آنالیز پایداری بیان برخی از ژنهای مرجع به منظور مطالعات بیان ژن در برنج با استفاده از Real-time PCR | ||
| علوم گیاهان زراعی ایران | ||
| مقاله 12، دوره 49، شماره 4، زمستان 1397، صفحه 151-160 اصل مقاله (811.19 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijfcs.2018.232809.654314 | ||
| نویسندگان | ||
| امین ابراهیمی* 1؛ محمد رضا عامریان2؛ آرمان بیرقدار کشکولی3 | ||
| 1عضو هیئت علمی دانشگاه صنعتی شاهرود | ||
| 2عضو هیات علمی دانشگاه صنعتی شاهرود | ||
| 3دانشجوی دکتری | ||
| چکیده | ||
| با ابداع واکنش زنجیرهای پلیمراز در زمان واقعی تحول عظیمی در زمینه تجزیه بیان ژن در موجودات زنده ایجاد شد، چراکه یکی از روشهای مناسب برای ارزیابی میزان بیان ژنها محسوب میگردد. در این روش، برای ارزیابی دقیق بیان ژن کنترل خطا بین نمونهها ضروری میباشد. روشی که به صورت گسترده برای کنترل خطا مورد استفاده قرار میگیرد، نرمال کردن سطوح RNA با یک ژن مرجع یا خانهدار میباشد. این مطالعه به منظور بررسی کارایی10 ژن خانهدار در گیاه برنج در شرایط تنش شوری انجام شد. تیمار شوری صفر و 300 میلیمولار بعد از گذشت 8 هفته از رشد گیاهان اعمال گردید. همچنین در زمانهای صفر، 6، 12، 24، 48 و 72 ساعت پس از اعمال تیمار شوری، از اندامهای ریشه و برگ نمونهگیری صورت گرفت. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل دادهها با استفاده از نرم افزار geNorm نشان داد که ژنهای eIF-4a و ACT7 در بافت ریشه و ژنهای GAPDH و ACT11 در بافت برگ به عنوان پایدارترین ژنهای مرجع میتوانند در نرمالسازی مطالعات بیان ژن مورد استفاده قرار بگیرند. بر اساس آماره توصیفی در برنامه BestKeeper ژن eIF-4a در اندام ریشه و ژنهای UBQ10 و eIF-4a در اندام برگ دارای بیشترین همبستگی با شاخص BestKeeper (به ترتیب 885/0، 891/0و 886/0) میباشد. در مجموع نتایج این تحقیق نشان داد که ژنهای eIF-4a، ACT7، UBQ10 ، GAPDH و ACT11 میتوانند به عنوان ژنهای مرجع مناسب در گیاه برنج به منظور نرمالسازی دادههای بیانی مورد استفاده قرار بگیرند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| برنج؛ واکنش زنجیرهای پلیمراز زمان واقعی؛ تنش شوری؛ ژن مرجع؛ BestKeeper | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,423 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 789 |
||