تخمین ارزش اصلاحی صفات مورفوفیزیولوژیک مرتبط با عملکرد در ذرت تحت شرایط نرمال و تنش شوری براساس نشانگر SNP

مقدمه

ذرت (Zea mays L.) رتبه اول عملکرد و میزان تولید و رتبه سوم سطح زیر کشت را در دنیا به خود اختصاص داده و یکی از محصولات راهبردی مطرح در جهان می­باشد (Sajedi & Ardekani, 2008). مصرف ذرت در حوضه دامپروری، صنعت و همچنین تغذیه انسان به­جهت میزان لیزین بالا، در پنج دهه گذشته، افزایش تقاضای تولید ذرت را به همراه داشته است. بنابراین تلاش در جهت توسعه کشت و بهبود عملکرد و کیفیت ذرت در اولویت برنامه­های ­اصلاحی قرار گرفته است (Fageria et al., 2010; Hearn, 2014). گیاهان با اثرات منفی تنش­های مختلف در طول دوره­های رشد خود مواجه هستند. در این میان تنش شوری اثرات مخرب جهانی دارد. پیش­بینی می­شود که حدود 50 درصد از زمین­های زراعی با تداوم روند شور­شدن خاک­ها در آینده غیر قابل کشت شوند
 (Niu et al., 2018). ایران با­توجه­به محدودیت بارش، از نظر اقلیمی جزء مناطق خشک و نیمه­خشک جهان طبقه­بندی می­شود. یکی از مشکلات بزرگ پیش روی کشاورزی در ایران شوری خاک و آب آبیاری است. تنش شوری با کاهش پتانسیل اسمزیِ آب، قابلیت دسترسی آب برای ریشه را کاهش می­دهد که در نتیجة آن تغییرات فیزیولوژیکی، بیوشیمیایی و مورفولوژیکی متعدد در گیاهان روی می­دهد (Mohammadkhani & Sharifi, 2016; Roy et al., 2014). تنش شوری در ابتدا، از طریق تنش اسمزی تظاهر یافته و رشد گیاه را محدود می­کند، سپس به سبب سمیت یونی ناشی از تجمع غلظت بالای نمک در برگ­های پیر، منتهی به مرگ آنها می­شود (Munns & Tester, 2008). در خاک­های متاثر از نمک، شوری سبب تجمع بیش از حد یون­های سدیم و کلرید در ریزوسفر و تداخل شدید با سایر عناصر معدنی ضروری مانند پتاسیم، کلسیم، نیتروژن، فسفر، منیزیم، آهن، مس، روی و منگنز شده و در نتیجة عدم تعادل شدید تغذیه­ای در ذرت حادث می­شود (Turan et al., 2010). به­طور کلی، تنش نمک جذب نیتروژن، پتاسیم، کلسیم، منیزیم و آهن را کاهش می­دهد (Shahzad et al., 2012; Yasmeen et al., 2013). گیاهان از مسیرهای پیام­رسانی متفاوتی در مواجه با تنش استفاده می­کنند. سه مسیر پیام­رسانی عمده که نقش مهمی در فرآیند تحمل به تنش بازی می­کنند؛ مسیر حساسیت بیش از حد به شوری^[1] (SOS)، آبشار پروتئین کینازی فعال­شده در اثر میتوژن^[2] (MAPK) و گونه­های فعال اکسیژن^[3] (ROS) هستند. از­سوی دیگر، فرآیند تحمل به شوری در گونه­های مختلف گیاهان در مراحل مختلف رشدی تظاهر می­کند (Mohammadkhani & Sharifi, 2016; Roy et al., 2014). بنابراین بررسی وجود تنوع فنوتیپی و ژنوتیپی بین ژنوتیپ­ها پیش­نیاز برنامه­های اصلاحی است.

با معرفی برنامه­های اصلاحی که در آن از ارزش­های اصلاحی برآورد­شده به­جای ارزش­های فنوتیپی استفاده می­شود، محدودیت‌های به­نژادی سنتی کمتر شده است. به­کارگیری این روش­ها که تلفیقی از کاربرد داده­های کمّی (فنوتیپی) و مولکولی به­همراه روش‌های آماری و محاسباتی پیچیده می­باشد، تجزیه و بهبود ژنتیکی صفات مهم اقتصادی در گیاهان را با افزایش کارایی گزینش همراه ساخته است. گزارش­هایی از پیشرفت ژنتیکی حاصل از این نوع گزینش در برخی صفات ارائه شده است (Piepho et al., 2008; Ramos et al., 2014; Quintal et al., 2017). ارزش اصلاحی^[4] (BV) مجموع متوسط اثرات تمام آلل­های یک ژنوتیپ برای یک صفت را منعکس می­کند. در واقع ارزش اصلاحی، برآورد ارزش یک فرد از طریق میانگین ارزش فنوتیپی نتاجش می­باشد که از تلاقی تصادفی با جمعیت به­دست آمده­اند
 (Falconer & Mackay, 1996). در عمل، اصلاح­گران از قابلیت ترکیب­پذیری عمومی^[5] (GCA) برای پیش­بینی ارزش­های اصلاحی والدینی استفاده می­کنند. در گونه­های دیپلوئید و در غیاب اپیستازی، ارزش GCA فرد نیمی از ارزش اصلاحی آن است
 (Isik et al., 2017). برآورد ارزش­های اصلاحی در قالب معادلات مدل آمیخته از طریق بهترین پیش­بینی نااریب خطی^[6] (BLUP)، که در آن از ماتریس ارتباط ژنتیکی A که شامل ضریب همخوانی محاسبه­شده بر­اساس شجرة ژنوتیپ­ها یا ماتریس شباهت­های ژنتیکی (Kinship matrix) می­باشد، با استفاده از نرم­افزار Wombat انجام می­شود (Bauer et al., 2006; Meyer, 2007).

توسعه نشانگرهای مولکولی محاسبه ماتریس شباهت­های ژنتیکی جهت پیش­بینی ارزش­های اصلاحی را در غیاب دسترسی به شجره ژنوتیپ­ها امکان­پذیر کرده است (Piepho, 2009; Jannink et al., 2010). از میان نشانگرهای مولکولی، نشانگر SNP به­دلیل پوشش مناسب ژنوم و امکان دسترسی به اطلاعات ژنومی بیشتر، به­طور گسترده در برنامه‌های به‌نژادی گیاهان برای شناسایی تنوع ژنتیکی، تهیه نقشه‌های ژنتیکی با وضوح بالا، تحلیل ارتباط در گستره ژنوم، انتخاب ژنومی، مطالعه تاریخچه تکاملی جمعیت‌ها استفاده می‌شود (Zhao et al., 2015). استفاده از نشانگر مولکولی SNP در برآورد ارزش اصلاحی صفات در در ژنوتیپ­های برگزیده در ایران می­تواند اطلاعات شایانی در اختیار به­نژادگران قرار ­دهد. در این تحقیق ارزش اصلاحی ژنوتیپ­های ذرت برای برخی صفات در هر یک از شرایط نرمال و تنش شوری برآورد شده است.

 

مواد و روش­ها

مواد گیاهی

تعداد 73 ژنوتیپ ذرت تهیه­شده از مراکز تحقیقاتی مختلف (دانشگاه رازی کرمانشاه، مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی و مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر کرج) (فایل تکمیلی 1) در سال 1397-1398 در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار در دو شرایط نرمال و تنش شوری 8 دسی­زیمنس بر متر در شرایط گلدانی (گلدان­های پلاستیکی به حجم 10 لیتر به ابعاد 24×24 سانتی­متر) در محوطه باز در دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه مورد ارزیابی و مطالعه قرار گرفتند. گلدان­ها با استفاده از سامانه قطره­ای آبیاری شدند. جهت تأمین عناصر مغذی و ایجاد شرایط رشدی مطلوب کود NPK 20-20-20 با غلظت 5/0 گرم در لیتر از مرحله چهار­برگی تا مرحله تاسل­دهی در دورة زمانی هر هفته یک بار، و از مرحله تاسل­دهی به بعد با غلظت 2 گرم در لیتر هر سه روز یک بار به گلدان­ها اضافه شد. اعمال تنش شوری در مرحلة ­هشت برگی انجام گرفت. با­توجه­به آستانه تحمل شوری ذرت (7/2 دسی­زیمنس بر متر)، از شوری 8 دسی­زیمنس بر متر خاک برای اعمال تنش استفاده شد (Emdad & Fardad, 2000; Najafi & Sarhangzadeh, 2012). با شروع مرحله تاسل­دهی 25 صفت شامل زاویه برگ، سطح برگ، وزن خشک برگ پرچم، فاصله پهنک برگ پرچم تا تاسل، روز تا بلال­دهی، روز تا تاسل­دهی، طول اولین گره تا تاسل، تعداد خوشه تاسل، طول تاسل، تعداد برگ روی بلال، تعداد ردیف دانه در بلال، تعداد دانه در ردیف، وزن دانه در بلال اصلی، وزن بوته، وزن بلال با غلاف، وزن بلال بدون غلاف، قطر بلال بدون دانه، وزن چوب بلال، عرض دانه، قطر دانه، ارتفاع دانه، میزان کلروفیل، دمایی کانوپی، محتوای نسبی آب و درصد نشت یونی اندازه­گیری و ارزش اصلاحی تحت شرایط تنش شوری و نرمال برای صفات فوق برآورد شد.

ارزیابی ژنوتیپی لاین­های ذرت

به­منظور تهیه پروفیل مولکولی ژنوتیپ­ها از برگ­های جوان یک­ماهه جهت استخراج DNA به روش Saghai-Maroof et al. (1984) استفاده شد. جهت اطمینان از کمیت و کیفیت DNA استخراج­شده، به­ترتیب از روش نانودراپ و الکتروفورز ژل آگارز %1 استفاده شد.

سپس DNAهای واجد کمیت و کیفیت مطلوب، جهت توالی‌یابی به شرکت TraitGenetics آلمان (http://www.traitgenetics.com/) ارسال شدند. کتابخانه ژنومی 93 ژنوتیپ توسط شرکت ساخته شد و توالی‌یابی با استفاده از پلتفرم Affymetrix® Maize 600K genotyping array انجام شد.

تجزیه آماری

از نرم­افزار SAS جهت محاسبة آماره­های توصیفی و تجزیه واریانس صفات تحت شرایط نرمال و تنش شوری استفاده شد. پیش­بینی ارزش اصلاحی صفات برای ژنوتیپ­های مورد مطالعه با استفاده از میانگین­های صفات زراعی در هر یک از دو محیط نرمال و تنش شوری به­روش بهترین پیش­بینی نااریب خطی (BLUP) و نرم­افزار SAS نسخه 4/9 انجام شد (Bernardo, 2007). در حالت کلی ساختار مدل خطی آمیخته به شکل زیر می­باشد:

رابطه (1)

Y = Xb+ Zu + e

که در آن Y بردار مشاهدات، u و b به­ترتیب بردارهای اثرات ثابت و تصادفی، X و Z به­ترتیب ماتریس­های تلاقی^[7] و e بردار باقی­مانده تصادفی است. اثرات ثابت توسط بهترین برآورد نااریب خطی (BLUE) و اثرات تصادفی از طریق بهترین پیش­بینی نااریب خطی (BLUP) برآورد می­شوند. بردارهای e و u (اثرات تصادفی) دارای توزیع نرمال با میانگین صفر و واریانس  هستند که در آن  و  هستند و اندیس t و n در ماتریس­های واحد (I) به­ترتیب تعداد سطوح اثر تصادفی (تیمار یا ژنوتیپ) و تعداد مشاهدات را نشان می­دهند (Yang, 2010).  و  به­ترتیب واریانس اثر تصادفی و واریانس باقی­مانده هستند که اجزای واریانس در  GوR  با حداکثر درست­نمایی محدود­شده^[8] برآورد­شده جایگزین می­شوند (Patterson & Thompson, 1971). BLUE و BLUP از طریق حل معادلات مدل مخلوط ارائه­شده توسط هندرسون (Henderson, 1990) محاسبه می­شوند.

رابطه (2)

 

در اینجا؛

G= I_t; R= I_n;

است. معادلات هندرسون جهت برآورد ارزش­های اصلاحی با­در­نظر­گرفتن تعداد متفاوت تکرار ژنوتیپ­ها و ضرب طرفین معادلات در  (Foulley, 2015) به شکل زیر تبدیل می­شود (Bernardo, 2007).

رابطه (3)

.

 

که در آن؛  و  فرض می­شوند. A یک ماتریسِ t×t (t: تعداد ژنوتیپ) ضرایب خویشاوندی است که درجه کوواریانس ژنتیکی بین افراد را نشان می­دهد.r  اگر تعداد تکرار ژنوتیپ­ها یکسان باشد یک ماتریس واحد^[9] است؛ اما اگر تعداد تکرار ژنوتیپ­ها متفاوت باشد؛ در این حالت r یک ماتریسِ n×n
(n: تعداد مشاهدات) می­باشد که عناصر خارج قطری آن صفر و عناصر روی قطر برابر عکس تعداد تکرارِ ژنوتیپ­ها (مثلاً عکس تعداد تکرار ژنوتیپ یک در مجموعه­ی (سال× مکان) اول، ....) است.  و  به­ترتیب واریانس ژنتیکی و واریانس باقی­مانده هستند. ماتریس خویشاوندی یا Kinship بین ژنوتیپ­ها به کمک داده­های مولکولی SNP با نرم­افزار TASSEL محاسبه شد. از دو برابر ماتریس Kinship به­جای ماتریس روابط خویشاوندی A در مدل آمیخته استفاده شد. در برآورد ارزش اصلاحی، از اطلاعات مولکولی 73 ژنوتیپ استفاده شد. تجزیه خوشه­ای و رسم درخت­واره ژنوتیپ­ها بر اساس صفات مورفولوژیک و ارزش اصلاحی برآورد شده، همچنین مقایسه توزیع ژنوتیپ­ها در درخت­واره­ها با پکیچ­های dendextend،ape ، ade4 و adegenet در نرم­افزار R انجام گرفت.

 

نتایج و بحث

ارزیابی تنوع فنوتیپی

تجزیه واریانس تک­متغیره اختلاف معنی­داری بین ژنوتیپ­ها برای اکثر صفات مورد بررسی در هر یک از شرایط نرمال و تنش شوری نشان داد (فایل تکمیلی 2، 3 و 4) که بیانگر وجود تنوع در میان ژنوتیپ­های مورد مطالعه برای صفات مورد بررسی می­باشد. در این بررسی ضریب تغییرات در جدول تجزیه واریانس که نماد دقت آزمایش می­باشد بین 3808/4 تا 8590/60 متغیر بود (فایل تکمیلی 2، 3 و 4). ضریب تغییرات کم­تر از 30 بیانگر دقت بالای آزمایش می­باشد (Jayaraman, 1999). در صورت معنی­داری F تیمار، مقادیر بالای30 نیز برای ضریب تغییرات مورد قبول است (Xu et al., 2000; Zarei et al., 2007). در این شرایط اختلاف تیمارها (ژنوتیپ­ها) به حدی است که با وجود بالا­بودن خطای آزمایشی (که نسبت مستقیم با ضریب تغییرات و عکس با مقدار F آزمون دارد) باز آزمون  Fمعنی­دار شده است. بیشترین ضریب تغییرات در شرایط نرمال در صفت وزن چوب بلال (0210/63) و کمترین در صفت روز تا تاسل (9678/4) مشاهده شد. در شرایط تنش شوری بیشترین ضریب تغییرات در صفات وزن بلال بدون غلاف (8590/60) و وزن چوب بلال (5006/60) و کمترین در صفت روز تا بلال (3808/4) مشاهده شد. آماره­های توصیفی برای صفات تحت هر دو شرایط نرمال و تنش شوری در جدول (1) آورده شده است. صفت زاویه برگ تحت هر دو شرایط کمترین ضریب تغییرات فنوتیپی را دارا بود. وزن دانه در بلال اصلی تحت شرایط نرمال و فاصله پهنک برگ پرچم تا تاسل تحت شرایط تنش شوری از بیشترین ضریب تغییرات فنوتیپی برخوردار بودند که نشان از تنوع بالای این صفات در جمعیت مورد مطالعه می­باشد. استفاده از شاخص آماری ضریب تغییرات فنوتیپی به عنوان یک شاخص تعیین­کننده پراکندگی، به­جهت اینکه فاقد واحد بوده و میزان تنوع موجود در جمعیت را برای صفات مورد ارزیابی نشان می­دهد، دارای اهمیت ویژه در برنامه­های اصلاحی است.

 

 

جدول 1- آماره­های توصیفی صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال و تنش شوری.

Table 1. Descriptive statistics of studied traits in 73 maize genotypes under normal and salinity stress conditions.

Trait	Normal				Stress
	Mean	Std. Deviation	Coefficient of variation		Mean	Std Deviation	Coefficient of variation
Leaf angle	146.7626	9.2444	6.2988		144.8401	10.1909	7.0359
Total leaf surface	9982	4745	47.5355		9552	3795	39.7298
Dry weight of flag leaf	0.4896	0.2366	48.3251		0.4765	0.1935	40.6086
Distance from the flag leaf width to the tassel	4.8813	2.4991	51.1974		4.5388	2.6983	59.4496
Days to ear emergence	71.3858	6.1627	8.6329		66.3334	8.2953	12.5054
Days to tassel emergence	71.8493	6.8173	9.4883		119.668	24.7487	20.6811
Length of first node to tassel	16.1438	4.7213	29.2452		17.2957	4.7853	27.4952
Tassel length	27.0662	4.92190	18.1846		26.8610	4.3615	16.2372
Number of branches in tassel	6.0730	2.0148	33.17635		6.0365	1.7903	29.6579
Leaf number on ear	7.4520	1.0261	13.7694		7.4041	1.0844	14.6459
Number of grain rows per ear	11.4772	3.5480	30.9134		12.1438	3.3858	27.8808
Number of grain per row	14.977	7.1846	47.9708		15.6187	6.4739	41.4496
Grain weight in main ear	27.3433	19.4934	71.2913		27.1359	15.8578	58.4384
Aerial part weight of plant	282.4749	119.9402	42.4604		269.0137	79.7116	29.6310
Weight of ear together with pods	56.4618	31.9371	56.5640		57.0139	23.8255	41.7889
Weight of ear without pods	46.4806	30.50769	65.6353		46.5525	23.87086	51.277
Ear diameter without grain	18.643	4.4010	23.6067		18.5449	4.2460	22.8957
Cob's weight	5.6451	3.3866	59.9918		5.8386	3.10459	53.1735
Grain width	5.4234	1.0299	18.9899		5.5686	0.9723	17.4604
Grain diameter	8/0863	1.0334	12.7796		8.0134	0.9808	12.2394
Grain height	8.6719	1.6770	19.3383		8.5446	1.4410	16.8644
Chlorophyll rate	41.6876	7.6289	18.3001		40.5353	7.8729	19.4223
Canopy temperature	27.8890	3.2384	11.6117		29.150	2.4052	8.2511
Relative water content	78.5246	6.81642	8.6806		75.7620	8.3896	11.0736
Ion leakage	49.2993	24.2990	49.2887		37.5477	18.7567	49.9543

 

 

ارزیابی ژنوتیپی

استخراج DNA

نتایج ارزیابی کیفیت  DNAاستخراج­شده روی ژل آگارز یک درصد نشان­دهندة کیفیت بالای DNA استخراج­شده، به­منظور ارسال برای انجام توالی­یابی و ساخت کتابخانه ژنومی بود (فایل تکمیلی 5). در تجزیه کمیت DNA استخراجی با استفاده از دستگاه نانودراپ، نمونه­هایی که نسبتA260 / A280  آن­ها در محدوده 2-7/1 بود، جهت توالی­یابی ارسال شدند.

ژنوتیپ‌سنجی با استفاده از آرایه ژنوتیپ‌سنجی Affymetrix® Maize 600K

93 ژنوتیپ با تنوع فنوتیپی بالا به­منظور ژنوتیپ‌سنجی برای توالی­یابی ارسال شدند. پس از توالی‌یابی در نهایت 600 هزار نشانگر SNP چندشکل مشاهده شد که با اعمال ویرایش و حذف SNPهای دارای فراوانی آلل جزئی کمتر از 10 درصد تعداد 450133 نشانگر SNP باقی ماند. از این تعداد 449929 نشانگر SNP روی 10 کروموزوم ذرت تعیین موقعیت شدند. کرموزوم یک با 72226 و کروموزم 10 با 30596 نشانگر SNP به­ترتیب بیشترین و کمترین تعداد SNP را داشتند. به­طور کلی 21/67 درصد جایگزینی‌های نوکلئوتیدی مشاهده­شده با 302411 SNP به­صورت جایگزینی‌های همجنس (Ts) و حدود 79/32 درصد از جایگزینی‌های با 147518 SNP جایگزینی‌های نوکلوئیدی ناهمجنس (Tv) را شامل می­شدند (فایل تکمیلی 6). به نظر مشاهده فراوانی بالای جایگزینی همجنس در بسیاری از گونه‌ها مورد مطالعه، ناشی از تمایل جهش متیل سیتوزین به یوراسل باشد.

ارزش اصلاحی صفات

بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت زاویه برگ در ژنوتیپ R59 پدری (52/11) و پایین­ترین مقدار (^**80/16-) در ژنوتیپ P16L6 Kahriz مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای زاویه برگ به­ترتیب در ژنوتیپ­های R59 پدری (^*41/17) و مادری دابل کراس 370 (سینگل کراس) R319 × R59 (^**62/25-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت سطح برگ در 1 Line (^**73/8607) و پایین­ترین آن (^*41/6352-) در ژنوتیپ P11L7 مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای سطح برگ به­ترتیب در ژنوتیپ­های ژنوتیپ R59 پدری (^*58/5985) و K615/1 (47/3416-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای وزن خشک برگ پرچم در Line 1 (^*39/0) و پایین­ترین آن در ژنوتیپ W37A (^*34/0-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین­ترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای وزن خشک برگ پرچم در ژنوتیپ­های P16L12 Kahriz (^*29/0) و K1263/1/1388 (21/0-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت فاصله پهنک برگ پرچم تا تاسل در ژنوتیپ­های popcorn- 53 or 54 1390/ (^**50/6) و P16L12 Kahriz (88/2-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفت فاصله پهنک برگ پرچم تا تاسل به­ترتیب در ژنوتیپ­های N/88-K3653/2 36- (^**41/5) و ZK472221 (^*53/3-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8).

بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت روز تا بلال­دهی در ژنوتیپ P3 L2 (^**58/15) و برای روز تا تاسل­دهی در ژنوتیپ P19 L7 Kahriz (^*51/10) مشاهده شد. پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای روز تا بلال­دهی (55/7-) و روز تا تاسل­دهی (^**57/41-) در ژنوتیپ اندونزی S2/QPM/SUKMAا مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفات روز تا بلال­دهی به­ترتیب در ژنوتیپ­های P16L12 Kahriz (^**81/50) و R3L9 (^*55/12-) و برای روز تا تاسل­دهی به­ترتیب در ژنوتیپ­های P11L7 (^**61/45) و S2/QPM/SUKMA (^**97/56-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت طول اولین گره تا تاسل به­ترتیب در ژنوتیپ­های K615/1 (^*43/8) و P10L9 (^**14/10-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفت طول اولین گره تا تاسل به­ترتیب در ژنوتیپ­های 36-N/88-K3653/2 (^*32/8) و P3L4AKahriz (^*04/9-) مشاهده شد ( فایل تکمیلی 8). بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت تعداد خوشة تاسل در 2 Line (^**5) و پایین­ترین آن (45/2-) در ژنوتیپ W37A مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین ارزش اصلاحی برای تعداد خوشة تاسل در ژنوتیپ­های Line 2 (^**35/4) و پایین­ترین P15L14 (^*25/3-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت طول تاسل در P3 L2 (^**73/8607) و پایین­ترین آن در P11L7 (^*41/6352) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین ارزش اصلاحی برای طول تاسل در ژنوتیپ­های P16L12 Kahriz (^*30/6) و پایین­ترین آن در ژنوتیپ P1 L5 Kahriz (^*74/7-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8).

بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت تعداد برگ روی بلال در ژنوتیپP1 L4 Kahrizi  (^**01/2) و پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای تعداد برگ روی بلال (^**51/2-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفات تعداد برگ روی بلال به­ترتیب در ژنوتیپ­های 170*/1388 (^**22/2) و S2/QPM/SUKMA (^**74/2-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفات تعداد ردیف دانه در بلال در ژنوتیپ K1263/1/1388 (13/2)، برای تعداد دانه در ردیف در 19 Line (^**64/13) و برای وزن دانه در بلال اصلی در 19 Line (^**09/39) مشاهده شد. پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفات تعداد ردیف دانه در بلال (28/2-)، تعداد دانه در ردیف (^*54/11-) و وزن دانه در بلال اصلی (^*10/26-) در ژنوتیپ P15 L16 Kahriz مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفات تعداد ردیف دانه در بلال به­ترتیب در ژنوتیپ­های W37A (88/0) و P6 L1 (78/0-)، برای تعداد دانه در ردیف به­ترتیب در 7 Line (76/3) و ZK472221 (04/4-) و وزن دانه در بلال اصلی به­ترتیب در Line 7 (^*64/18) و ZK472221 (34/12-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8).

بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفات وزن بوته در 8 Line (^**37/226) برای وزن بلال با غلاف در 19 Line (^**36/60)، برای وزن بلال بدون غلاف در 19 Line (^**49/62) و برای قطر بلال بدون دانه در 6 Line (44/4) مشاهده شد. در مقابل، پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفات وزن بوته (^**15/234-)، وزن بلال با غلاف (^*35/47-)، وزن بلال بدون غلاف (21/38-) و قطر بلال بدون دانه (^*86/5-) در ژنوتیپ P19 L7 Kahriz مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفت وزن بوته به­ترتیب در 2 Line (^*31/117) و S2/QPM/SUKMA (^**75/156-)، برای وزن بلال با غلاف به­ترتیب در
 2 Line (^**95/42) و P14L1Kahriz (46/21-)، برای وزن بلال بدون غلاف به­ترتیب در 2 Line (^*30/37) و 1390/popcorn-53 0r 54 (48/15-) و برای قطر بلال بدون دانه به­ترتیب در ژنوتیپ­های
 2 Line (74/4) و P14L1 Kahriz (75/3-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8).

بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفات وزن چوب بلال در ژنوتیپ 6 (^**34/8) و پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای وزن چوب بلال P19 L7 Kahriz (^**18/3-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای وزن چوب بلال به­ترتیب در ژنوتیپ 2 (^**16/6) وP14L1 Kahriz (54/2-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8).

بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفات عرض دانه در ژنوتیپ ZK472221 (^*68/1) و پایین­ترین آن (^*49/1-) در ژنوتیپ P11L7 مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفات عرض دانه در ژنوتیپ­های P11L6 (^**14/0) و ZK472221 (^**12/0-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت قطر دانه به­ترتیب در ژنوتیپ­های 20 Line (27/1) و B73(RFC OR CMS) (^*56/1-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفت قطر دانه به­ترتیب در ژنوتیپ­های 10 Line (80/0) و P16 L12 (^*46/1-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت ارتفاع دانه در ژنوتیپ­های 13 Line (77/1) و 172* /89 (^**85/3-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). در شرایط تنش شوری بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی به­ترتیب در ژنوتیپ­های 13 Line (36/1) و P16 L12 Kahriz (36/1-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8).

بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت میزان کلروفیل در ژنوتیپ 23*/89 (^*41/10) و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای میزان کلروفیل در ژنوتیپ P19 L7 Kahriz (^**94/18-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفت میزان کلروفیل به­ترتیب در ژنوتیپ­های R59 (53/5) و P19 L7 Kahriz (^**01/20-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت دمایی کانوپی به­ترتیب در ژنوتیپ­های 73(RFC OR CMS) B (^**76/7) و 19 Line (61/3-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی صفت دمایی کانوپی به­ترتیب در ژنوتیپ­های P13L3 (87/2) و 6 Line (^*24/4-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت محتوای نسبی آب به­ترتیب در ژنوتیپ­های OH43/1-42 (^*70/9) و مادری دابل کراس 370 (سینگل کراس) R319 × R59 (^*15/9-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفت محتوای نسبی آب به­ترتیب در ژنوتیپ­های 16 Line (29/9) و 70*/1388 (^*50/13-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8). بالاترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت درصد نشت یونی در ژنوتیپ 7 Line (^**72/41) مشاهده شد. پایین­ترین ارزش اصلاحی تحت شرایط نرمال برای صفت نشت یونی (^*42/31-) در ژنوتیپ P16L6 Kahriz مشاهده شد (فایل تکمیلی 7). تحت شرایط تنش شوری، بالاترین و پایین­ترین ارزش اصلاحی برای صفت نشت یونی در ژنوتیپ­های اندونزی S2/QPM/SUKMA (75/42) و P9L3 Kahriz (67/16-) مشاهده شد (فایل تکمیلی 8).

با­ در­نظر­گرفتن مجموع ارزش­هایِ اصلاحیِ جمیع صفات مورد مطالعه در شرایط نرمال، ژنوتیپ­های Line 17، Line 4، Line 8 و Line 3 برترین رتبه را داشتند و به­عنوان ژنوتیپ­هایی باارزش اصلاحی بالا معرفی می­شوند و در مقابل، ژنوتیپ­های P19 L7 Kahriz، P15L4، W37A، P6 L1 و P14L1 Kahriz پایین­ترین رتبه را در بین ژنوتیپ­های مورد مطالعه داشتند. در شرایط تنش شوری، با ­در­نظر­گرفتن مجموع ارزش­های اصلاحی جمیع صفات مورد مطالعه، ژنوتیپ­های Line 3، Line 17، W153R، Line 9، Line 4 برترین رتبه را و ژنوتیپ­هایP6 L1، P19 L7 Kahriz و P14L1 Kahriz پایین­ترین رتبه را در بین ژنوتیپ­های مورد مطالعه داشتند. با­توجه­به­اینکه در دو شرایط نرمال و تنش، ژنوتیپ­های Line 17، 3 Line و 4 Line ارزش اصلاحی مثبت و نسبتاً بالایی برای صفات مورد مطالعه دارند؛ به­عنوان بهترین ژنوتیپ­ها از نظر ارزش اصلاحی صفات مورد بررسی معرفی می­شوند.

برآورد ارزش اصلاحی صفات موفولوژیک به­وسیله نشانگرها با استفاده از بهترین پیش­بینی نااُریب خطی (BLUP) در مطالعات گیاهی امروزه بسیار مورد توجه قرار گرفته است. اخیراً برآورد ارزش اصلاحی صفات پومولوژیک انگور بر اساس نشانگر مولکولی REMAP (Razi et al., 2021) و ارزیابی ارزش­های اصلاحی لاین­های Secondary Tritipyrum ایرانی تحت تنش شوری (Roudbari et al., 2017) انجام گرفته است. در یک مطالعه دیگر، Tahmasbali et al. (2019) ارزش اصلاحی صفات زراعی 89 ژنوتیپ توتون شرقی را در شرایط نرمال و تنش گل جالیز گزارش کردند. ایشان نتیجه گرفتند ژنوتیپی با عملکرد اقتصادی خوب، لزوماً از نظر ارزش اصلاحی بالا برخوردار نیست. از­این­رو استفاده از اطلاعات ارزش اصلاحی صفات را به­منظور افزایش کارایی برنامه­های اصلاحی علاوه­بر اطلاعات میانگین فنوتیپی لازم دانستند.

تجزیه به مؤلفه­های اصلی

در تجزیه به مؤلفه­های اصلی روی ارزش­های اصلاحی، تحت شرایط نرمال مؤلفه اول 3/38% و مؤلفه دوم 10% تغییرات را توجیه می­کنند. بر اساس دو مؤلفه اصلی اول ژنوتیپ Ma45 (B73(RFCORCMS)) بیشترین مقدار را داشت. در شرایط تنش شوری مؤلفه اول 8/28% و مؤلفه دوم 12% تغییرات را توجیه می­کنند. بر اساس دو مؤلفه اصلی اول Ma20 (P15L14) بیشترین مقدار را نشان داد (شکل 1).

بررسی گروه­بندی ژنوتیپ­ها بر اساس ارزش اصلاحی و ریختی

مقایسه درخت­واره ژنوتیپ­ها بر اساس میانگین فنوتیپی صفات با درخت­واره ارزش‌های اصلاحی برآوردشده تحت شرایط نرمال نشان داد در هر دو درخت­واره ژنوتیپ­ها در سه گروه مجزا قرار گرفتند. اما تحت شرایط تنش بر اساس میانگین فنوتیپی صفات ژنوتیپ­ها در دو گروه و بر اساس برآورد ارزش اصلاحی در سه گروه قرار گرفتند. در مقایسه دو درخت­واره ارزش اصلاحی و میانگین فنوتیپی صفات تحت شرایط نرمال 61/35 درصد و تحت شرایط تنش شوری 054/52 درصد از ژنوتیپ­ها در گروه‌های مشابهی قرار گرفتند (شکل 2). تحت شرایط نرمال ژنوتیپ­های مشترک در دو خوشه قرار گرفتند. خوشه اول شامل ژنوتیپ­های B/K19/1، OH43/1-42، R59ₓR319، 67*/88، 7/K19/1، 25*/89 و P19L3Khriz بود که بیشترین ارزش اصلاحی را در صفت دمایی کانوپی داشتند، و خوشه دوم شامل ژنوتیپ­های ZK472221، P9L3Kahriz، P13L3، دی­آلل P1L4Kahriz، Line9، p10l15، پدری R59، P11L6، Line8، Line2، Line19، Line17، Line14، Line12، Line20، Line3، Line1 وLine4  بود. اعضای این خوشه بیشترین ارزش اصلاحی را برای صفات عرض دانه، طول تاسل، تعداد برگ روی بلال، ارتفاع دانه و وزن خشک برگ پرچم نشان دادند. تحت شرایط تنش نیز ژنوتیپ­های مشابه در دو خوشه قرار گرفتند. خوشه اول از 37 عضو شامل ژنوتیپ­های R59ₓR319، p14l2، p11L7، B73(RFCORCMS)، P10L5، R319، 23*/89، P16L6Kahriz، W37A، P15L16Kahriz، 9/k19/1، 8/k19/1، P15L4، دی­آلل کرج P1L4Kahriz، W153R، P19L5Kahriz، P3L4Kahriz، Line16، Line6، Line3، Line19، Line14، Line17، Line1، Line6، Line9، Line10، P15L4، P13L1، P13L3، P11L9، R59، ایزوله K18-B/1392 و P16L12Kahriz بود و خوشه دوم تنها، شامل ژنوتیپ P11L2 بود. این ژنوتیپ در غالب صفات کمترین رتبه از نظر ارزش اصلاحی را دارا بود.

 

 

 

شکل 1- تجزیه به مؤلفه­های اصلی بر اساس ارزش های اصلاحی به­ترتیب، بالا تحت شرایط نرمال (سمت راست بر اساس ژنوتیپ­ها، سمت چپ بر اساس صفات)، پایین، تحت شرایط تنش شوری (سمت راست بر اساس ژنوتیپ­ها، سمت چپ بر اساس صفات).

Figure 1. Principal component analysis based on breeding values, respectively, above under normal conditions (right side based on genotypes, left side based on traits), bottom, under salt stress conditions (right side based on genotypes, left side based on traits) 

 

نتایج مقایسه نشان داد دو خوشه­بندی حاصل از ارزش اصلاحی برآورد­شده و داده­های فنوتیپی در شرایط تنش شوری بیشترین تشابه را در مقایسه با شرایط نرمال داشتند که تاییدی بر لزوم در­نظر­گرفتن ساختارهای ژنوتیپی در کنار بررسی داده­های فنوتیپی در انتخاب ژنوتیپ­ها است. همچنین مقایسه خوشه‌بندی بر اساس صفات فنوتیپی تحت شرایط تنش و نرمال نشان داد 39/27 درصد از ژنوتیپ­ها تحت هر دو شرایط در خوشه­بندی مشابه قرار گرفتند که شامل ژنوتیپ­های P11L7، P15L16Kahriz، K166B/89&(14*K)166B/1390)، 23*/89، P14L2، K18-B/1392، K19*/1392، W153R، P16L12Kahriz، B73(RFCORCMS) در خوشه اول و ژنوتیپ­های 4*/89، P19L7Kahriz، لاین 1390/POPCORN-53 0R54، K1263/1/1388، Line7، Line11، R59، 66*/1388، 70*/1388 و 36-N/88-K 3653/2 در خوشه دوم بود. بر اساس نتایج مقایسه خوشه‌بندی ارزش اصلاحی برآورد­شده تحت شرایط نرمال با تنش نیز 808/17 درصد ژنوتیپ­ها در خوشه­بندی مشابه قرار گرفتند که این ژنوتیپ­ها در دو خوشه؛ خوشه اول شامل Line 10، Line6، Line16، P15L4، P16L6Kohriz، P11L9، P13L1، 8/K19/1، R59 و R59ₓR319 و خوشه دوم شامل Line8 و Line20 بودند.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

شکل 2- گروه­بندی ژنوتیپ­ها بر اساس ارزش اصلاحی و مورفولوژیک. به­ترتیب از چپ به راست: گروه­بندی بر اساس صفات مورفولوژی در شرایط نرمال، گروه­بندی بر اساس ارزش اصلاحی برآورد شده در شرایط نرمال، گروه­بندی بر اساس صفات مورفولوژیکی در شرایط تنش شوری، گروه­بندی بر اساس ارزش اصلاحی برآورد شده در شرایط تنش شوری.

Figure 2. Grouping of genotypes based on breeding and morphological values. From left to right: Grouping based on morphological traits under normal conditions, grouping based on the estimated breeding values under normal conditions, grouping based on the morphological traits under salt stress conditions, grouping based on the estimated breeding values under salt stress conditions.

 

 

نتیجه­گیری کلی

با در­نظر­گرفتن مجموع ارزش­های اصلاحی جمیع صفات مورد مطالعه در شرایط نرمال ژنوتیپ­های 17، 4، 8 و 3 برترین رتبه و در شرایط تنش شوری ژنوتیپ­های 3، 17، W153R، 9 و 4 برترین رتبه را داشتند. با در­نظر­گرفتن هر دو شرایط نرمال و تنش شوری ژنوتیپ­های 17، 3 و 4 ارزش اصلاحی مثبت و نسبتاً بالایی برای صفات مورد مطالعه نشان دادند. ژنوتیپ­های با بالاترین ارزش اصلاحی بالاترین توان در انتقال صفات خود به نتاج را دارند؛ بنابراین می‌توانند به عنوان والد مطلوب برای اصلاح این صفات در برنامه‌های تلاقی استفاده شوند. نتایج مقایسه گروه­بندی بر اساس ارزش اصلاحی و فنوتیپی، اهمیت ارزش اصلاحی در گروه­بندی ژنوتیپ­ها را نشان می­دهد.

 

REFERENCES

1. Bauer, A. M., Reetz, T. C. & Léon, J. (2006). Estimation of breeding values of inbred lines using best linear unbiased prediction (BLUP) and genetic similarities. Crop Science, 46(6), 2685-2691.
2. Bernardo, R. & Yu, J. (2007). Prospects for genomewide selection for quantitative traits in maize. Crop Science, 47(3), 1082-1090.
3. Emdad, M.R. & Fardad, H. (2000). Effect of salt and water stress on corn yield production. Iranian Journal of Agriculture Science, 3(31), 641-654. (In Persian)
4. Fageria, N. K., Baligar, V. C. & Jones, C. A. (2010). Growth and mineral nutrition of field crops. 3rd Edition. CRC Press.
5. Falconer, D. S. & Mackay, T. F. C. (1996). Introduction to quantitative genetics. 4th Addison Wesley Longman, Harlow, Essex, UK.
6. Foulley, J.L. (2015). Mixed Model Methodology. Part I: Linear Mixed Models. Technical Report, e-print: DOI: 10.13140/2.1.3072.0320.
7. Hearn, S. (2014). 12th Asian Maize Conference and Expert Consultation on Maize for Food, Feed, Nutrition and Environmental Security. Bangkok, Thailand; 30 October – 1 November, 2014.
8. Henderson, C. R. (1990). Statistical methods in animal improvement: Historical overview. In Advances in statistical methods for genetic improvement of livestock. (pp. 2-14). Springer, Berlin, Heidelberg.
9. Isik, F., Holland, J. & Maltecca, C. (2017). Genetic data analysis for plant and animal breeding. 1st New York: Springer.
10. Jannink, J. L., Lorenz, A. J. & Iwata, H. (2010). Genomic selection in plant breeding: From theory to practice. Briefings in Functional Genomics, 9(2), 166-177.
11. Meyer, K. (2007). WOMBAT-A tool for mixed model analyses in quantitative genetics by restricted maximum likelihood (REML). Journal of Zhejiang University Science B, 8(11), 815-821.
12. Mohammadkhani, N. & Sharifi, P. (2016). Anti-oxidative response of different wheat genotypes to drought during anthesis. Iranian Journal of Plant Physiology, 6, 1845-1854.
13. Munns, R. & Tester, M. (2008). Mechanisms of salinity tolerance. Annual Review of Plant Biology, 59: 651-681.
14. Najafi, N., & Sarhangzadeh, E. (2012). Effect of NaCl salinity and soil waterlogging on growth characteristics of forage corn in greenhouse conditions. Journal of Soil and Plant Interactions, 3(2), 1-15.
15. Niu, L., Yuan, H., Gong, F., Wu, X., & Wang, W. (2018). Protein extraction methods shape much of the extracted proteomes. Frontiers in Plant Science, 9, 802.
16. Patterson, H.D. & Thompson, R. (1971). Recovery of inter-block information when block sizes are unequal. Biometrika, 58(3), 545-554.
17. Piepho, H. P. (2009). Ridge regression and extensions for genomewide selection in maize. Crop Science, 49(4), 1165-1176.
18. Piepho, H. P., Möhring, J., Melchinger, A. E. & Büchse, A. (2008). BLUP for phenotypic selection in plant breeding and variety testing. Euphytica, 161(1-2), 209-228.
19. Quintal, S.S.R., Viana, A.P., Campos, B., Vivas, M. & Amaral Junior, A.T. (2017). Selection via mixed models in segregating guava families based on yield and quality traits. Revista Brasileira de Fruticultura, 39(2), Doi.org/10.1590/0100-29452017866.
20. Ramos, H.C.C., Pereira, M.G., Viana, A.P., da Luz, L.N., Cardoso, D.L. & Ferreguetti, G.A. (2014). Combined selection in backcross population of papaya (Carica papaya ) by the mixed model methodology. American Journal of Plant Sciences, 5(20), 2973.
21. Razi, M., Darvishzadeh, R., Doulati Baneh, H., Amiri, M. E. & Martinez-Gomez, P. (2021). Estimating breeding value of pomological traits in grape cultivars based on REMAP molecular markers. Journal of Plant Productions, 44(4), 515-530. Doi: 22055/ppd.2020.34003.1925. ‏
22. Roudbari, Z., Mohammadi-Nejad, G. & Shahsavand-Hassani, H. (2017). Field screening of primary and secondary Tritipyrum genotypes using selection indices based on BLUP under saline and normal conditions. Crop Science, 57(3), 1495-1503.
23. Roy, S.J., Negrão, S. & Tester, M. (2014). Salt resistant crop plants. Curr Opin Biotechnol, 26, 115–124.
24. Saghai-Maroof, M. A., Soliman, K. M., Jorgensen, R. A. & Allard, R. W. (1984). Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barly mendelian inheritance, chromosomal location and population dynamics. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 81, 8014-8018.
25. Sajedi, N., & Ardekani, A. (2008). Effect of nitrogen fertilizer, iron on the physiological indices forage maize in central provinces. Iranian Journal of Field Crops Research, 6 (1), 99-110. (In Persian)
26. Shahzad, M., Witzel, K., Zörb, C., & Mühling, K. H. (2012). Growth‐related changes in subcellular ion patterns in maize leaves (Zea mays) under salt stress. Journal of Agronomy and Crop Science, 198(1), 46-56.
27. Tahmasbali, M., Darvishzadeh, R. & Fayaz Moghaddam, A. (2019). Estimating breeding value of agronomic traits in oriental tobacco genotypes under broomrape stress and normal conditions. Plant Genetic Researches, 7(1), 103-126.
28. Turan, M. A., Elkarim, A. H. A., & Taban, S. (2010). Effect of salt stress on growth and ion distribution and accumulation in shoot and root of maize plant. African Journal of Agricultural Research, 5(7), 584-588.
29. Xu, W., Subudhi, P. , Crasta, O. R., Rosenow, D. T., Mullet, J.E. & Nguyen, H. T. (2000). Molecular mapping of QTLs conferring stay-green in grain sorghum (Sorghum bicolor L. Moench). Genome, 43, 461- 469.
30. Yang, R.-C. (2010). Towards understanding and use of mixed-model analysis of agricultural experiments. Canadian Journal of Plant Science, 90, 605-627.
31. Yasmeen, A., Basra, S. M. A., Farooq, M., & Hussain, N. (2013). Exogenous application of moringa leaf extract modulates the antioxidant enzyme system to improve wheat performance under saline conditions. Plant Growth Regulation, 69(3), 225-233.
32. Zhao, Y., Li, Z., Liu, G., Jiang, Y., Maurer, H.P., Würschum, T., Mock, H.-P., Matros, A., Ebmeyer, E. & Schachschneider, R. (2015). Genome-based establishment of a high-yielding heterotic pattern for hybrid wheat breeding. Proceedings of the National Academy of Sciences, 112(51), 15624-15629.
33. Zarei, L., Farshadfar, E., Haghparast, R., Rajabi, R. & Mohammadi Sarab Badieh, M. (2007). Evaluation of some indirect traits and indices to identify drought tolerance in bread wheat (Triticum aestivum). Asian Journal of Plant Sciences, 6, 1204- 1210.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ضمائم:

فایل تکمیلی 1. ژنوتیپ­های ذرت مورد استفاده در آزمایش

Supplementary file 1. Maize genotypes used in the experiment

شماره No.	کد Code	نام Name	منشأ Origin
1	Ma001	P3L2	Kermanshah
2	Ma002	P11L2	Kermanshah
3	Ma003	P15L16Kahriz	Kermanshah
4	Ma004	P9L3Kahriz	Kermanshah
5	Ma005	P13L2	Kermanshah
6	Ma006	P19L7Kahriz	Kermanshah
7	Ma007	P6L1	Kermanshah
8	Ma008	P19L3Kahriz	Kermanshah
9	Ma009	P14L1Kahriz	Kermanshah
10	Ma010	P11L7	Kermanshah
11	Ma011	P14L2	Kermanshah
12	Ma012	P10L5	Kermanshah
13	Ma013	P1L4Kahriziدیالل کرج	Kermanshah
14	Ma014	P11L6	Kermanshah
15	Ma015	P13L3	Kermanshah
16	Ma017	P3L4Kahriz	Kermanshah
17	Ma018	p1L5kahriz	Kermanshah
18	Ma019	P19L5Kahriz	Kermanshah
19	Ma020	P15L14	Kermanshah
20	Ma021	P16L6Kahriz	Kermanshah
21	Ma022	P15L4	Kermanshah
22	Ma023	P11L9	Kermanshah
23	Ma025	P13L1	Kermanshah
24	Ma027	P16L12Kahriz	Kermanshah
25	Ma028	P10L9	Kermanshah
26	Ma030	Mo17	Kermanshah
27	Ma031	OH43/1-42	Kermanshah
28	Ma034	K615/1	Kermanshah
29	Ma036	OH43/1-42پدری	Karaj
30	Ma037	R59پدری	Karaj
31	Ma038	W37A	Karaj
32	Ma039	R319	Karaj
33	Ma040	R59	Karaj
34	Ma042	W153R	Karaj
35	Ma044	R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	Karaj
36	Ma045	B73(RFCORCMS)	Karaj
37	Ma048	ZK472221	Karaj
38	Ma049	K1263/1/1388	Mashhad
39	Ma050	4*/89	Mashhad
40	Ma051	9/K19/1	Mashhad
41	Ma053	25*/89	Mashhad
42	Ma060	S2/QPM/SUKMAاندونزی	Mashhad
43	Ma065	66*/1388	Mashhad
44	Ma072	K166B/89&(14*k166B/1390)	Mashhad
45	Ma073	K18-B/1392ایزوله	Mashhad
46	Ma074	7/K19/1	Mashhad
47	Ma075	23*/89	Mashhad
48	Ma076	70*/1388	Mashhad
49	Ma079	138*/89	Mashhad
50	Ma080	k19*/1392ایزوله	Mashhad
51	Ma085	1390/Popcorn-53or54خط	Mashhad
52	Ma089	172*/89	Mashhad
53	Ma091	8/K19/1	Mashhad
54	Ma096	67*/88	Mashhad
55	Ma100	36-N/88-K3653/2	Mashhad
56	Ma104	Line 1	-
57	Ma105	Line 2	-
58	Ma106	Line 3	-
59	Ma107	Line 4	-
60	Ma109	Line 6	-
61	Ma110	Line 7	-
62	Ma111	Line 8	-
63	Ma112	Line 9	-
64	Ma113	Line 10	-
65	Ma114	Line 11	-
66	Ma115	Line 12	-
67	Ma116	Line 13	-
68	Ma117	Line 14	-
69	Ma119	Line 16	-
70	Ma120	Line 17	-
71	Ma121	Line 18	-
72	Ma122	Line 19	-
73	Ma123	Line 20	-

 

فایل تکمیلی 2. تجزیه واریانس مرکب صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال و تنش شوری

Supplementary file 2. Combined analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under normal and salt stress conditions

Characteristics								Source of variation
Distance from the flag leaf width to the tassel	df	Dry weight of flag leaf	df	Total leaf surface	df	Leaf angle	df
12.55ns	1	0.02ns	1	27010611ns	1	401.90*	1	Environment
28.57***	72	0.19***	72	117959173	72	388.25***	72	Line
11.81***	72	0.09***	72	103393086ns	72	175.24***	72	Line × Environment
5.66	290	0.05	290	80594143	284	97.50	290	Error
50.40		42.98		87.56		6.77		Coefficient of variation

****، معنی­داری در سطح 1 ده هزارم درصد. ***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

Characteristics								Source of variation
Number of branches in tassel	df	Length of first node to tassel	df	Days to tassel emergence	df	Days to ear emergence	df
0.14ns	1	143.79***	1	239588.50***	1	405724.60***	1	Environment
16.23****	72	97.97***	72	1073.65***	72	94.31***	72	Line
5.30****	72	36.24***	72	875.29***	72	52.94***	72	Line × Environment
2.39	290	12.16	289	158.33	289	8.61	291	Error
25.48		20.85		13.19		2.84		Coefficient of variation

****، معنی­داری در سطح 1 ده هزارم درصد. ***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

 

 

 

Characteristics								Source of variation
Number of grain rows per ear	df	Number of seeds per row	df	Leaf number on ear	df	Tassel length	df
77.41ns	1	31.94ns	1	0.25ns	1	4.57ns	1	Environment
45.42*	72	153.68***	72	5.34***	72	105.18***	72	Line
23.07ns	72	50.45*	72	1.05*	72	21.33	72	Line × Environment
32.19	209	35.41	210	5.66	288	15.40	289	Error
46.25		37.88		11.69		14.55		Coefficient of variation

****، معنی­داری در سطح 1 ده هزارم درصد. ***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

Characteristics								Source of variation
Weight of ear together with pods	df	Weight of ear without pods	df	Aerial part weight of plant	df	Grain weight in main ear	df
29.44ns	1	0.49ns	1	19573.65*	1	3.31ns	1	Environment
3442.87***	72	3051.35***	72	54183.18***	72	977.05***	72	Line
971.54ns	72	1092.36*	72	7056.17***	72	396.53***	72	Line × Environment
771.94	257	792.95	259	3741.91	288	182.95	2	Error
48.35		59.42		22.11		48.34		Coefficient of variation

****، معنی­داری در سطح 1 ده هزارم درصد. ***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

Characteristics								Source of variation
Grain diameter	df	Seed width	df	Cob's weight	df	Ear diameter without grain	df
0.40ns	1	1.61ns	1	1.76ns	1	6/44ns	1	Environment
3.55***	72	2.92***	72	67.12***	72	131.19***	72	Line
0.80ns0	72	1.50ns	72	41.99ns	72	49.99ns	72	Line × Environment
0.870	205	1.62	206	35.66	255	40.30	205	Error
11.64		23.30		96.67		19.61		Coefficient of variation

****، معنی­داری در سطح 1 ده هزارم درصد. ***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

Characteristics								Source of variation
Relative water content	df	Canopy temperature	df	Chlorophyll rate	df	Grain height	df
0.14*	1	172.92***	1	144.39ns	1	9261.04***	1	Environment
0.13***	72	27.64***	72	266.97***	72	1700.18***	72	Line
0.05**	72	20.90***	72	77.66**	72	1385.12***	72	Line × Environment
0.33	273	5.64	290	55.85	290	150.89	205	Error
27.04		8.32		7.47		9.46		Coefficient of variation

****، معنی­داری در سطح 1 ده هزارم درصد. ***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

Characteristics	df	Source of variation
Ion leakage
15070.51***	1	Environment
1449.87***	72	Line
1366.41***	72	Line × Environment
221.17	291	Error
34.21		Coefficient of variation

****، معنی­داری در سطح 1 ده هزارم درصد. ***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 3. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال

Supplementary file 3. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under normal conditions

Source of variation	Leaf angle		Total leaf surface		Dry weight of flag leaf		Distance from the flag leaf width to the tassel
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	256.37***	72	67541315***	72	0.168***	72	18.74***
Error	146	94.48	146	15120878	146	0.042	146	5.32
CV		6.62		38.96		41.92		47.27

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 3. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال

Supplementary file 3. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under normal conditions

Source of variation	Days to ear emergence		Days to tassel emergence		Length of first node to tassel		Number of branches in tassel
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	109.44***	72	139.42***	72	66.87***	72	12.18***
Error	144	24.58	146	11.35	146	12.81	146	2.97
CV		6.96		4.68		22.17		28.38

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 3. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال

Supplementary file 3. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under normal conditions

Source of variation	Tassel length			Leaf number on ear		Number of seeds per row in ear			Number of grain rows per ear
	df	Mean square		df	Mean square		df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72		72.68***	72	3.13***		72	120.07***	72	25.81***
Error	146		14.10	144	0.711		109	25.41	108	12.16
CV			13.88		11.33			32.60		29.38

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 3. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال

Supplementary file 3. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under normal conditions

Source of variation	Grain weight in main ear		Aerial part weight of plant		Weight of ear without pods		Weight of ear together with pods
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	881.41***	72	42802.20***	72	2684.40***	72	2954.56***
Error	107	176.11	144	3509.51	133	756.35	133	758.35
CV		46.77		20.90		58.34		48.28

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

 

 

 

 

فایل تکمیلی 3. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال

Supplementary file 3. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under normal conditions

Source of variation	Ear diameter without grain		Cob's weight		Seed width		Grain diameter
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	52.29***	72	64.49*	72	2.53*	72	2.47***
Error	127	25.77	129	42.60	106	1.62	105	0.87
CV		27.20		106.40		23.40		11.54

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 3. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال

Supplementary file 3. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under normal conditions

Source of variation	Grain height			Chlorophyll rate	Canopy temperature			Relative water content
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df		Mean square
Genotype	72	5.74***	72	174.60***	72	31.46***		72		127.32***
Error	105	1.37	146	56.19	146	2.28		136		61.07
CV		13.37		17.99		5.42				9.96

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 3. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط نرمال

Supplementary file 3. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under normal conditions

Source of variation	Ion leakage
	df	Mean square
Genotype	72	1771.32***
Error	146	232.09
CV		30.90

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 4. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط تنش شوری

Supplementary file 4. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under salinity stress conditions

Source of variation	Leaf angle		Total leaf surface		Dry weight of flag leaf		Distance from the flag leaf width to the tassel
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	305.78***	72	153746668ns	72	0.11**	72	21. 61***
Error	144	100.56	144	146976759	144	0.044	144	5.100
CV		6.92		115.18		44.07		53.75

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

فایل تکمیلی 4. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط تنش شوری

Supplementary file 4. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under salinity stress conditions

