداد شمارهها | 7,150 |
| تعداد مقالات | 76,909 |
| تعداد مشاهده مقاله | 154,956,235 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 116,929,406 |
بررسی تحلیلی نقش miRNAهای شناسایی شده بر ژنهای هدف مرتبط با ورم پستان در گاوهای شیری | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 14 دی 1404 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2025.398979.654091 | ||
| نویسنده | ||
| مصطفی قادری زفره ایی* | ||
| گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج | ||
| چکیده | ||
| در این پژوهش، انتخاب miRNAهای کاندید بر اساس یک سری معیارهای چندمرحلهای انجام شد. در ابتدا، یک مرور نظاممند از پژوهشهای پیشین که بهطور تجربی (از طریق RNA-Seq، qPCR یا ریزآرایه DNA) بیان اختصاصی miRNAها را در نمونههای التهابی یا عفونی ورم پستان گاو گزارش کرده بودند، صورت گرفت. سپس، miRNAهایی که در حداقل دو پژوهش مستقل و یا در بیش از یک پایگاه داده معتبر(miRBase، NCBI GEO ،miRTarBase) به عنوان miRNAهای دخیل در پاسخ التهابی یا ایمنی شناسایی شده بودند، مورد توجه قرار گرفتند. با استفاده از تحلیلهای بیوانفورماتیکی و پایگاههای داده معتبری نظیر MirtarBase، TargetScan، DAVID و NCBI، ژنهای کاندید مرتبط با ورم پستان شناسایی و مسیرهای پیامدهی هدف آنها مورد بررسی قرار گرفتند. این فرآیند انتخاب چندمرحلهای بهمنظور اطمینان از دقت و اعتبار miRNAهای انتخاب شده بهکار گرفته شد. نتایج این تحلیلها منجر به شناسایی پنج miRNA کلیدی شامل bta-mir-146a، bta-mir-16a، bta-mir-181، bta-mir-21-5p و bta-mir-223 گردید که هر یک در مسیرهای زیستی مهمی مانند TLR4/NF-κB، MAPK، PI3K-AKT، TGFβ و پیامدهی هورمونی استروژن و پروژسترون نقش دارند. همچنین، نتایج نشان دادند که bta-mir-146a، bta-mir-21-5p و bta-mir-223 به ترتیب بر 7، 9 و 11 پروتئین مهم در این مسیرهای زیستی تأثیر میگذارند. این مسیرها در تنظیم ژنی پاسخ ایمنی، التهاب، رشد، تمایز و مرگ سلولی مؤثر بودند که احتمالا اختلال در آنها میتواند منجر به بروز یا تشدید ورم پستان گردد. هر یک از این miRNAها با هدف قرار دادن چندین پروتئین کلیدی، میتوانند به عنوان زیستنشانگرهای حساس و اختصاصی برای تشخیص زودهنگام ورم پستان مورد استفاده قرار گیرند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| تنظیم ژنی؛ ریزRNAها؛ ژنوم گاو؛ ورم پستان | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Analytical Investigation of Identified miRNAs and Their Target Genes Related to Mastitis in Dairy Cows | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Mostafa Ghaderi Zefrehei | ||
| Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture, Yasouj University | ||
| چکیده [English] | ||
| Candidate miRNAs were selected based on a multi-step criterion. Initially, a systematic review of previous studies that experimentally (via RNA-Seq, qPCR, or DNA microarray) reported the specific expression of miRNAs in inflammatory or infectious mastitis samples in cattle was conducted. Subsequently, miRNAs identified in at least two independent studies or in more than one reliable database (miRBase, NCBI GEO, miRTarBase) as being involved in inflammatory or immune responses were considered. Using bioinformatics analyses and reputable databases such as MirtarBase, TargetScan, DAVID, and NCBI, candidate genes associated with mastitis were identified, and their target signaling pathways were examined. This multi-step selection process was employed to ensure the accuracy and reliability of the selected miRNAs. The results of these analyses identified five key miRNAs, including bta-mir-146a, bta-mir-16a, bta-mir-181, bta-mir-21-5p, and bta-mir-223, each of which plays a role in critical biological pathways such as TLR4/NF-κB, MAPK, PI3K-AKT, TGFβ, and estrogen and progesterone hormone signaling. Furthermore, the findings revealed that bta-mir-146a, bta-mir-21-5p, and bta-mir-223 influence 7, 9, and 11 key proteins, respectively, within these biological pathways. These pathways are involved in regulating immune response, inflammation, cell growth, differentiation, and apoptosis, disruptions of which may lead to the onset or exacerbation of mastitis. Each of these miRNAs, by targeting multiple key proteins, could serve as sensitive and specific biomarkers for the early detection of mastitis in dairy cattle. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| Gene regulation, microRNAs, bovine genome, mastitis, In silico | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 69 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب