پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 162 |
| تعداد شماره‌ها | 6,578 |
| تعداد مقالات | 71,072 |
| تعداد مشاهده مقاله | 125,694,694 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,924,069 |
نسبشناسی ژنی برای قطعه توالیهای افتراقی بیان‌شده Trichoderma harzianum در طول کلونیزه‌شدن اسپرموسفر و سطح ریشة گوجه فرنگی | ||
| دانش گیاهپزشکی ایران | ||
| مقاله 16، دوره 45، شماره 1، اردیبهشت 1393، صفحه 171-184 اصل مقاله (1.54 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijpps.2014.52258 | ||
| نویسندگان | ||
| مهدی مهرابی کوشکی* 1؛ حمید روحانی2؛ عصمت مهدیخانی مقدم3 | ||
| 1استادیار بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران | ||
| 2استاد بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران | ||
| 3دانشیار بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران | ||
| چکیده | ||
| بعضی سویههای تریکودرما به عنوان عامل کنترل بیولوژیک علیه بیمارگرهای گیاهی استفاده شده‌اند. روش نمایش افتراقی تکثیر نسخههای معکوس mRNA (DDRT-PCR) استفاده شد تا ژنهای متمایز بیان‌شدة سویة T. harzianum T7 در طول مراحل کلونیزه‌شدن اسپرموسفر و سطح ریشه گوجه فرنگی ردیابی شود. تولیدات DDRT-PCR روی ژل آگارز تفکیک و 42 باند افتراقی برش خالصسازی، همسانه سازی و توالییابی شد. قطعه توالی های بیان‌شده به‌دست آمده با استفاده از جست‌وجوی BLAST2GO به پایگاه اطلاعات NCBI معرفی و نسبشناسی ژنی آنها بررسی شد. اغلب قطعه توالیهای بیان‌شده مرتبط با پروتئینهای شناخته شده یا فرضی بود. این پروتئینها مرتبط با گروه های کارکردی مختلف بودند و عمدتاً در سوخت‌وساز، انتقال سیگنال درون و بین‌سلولی، برهم‌کنش با میزبان، انتقال پروتئین، ترجمة پروتئینها، کنترل رشد و بقای سلولی، عادت به تغییرات محیطی، انتقال مولکولهای زیستی بین هسته و سیتوپلاسم، تنظیم کارکرد پروتئینها، تقسیم سلولی، تسریع در واکنشهای آنالوگ، تعمیر مولکولهای آسیب‌دیده DNA و دیگر کارکردهای حیاتی در موجودات مختلف نقش داشتند. بعضی قطعه توالیهای بیان‌شده ردیابی‌شده در این مطالعه مرتبط با ژنهایی بودند که آنزیمهای درگیر در تأمین غذایی تریکودرما را در زیستگاه‌شان کد میکنند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| DDRT-PCR؛ ESTs؛ BLAST2GO و کارکرد ژن | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Gene ontology of Trichoderma harzianum differential ESTs during colonization of tomato spermosphere and rhizoplane | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Mehdi Mehrabi-Koushki1؛ Hamid Rouhani2؛ Esmat Mahdikhani moghaddam3 | ||
| 2Professor of Ferdowsi University of Mashhad | ||
| 3Ferdowsi University of mashhad | ||
| چکیده [English] | ||
| Some Trichoderma strains are used as biocontrol agents against phytopathogens. Differential display reverse transcriptase PCR has been developed to detect differentially expressed genes of T. harzianum T7 during colonization stages of tomato spermosphere and rhizoplane. DDRT-PCR products were diplayed on gel and 62 differential bands excised, purified, cloned, and sequenced. Obtained ESTs were submit-queried to NCBI database by BLAST2GO search and evaluated their gene ontology. Most of the transcripts corresponded to known or hypothetical proteins. These proteins correspond to different functional groups, which play role in metabolism, signaling both within and between cells, host interaction, protein transport, translation, controlling of cell growth and survival, adaptation to environmental variables, transportation of biomolecules between nucleus and cytoplasm, regulating protein function, cell division, catalyzing analogous reactions, repairing damaged DNA molecules, and other vital functions in different organisms. Some of the detected ESTs in this study corresponded to genes encodes enzymes potentially involved in nutritional support of Trichoderma in its ecological niches. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| BLAST2GO, ESTs, DDRT-PCR and Gene Function | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,475 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,126 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب