تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,498 |
تعداد مقالات | 70,233 |
تعداد مشاهده مقاله | 123,448,011 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 96,672,319 |
تنوع ژنتیکی درون و بین نژادهای ایرانی، فرانسوی و دانمارکی ماهی قزلآلای رنگینکمان (Oncorhynchus mykiss) با استفاده از آنالیز PCR-RFLP قطعات DNA میتوکندری | ||
شیلات | ||
مقاله 10، دوره 70، شماره 1، خرداد 1396، صفحه 106-116 اصل مقاله (442.32 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jfisheries.2017.218764.954 | ||
نویسندگان | ||
ربیع شکی1؛ حسین رحمانی* 2؛ قدرت رحیمی3؛ محسن قلی زاده4 | ||
1دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران. | ||
2دانشیار گروه شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران. | ||
3استاد گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران. | ||
4استادیار گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران. | ||
چکیده | ||
هدف از این پژوهش، بررسی میزان تنوع ژنتیکی بین و درون نژادهای قزل آلای رنگینکمان ایرانی، فرانسوی و دانمارکی بود. DNA میتوکندریایی 135 نمونه (45 نمونه از هر نژاد)، به روش فنل کلروفوم استخراج شده و با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز چند شکلی طول قطعات حاصل از هضم (PCR-RFLP) مورد مطالعه قرار گرفت. قطعات شامل 986 جفت باز از D-loop و 974 جفت باز از سیتوکروم b تکثیر و با آنزیمهای هضم مختلف مطالعه شدند. هیچکدام از نمونه ها برای آنزیم های هضم در D-loop تنوع ژنتیکی را نشان ندادند. با استفاده از آنزیم های هضم، 4 هاپلوتیپ مختلف روی ژل آگارز برای سیتوکروم b شناسایی شد که در میان آنها دو هاپلوتیپ مخصوص نژادی برای نژاد دانمارکی مشاهده شد. بیشترین فراوانی هاپلوتیپ ها برای هاپلوتیپ AABBAB با 61 مشاهده بود. دندروگرام UPGMA بر اساس سیتوکروم b نشان داد که نژاد ایرانی با فرانسوی در یک کلاستر و از نژاد دانمارکی جدا شد. فاصله ژنتیکی بین نژاد ایرانی و فرانسوی 0/0008 و بین نژادهای ایرانی و دانمارکی و همچنین فرانسوی و دانمارکی 0/198 بود. | ||
کلیدواژهها | ||
قزل آلای رنگی کمان؛ تنوع ژنتیکی؛ mtDNA؛ PCR-RFLP | ||
عنوان مقاله [English] | ||
Genetic Variation within and among Iranian, French and Danish Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) Using PCR-RFLP Analysis of Mitochondrial DNA Segments | ||
نویسندگان [English] | ||
Rabi Shakki1؛ Hossein Rahmani2؛ Ghodrat Rahimi3؛ Mohsen Gholizadeh4 | ||
1Graduated MSc, Department of Fisheries, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University, Iran. | ||
2Associate professor, Department of Fisheries, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University, Iran. | ||
3Professor, Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University, Iran. | ||
4Assistant professor, Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University, Iran | ||
چکیده [English] | ||
The objective of this study was to investigate the genetic diversity within and between Iranian, French and Danish rainbow trout, Oncorhynchus mykiss. Mitochondrial DNA (mtDNA) of 135 samples (45per each breed), isolated by phenol-chloroform extraction method, was studied by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Fragments that included 986 bp of D-loop and 974 bp of Cyt b of mtDNA were amplified and investigated using different restriction enzymes. None of samples showed variation for restriction enzymes in D-loop. Using restriction enzymes, on gel electrophoresis, four different haplotypes were detected in Cyt b among which two breed specific haplotypes were observed in Danish population. AABBAB haplotypes had the most frequency with 61 events. UPGMA dendrogram based on cytochrome b gene showed that the Iranian population make cluster with French population rather than the Danish population. The genetic distance was 0.0008 between Iranian and French populations and 0.198 between both Iranian and Danish and French and Danish populations. | ||
کلیدواژهها [English] | ||
mtDNA, PCR-RFLP, Rainbow trout, Genetic diversity | ||
مراجع | ||
| ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 550 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 280 |