پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 161 |
| تعداد شماره‌ها | 6,573 |
| تعداد مقالات | 71,032 |
| تعداد مشاهده مقاله | 125,502,551 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,766,669 |
Molecular characterization of recent Iranian infectious bronchitis virus isolates based on S2 protein gene | ||
| Iranian Journal of Veterinary Medicine | ||
| مقاله 1، دوره 10، شماره 4، اسفند 2016، صفحه 245-252 اصل مقاله (903.3 K) | ||
| نوع مقاله: Infectious agents- Diseases | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijvm.2016.59716 | ||
| نویسندگان | ||
| Kamran Nazemi1؛ Arash Ghalyanchi Langeroudi* 2؛ Masoud Hashemzadeh3؛ Vahid Karimi4؛ Waleed Seger1؛ Mohammad Reza Ehsan5 | ||
| 1Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, IRAN. | ||
| 2Department of Microbiology and immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran - IRAN | ||
| 3Department of Research and Production of Poultry Viral Vaccine, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Karaj, IRAN. | ||
| 4Department of Avian Medicine, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, IRAN. | ||
| 5Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran | ||
| چکیده | ||
| Background: Avian infectious bronchitis (IB), with avian infectious bronchitis virus (IBV) as the causing agent, is a ubiquitous endemic disease of the chicken with devastating effects on its industry. A viral membrane surface protein called S not only induces neutralizing antibodies but also plays an important role in virus binding and entry to host cells. Technically, S1 protein gene sequencing also helps greatly in IBV genotyping. OBJECTIVES: The aim of this study was to characterize Iranian IBV based on S2 gene. METHODS: After RT-PCR amplification, the S2 gene of nine Iranian IBV isolates were sequenced and then compared with reference strains. RESULTS: The isolates were classified into genotype I as Massachusetts like IB Vs, genotype VII which clustered into two branches, VIIa (IS-1494 like IB viruses), and VIIb, and was related to QX- like viruses and Genotype VIII as 793/B like IBVs. CONCLUSIONS: As far as we know, this is the first S2-based classification study on Iranian IBV isolates providing a firm experimental basis to correlate with genotypic characterization | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Characterization؛ infectious bronchitis virus؛ genotyping؛ Phylogenetic study؛ spike | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| ژنوتایپینگ و تقسیم بندی ویروس های برونشیت عفونی پرندگان بر اساس ژن کد کننده پروتئین S2و تقسیم بندی ویروس های برونشیت عفونی پرندگان بر اساس ژن کد کننده پروتئین S2 | ||
| نویسندگان [English] | ||
| کامران ناظمی1؛ آرش قلیان چی لنگرودی2؛ مسعود هاشم زاده3؛ وحید کریمی4؛ ولید صگر1؛ محمدرضا احسان5 | ||
| 1گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران ، تهران، ایران | ||
| 2گروه میکروبیولوژی و ایمینی شناسی دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران ، تهران - ایران | ||
| 3موسسه واکسن و سرم سازی رازی ، کرج، ایران | ||
| 4گروه بیماریهای طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران ، تهران، ایران | ||
| 5گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران ، تهران، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| زمینه مطالعه: ویروس برونشیت عفونی، عامل بیماری برونشیت عفونی از عوامل مهم در ایجاد خسارات اقتصادی در صنعت طیور دنیا می‌باشد. ویروس برونشیت عفونی به سروتیپ‌ها و ژنوتیپ‌های مختلفی طبقه بندی می‌شود. پروتئین اسپایک (S) (~ 3462)، واقع در سطح غشاء ویروسی، القاء عمده‌ای از آنتی بادی‌های خنثی است و مسئول ویروس اتصال و ورود به سلول‌های میزبان است. جدایه‌های ویروس برونشیت عفونی بطور گسترده بوسیله سکانس ژن پروتیین s1 ژنوتایپینگ می‌شوند. هدف: هدف از این مطالعه، ژنوتایپینگ جدید و طبقه‌بندی جدایه‌های ویروس برونشیت عفونی در ایران بر‌اساس پروتیین s2 می‌باشد. روش کار: ژن s2 نه جدایه ویروس برونشیت عفونی ابتدا توسط روش RT-PCR تکثیر داده شدند و مورد سکانس قرار گرفتند. سکانس آمینواسیدی این جدایه‌ها با سکانس جدایه‌های غیر ایرانی مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج: جدایه‌های ویروس برونشیت عفونی ایران به سه ژنوتیپ (I, VII, VIII) تقسیم‌بندی گردیدند. ژنوتیپ I شامل ویروس‌های مشابه سروتیپ ماساچوست بود. ژنوتیپ VII به دو شاخه تقسیم‌بندی شدند، اولین شاخه VIIa (مشابه IS-1494) و دومین شاخه VIIb نیز مربوط به ویروس‌های مشابه QX بودند. ژنوتیپVIIIشامل ویروس‌های مشابه 793/B بودند. نتیجه‌گیری‌نهایی: مطالعه حاضر نخستین اطلاعات در مورد ژنوتایپینگ و طبقه‌بندی جدایه‌های ویروس برونشیت عفونی ایران می‌باشد | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| تعیین هویت, برونشیت عفونی, شجره شناسی, پروتئین S2, اسپایک | ||
| مراجع | ||
|
Abro, S.H. (2012) Molecular characterization and detection of infectious bronchitis virus.Vet Microbiol. 155: 237–246.## Aghakhan, S., Abshar, N., Fereidouni, S.R.N., Marunesi, C., Khodashenas, M. (1994) Studies on avian viral infections in Iran. Arch Inst Razi. 44: 1-10.## Ammayappan, A., Vakharia, V.N. (2009) Complete nucleotide analysis of the structural genome of the infectious bronchitis virus strain md27 reveals its mosaic nature. Viruses. 1: 1166-1177.## Bozorgmehri-Fard, M., Charkhkar, S., Hosseini, H. (2014) Detection of the chinese genotype of infectious bronchitis virus (QX-type) in Iran. Iranian J Virol. 7: 21-24.## Callison, S.A., Jackwood, M.W., Hilt, D.A. (1999) Infectious bronchitis virus S2 gene sequence variability may affect S1 subunit specific antibody binding. Virus Genes. 19: 143-151.## Callison, S.A., Jackwood, M.W., Hilt, D.A. (1999) Infectious bronchitis virus S2 gene sequence variability may affect S1 subunit specific antibody binding. Virus Genes. 19: 143-151.## Hosseini, H., Bozorgmehri Fard, M.H., Charkhkar, S., Morshed, R. (2015) Epidemiology of avian infectious bronchitis virus genotypes in Iran (2010-2014). Avi Dis. 59: 431-5.## Jackwood, M. W. (2012) Review of infectious bronchitis virus around the world. Avian Dis. 56: 634-641.## Lee, C.-W., Hilt, D. A., Jackwood, M.W. (2003) Typing of field isolates of infectious bronchitis virus based on the sequence of the hypervariable region in the S1 gene. J Vet Diag Invest. 15: 344-348.## Mase, M., Inoue, T., Yamaguchi, S., Imada, T. (2009) Genetic diversity of avian infectious bronchitis viruses in Japan based on analysis of s2 glycoprotein gene. J Vet Med Sci. 71: 287-291.## Mo, M.-L., Hong, S.-M., Kwon, H.-J., Kim, I.-H., Song, C.-S., Kim, J.-H. (2013) Genetic diversity of spike, 3a, 3b and e genes of infectious bronchitis viruses and emergence of new recombinants in Korea. Viruses, 5, 550-567.## Najafi, H., Langeroudi, A.G., Hashemzadeh, M., Karimi, V., Madadgar, O., Ghafouri, S.A., Maghsoudlo, H., Farahani, R.K. Molecular characterization of infectious bronchitis viruses isolated from broiler chicken farms in Iran, 2014-2015. Arch Virol. 161: 1-10.## Najafi, H., Madadgar, O., Jamshidi, S., Langeroudi, A.G., Lemraski, M.D. (2014) Molecular and clinical study on prevalence of feline herpesvirus type 1 and calicivirus in correlation with feline leukemia and immunodeficiency viruses. In: Vet Res Forum (Vol. 5, pp. 255): Faculty of Veterinary Medicine, Urmia University, Urmia, Iran. ## Seyfi Abad Shapouri, M., Mayahi, M., Assasi, K., Charkhkar, S. (2004) A survey of the prevalence of infectious bronchitis virus type 4/91 in Iran. Acta Vet Hung. 52: 163-166.## Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M., Kumar, S. (2011) MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol. 28: 2731-2739.## Zulperi, Z.M., Omar, A.R., Arshad, S.S. (2009) Sequence and phylogenetic analysis of S1, S2, M, and N genes of infectious bronchitis virus isolates from Malaysia. Virus Genes. 38: 383-391.##
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,616 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,194 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب