پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 158 |
| تعداد شماره‌ها | 6,230 |
| تعداد مقالات | 67,764 |
| تعداد مشاهده مقاله | 115,162,543 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 89,917,797 |
تنوع و ساختار ژنتیکی جمعیت‌های سیاه ماهی خالدار Capoeta trutta (Heckel, 1843) در استان کردستان با استفاده از نشانگرهای بین ریز ماهواره‌ای | ||
| شیلات | ||
| مقاله 12، دوره 69، شماره 2، شهریور 1395، صفحه 265-273 اصل مقاله (590.21 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jfisheries.2016.59856 | ||
| نویسندگان | ||
| بهروز میرزایی11؛ ابراهیم علیزاده دوغیکلایی22؛ برزان بهرامی کمانگر3*3؛ علی ارشدی44 | ||
| 11. دانش‌آموخته کارشناسی ارشد، گروه شیلات دانشکده منابع طبیعی دانشگاه زابل | ||
| 22. دانشیار گروه شیلات دانشکده منابع طبیعی دانشگاه زابل | ||
| 33. استادیار گروه شیلات دانشکده منابع طبیعی دانشگاه کردستان | ||
| 44. استادیار گروه شیلات دانشکده منابع طبیعی دانشگاه زابل | ||
| چکیده | ||
| به منظور بررسی میزان تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار ژنتیکی جمعیت‌های سیاه ماهی خالدار (Capoeta trutta) در دو حوزه آبریز واقع در استان کردستان از نشانگرهای بین ریزماهواره‌ای استفاده گردید. از شش آغازگر دی‌نوکلئوتیدی مورد استفاده، تنها در سه آغازگر (AG)9C، (GA)9C و (AC)9T باندهای واضح، تکرارپذیر و قابل امتیازدهی در شرایط واکنش PCR مورد استفاده مشاهده گردید. این سه آغازگر در مجموع تعداد 56 باند تکرار پذیر در شش جمعیت مورد مطالعه تولید نمودند که درصد پلی‌مورفیسم در جمعیت رودخانه‌های سیروان، گاوه رود، قشلاق، از حوزه سیروان و رودخانه‌های چومان، گرماب و شوی از حوزه چومان به ترتیب 00/80، 98/82، 61/82، 71/85، 60/79 و 49/80 تعیین گردیدند. میزان هتروزیگوسیتی در جمعیت‌های مورد بررسی متوسط تا زیاد برآورد گردید. شاخص‌های تنوع ژنتیکی درون جمعیتی در جمعیت چومان به طور معنی‌دار بیشتر از سایر جمعیت‌های مورد مطالعه بود. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که حدود 89 درصد تنوع ژنتیکی مربوط به درون جمعیت‌ها بوده و تنها 11 درصد آن مربوط به تنوع بین جمعیتی می‌باشد. مقدار شاخص تثبیت (Fst) محاسباتی نشان‌دهنده میزان تمایز کم تا متوسط در شش جمعیت مورد بررسی است. با این وجود نتایج آزمون صحت، تمایز معنی‌داری بین جمعیت‌های مورد مطالعه نشان نداد. نتایج این تحقیق نشان می‌دهد که شرایط زیست و حفظ تنوع ژنتیکی برای گونه سیاه ماهی خالدار در دو زیستگاه سیروان و چومان در حد متوسط می‌باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تنوع ژنتیکی؛ ساختار ژنتیکی؛ نشانگرهای بین ریزماهواره‌ای؛ سیاه ماهی خالدار؛ کردستان | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Diversity and Genetic Structure of Capoeta trutta (Heckel, 1843) Populations in the Kurdistan Province using Inter Simple Sequence Repeat Markers | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Behroz Mirzaei11؛ Ebrahim Alizadeh Doughikollaee22؛ Barzan Bahrami Kamangar3*3؛ Ali Arshadi44 | ||
| 11. Msc of Fisheries, Department of Fisheries, Faculty of Natural Resources, University of Zabol, Zabol, Iran | ||
| 22. Associate Professor, Department of Fisheries, Faculty of Natural Resources, University of Zabol, Zabol, Iran | ||
| 33. Assistant Professor, Department of fisheries, Faculty of Natural Resources, University of Kurdistan, Sanandaj, Iran | ||
| 44. Assistant Professor, Department of Fisheries, Faculty of Natural Resources, University of Zabol, Zabol, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) analysis was performed to evaluate genetic diversity and genetic structure of six Capoeta trutta populations from two main watersheds in the Kurdistan province. Fish samples were caught from the Choman, Shooei, Garmab Rivers in the Choman watershed and from the Gheshlagh, Gavarood, Sirvan Rivers in the Sirvan watershed. From six used dinucleotide primers, three ((AG)9C, (GA)9C and (AC)9T)) generated discernible bands. Fifty six clear and repeatable bands were generated throughout six populations. The percentages of polymorphism were 80.00, 82.98, 82.61, 85.71, 79.60 and 80.49 within the Sirvan, Gavarood, Gheshlagh, Choman, Garmab and Shooei populations, respectively. The average values of heterozygosites were determined as moderate to high within the studied populations. The intrapopulation genetic diversity indices were significantly higher in the Choman population than others. The analysis of molecular variance revealed 89 percent variation within populations whereas only 11 percent between populations. Population comparisons based on fixation index (Fst) revealed low to moderate differentiation between six studied populations. However there was no significant differentiation between populations as testified by exact test. The results showed that environmental conditions to maintain genetic diversity of Capoeta trutta populations in two watersheds are moderate. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Genetic diversity, genetic structure, ISSR Markers, Capoeta trutta, Kurdistan | ||
| مراجع | ||
|
Abdoli, A., 2000. The inland water fishes of Iran. Museum of Nature and Wild life, Tehran, Iran, 377 p. (in Persian). Alwan, N.H., Zareian, H., Esmaeili, H.R., 2016. Capoeta coadi, a new species of cyprinid fish from the Karun River drainage, Iran based on morphological and molecular evidences (Teleostei, Cyprinidae). Zookeys 572, 155-180. Anvari Far, H., Farahmand, H., Nematolahi, M., Rahmani, H., Karami, M., Khalili, B., 2010. Impacts of shahid Rajaii dam on genetic variation and differentiation siah mahi, capoeta capoeta gracilis, in tajan river using RAPD fingerprinting. Journal of Natural Environment 63, 211-223 (in Persian). Armantrout, N.B., 1980. The freshwater fishes of Iran. Ph.D thesis, Oregon State University, 472 p. Banarescu, P., Coad, B.W., 1991. Cyprinids of Eurasia. In: Winfield, I., Nelson, J.S. (Eds.), Cyprinid Fishes Systematics Biology and Exploitation. Chapman and Hall, London, pp. 127-155. Barman, H.K., Barat, A., Yadav, B.M., Banerjee, S., Meher, P.K., Reddy, P.V.G.K., Kumar Jana, R., 2003. Genetic variation between four species of Indian major carps as revealed by random amplified polymorphic DNA assay. Aquaculture 217, 115-123. Brown, A.H.D., Feldman, M.W., 1981. Population structure of multilocus associations. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 78, 5913-5916. Danabas, D., Benzer, F., Kaplan, O., Yildirim, N.C., 2011. Levels of copper in liver, muscle and gill tissues in Capoeta trutta (Heckel, 1843) from Munzur River, Turkey. African Journal of Agricultural Research 6, 1909-1912. Excoffier, L., Laval, G., Schneider, S., 2005. Arlequin (version 3.0): an integrated software package for population genetics data analyses. Evolutionary Bioinformatics Online 1, 47-50. Ferguson, M., 1995. The role of molecular genetic markeres in the management of cultured fishes. In: Carvalho, G.R., Pitcher, T.J. (Eds.), Molecular genetics in fisheries. Chapman and Hall, London, pp. 81-103. Frankham, R., 1996. Relationship of genetic variation to population size in wildlife. Conservation Biology 10, 1500-1508. Hedrick, P.W., 2001. Conservation genetics: where are we now? Trends in Ecology and Evolution 16, 629-636. Ji, Y.-T., Qu, C.-Q., Cao, B.-Y., 2007. An optimal method of DNAsilver staining in polyacrylamide gels. Electrophoresis 28, 1173-1175. Keyvanshokooh, S., Kalbassi, M.R., 2006. Genetic variation of Rutilus rutilus caspicus (Jakowlew 1870) populations in Iran based on random amplified polymorphic DNA markers: a preliminary study. Aquaculture Research 37, 1437-1440. Kiabi, B.H., Abdoli, A., Naderi, M., 1999. Status of the fish fauna in the South Caspian Basin of Iran. Zoology in the Middle East 18, 57–65. Liu, Y.G., Yu, Z.G., Bao, B.L., Sun, X.Q., Shi, Q.L., Liu, L.X., 2009. Population genetics studies of half-smooth tongue sole Cynoglossus semilaevis using ISSR markers. Biochemical Systematics and Ecology 36, 821–827. Mohamadian, S., Rezvani Gilkolaei, S., Kazemian, M., Kamali, A., Rouhollahi, S., Taghavi, M.J., Laloei, F., 2011. A study on population genetics of Vimba vimba persa (Pallas, 1814) using microsatellite markers in Gilan province, the Southern Caspian Sea. Iranian Journal of Natural Resources 64, 145-152 (in Persian). Mohamadian, S., Rezvani Gilkolaei, S., Kazemian, M., Kamali, A., Taghavi, M.J., Rouholahi, S., Laloei, F., Nayerani, M., 2010. The study of genetic diversity and population structure of Vimba vimba persa (Pallas, 1814) populations in the Eastern and Western coastline of the Caspian sea (Havigh River and GorganRoud River) using microsatellite markers. Taxonomy and Biosystematics 2, 29-38 (in Persian). Nei, M., 1978. Estimation of average hetcrozygosity and genetic distance from small number of individuals. Genetics 89, 583-590. Rahmani, H., Kazemi, H., Pourkazemi, M.,Bandehpour, M., Naderi Jolodar, M., Seyed, N., Ataei, F., 2009. Genetic diversity of the Shemaya (Chalcalburnus chalcoides) populations in Haraz, Shirud and Gazafrud Rivers using 18S rRNA gene and the PCR-RFLP Method. Environmental Sciences 6, 43-52 (in Persian). Raymond, M., Rousset, F., 1995. An exact test for population differentiation. Evolution 49, 1280-1283. Samaee, S.M., Mojazi-Amiri, B., Hosseini-Mazinani, S.M., 2006. Comparison of Capoeta capoeta gracilis (Cyprinidae, Teleostei) populations in the south Caspian Sea River basin, using morphometric ratios and genetic markers. Folia Zoologica 55, 323–335. Thai, B.T., Burridge, C.P., Austin, C.M., 2007. Genetic diversity of common carp(Cyprinus carpio L.) in Vietnam using four microsatellite loci. Aquaculture 269, 174–186. Ward, R.D., Woodwark, M., Skibinski, D.O.F., 1994. A comparison of genetic diversity levels in marine, freshwater, and anadromous fishes. Journal of Fish Biology 44, 213-232. Weir, B.S., 1996. Genetic data analysis II: Methods for discrete population genetic data. Sinauer Associates Inc., Sunderland Massachusetts, 376 p. Wright, S., 1978. Evolution and the genetics of populations. University of Chicago press, Chicago, 590 p. Zareian, H., Esmaeili, H. R., Freyhof, J., 2016. Capoeta anamisensis, a new species from the Minab and Hasan Langhi River drainages in Iran (Teleostei: Cyprinidae). Zootaxa 4083, 126-142. Zietkiewicz, E., Rafalski, A., Labuda, D., 1994. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics 20, 176-183. Zilberman, N., Reikhav, S., Hulata, G., Ron, M., 2006. High-throughput genomic DNA extraction protocol from tilapia's fin tissue. Aquaculture 255, 597–599. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,360 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 692 |
||