Source of variation	Days to ear emergence		Days to tassel emergence		Length of first node to tassel		Number of Branches in Tassel
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	204.38***	72	1793.29***	72	67.65***	72	9.33***
Error	144	10.23	143	308.40	143	11.50	144	1.80
CV		4.35		14.74		19.56		22.13

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 4. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط تنش شوری

Supplementary file 4. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under salinity stress conditions

Source of variation	Tassel length		Leaf number on ear		Number of seeds per row		Number of grain rows per ear
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	53.77***	72	3.38***	72	88.86**	72	47.70ns
Error	143	16.74	144	0.80	101	46.22	100	53.62
CV		15.22		12.06		42.58		57.73

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

 

فایل تکمیلی 4. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط تنش شوری

Supplementary file 4. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under salinity stress conditions

Source of variation	Grain weight in main ear		Aerial part weight of plant		Weight of ear without pods		Weight of ear together with pods
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	498.79***	72	18722.07***	72	1543.54**	72	1567.19***
Error	100	190.27	144	3974.32	124	832.22	126	786.43
CV		50.01		23.37		60.54		48.44

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 4. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط تنش شوری

Supplementary file 4. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under salinity stress conditions

Source of variation	Ear diameter without grain		Cob's weight		Seed width		Grain diameter
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	46.97**	72	45.59*	72	1.99ns	72	1.97***
Error	125	27.54	126	28.56	100	1.64	100	0.89
CV		28.018		85.90		23.20		11.75

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 4. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط تنش شوری

Supplementary file 4. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under salinity stress conditions

Source of variation	Grain height			Chlorophyll rate	Canopy temperature		Relative water content
	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square	df	Mean square
Genotype	72	4.47***	72	172.58***	72	17.11***	72	197.19***
Error	100	1.88	144	55.51	173	9.03	1137	96.20
CV		15.88		18.31		10.31		12.94

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

فایل تکمیلی 4. تجزیه واریانس صفات مورد بررسی در 73 ژنوتیپ ذرت تحت شرایط تنش شوری

Supplementary file 4. Analysis of variance of studied traits in 73 maize genotypes under salinity stress conditions

Source of variation	Ion leakage
	df	Mean square
Genotype	72	1052.19***
Error	145	210.19
CV		38.54

***، معنی­دار در سطح 1هزارم درصد. **، معنی­داری در سطح 1 درصد. *، معنی­داری در سطح 5 درصد. ns، غیر­معنی­دار

 

 

فایل تکمیلی 5. باندهای مربوط به DNA استخراج شده بر روی ژل آگارز 1٪

Supplementary file 5. Extracted DNA bands on 1% agarose gel

 

فایل تکمیلی 6- خلاصه اطلاعات جهش‌های تک نوکلئوتیدی شناسایی شده در کروموزوم‌های مختلف ژنوتیپ­های ذرت

Supplementary file 6. A summary of single nucleotide substitutions identified in different chromosomes of maize genotypes

کروموزوم Chromosome	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	کل Total
SNPs	72226	54110	53906	50408	49153	34873	35489	35009	34159	30596	449929
A↔G	24212	17901	17876	16987	16329	11511	11955	11760	11356	10408	150295
T↔C	24225	18130	18358	17080	16612	11928	12000	11896	11597	10290	152116
جایگزینی هم جنس Transition	48437	36031	36234	34067	32941	23439	23955	23656	22953	20698	302411
Ts %	67.06	66.59	67.22	67.58	67.02	67.21	67.50	67.57	67.19	67.65	67.21
A↔T	4265	3184	3072	2868	2892	2011	2059	1998	2026	1688	26063
A↔C	6845	5141	5195	4755	4692	3277	3262	3253	3235	2919	42574
T↔G	6979	5214	5067	4796	4590	3296	3340	3311	3165	2882	42640
C↔G	5700	4540	4338	3922	4038	2850	2873	2791	2780	2409	36241
جایگزینی غیر هم جنس Transverion	23789	18079	17672	16341	16212	11434	11534	11353	11206	9898	147518
Tv %	32.94	33.41	32.78	32.42	32.98	32.79	32.50	32.43	32.81	32.35	32.79
Ts/Tv ratio	2.04	1.99	2.05	2.08	2.03	2.05	2.08	2.08	2.05	2.09	2.05

 

فایل تکمیلی 7- برآورد ارزش اصلاحی صفات بیوشیمیایی و مرتبط با دانه در ژنوتیپ­های ذرت (Zea mays L.) تحت شرایط نرمال بر اساس نشانگر مولکولی SNP

Supplementary file 7. Estimation of breeding value for studied biochemical and seed related traits in maize (Zea mays L.) genotypes based on SNP molecular marker under normal conditions

Name	Origin	LA	Rank	TLS	Rank	DWFL	Rank	DFLWT	Rank	DEE	Rank
P3L2	Kermanshah	0.23	36	-821.34	46	0.04	18	0.54	19	15.58**	73
P11L2	Kermanshah	2.27	25	-5009.88	5	-0.24	68	-0.93	44	1.31	44
P15L16Kahriz	Kermanshah	3.65	16	-5512.15	4	-0.01	22	-0.34	34	0.54	40
P9L3Kahriz	Kermanshah	3.59	17	2368.61	60	0.03	19	-0.16	32	3.54	58
P13L2	Kermanshah	5.08	13	-4594.94	11	-0.19	56	-1.47	55	-2.11	26
P19L7Kahriz	Kermanshah	-5.91	63	-4963.17	7	-0.23	61	-1.71	59	8.68*	70
P6L1	Kermanshah	-6.75	65	-4978.28	6	-0.24	67	-2.22	65	6.78	67
P19L3Kahriz	Kermanshah	-8.50	69	-3203.99	26	-0.15	42	0.91	14	1.53	47
P14L1Kahriz	Kermanshah	-2.77	52	-4257.26	15	-0.25	69	-2.47	68	4.30	63
P11L7	Kermanshah	-1.05	41	-6352.41*	1	-0.31	72	1.75	9	0.15	36
P14L2	Kermanshah	-3.23	54	-4174.25	17	-0.04	30	2.07	7	-3.17	20
P10L5	Kermanshah	3.00	21	1564.73	55	0.06	16	-2.18	64	4.12	62
P1L4Kahriziدیالل کرج	Kermanshah	1.12	32	2164.47	57	0.10	15	0.13	25	-2.07	27
P11L6	Kermanshah	-0.13	38	3073.26	63	0.05	17	-0.76	42	-3.88	17
P13L3	Kermanshah	-4.75	57	2263.15	58	0.24	4	1.46	11	1.40	45
P3L4Kahriz	Kermanshah	-8.12	68	-4157.01	18	-0.12	39	-1.84	61	5.59	65
p1L5kahriz	Kermanshah	-0.16	39	-5771.65	3	-0.23	62	-1.21	51	0.96	42
P19L5Kahriz	Kermanshah	-1.80	47	-93.27	52	-0.04	31	1.09	12	-3.13	22
P15L14	Kermanshah	2.51	24	-3689.42	23	-0.16	46	-1.20	50	2.55	53
P16L6Kahriz	Kermanshah	-16.80**	73	-1984.28	36	0.02	20	0.38	21	2.50	52
P15L4	Kermanshah	-1.24	42	-1994.88	35	-0.12	40	-2.50	69	-0.82	31
P11L9	Kermanshah	1.62	28	-2305.06	33	-0.19	52	-1.15	48	-6.96	2
P13L1	Kermanshah	7.68	5	-2153.53	34	-0.12	38	-2.59	71	-1.91	29
P16L12Kahriz	Kermanshah	-7.62	67	-3789.07	21	-0.17	49	-2.88	73	-4.47	12
P10L9	Kermanshah	0.21	37	4329.89	67	0.19	12	2.34	6	-5.73	7
Mo17	Kermanshah	-1.77	46	-4187.79	16	-0.23	64	-2.25	66	-0.55	33
OH43/1-42	Kermanshah	-5.85	62	-149.58	50	-0.10	35	0.09	26	2.35	51
K615/1	Kermanshah	4.83	14	-4062.70	20	-0.19	55	4.08	2	2.12	50
OH43/1-42پدری	Karaj	-5.82	61	-2334.68	32	-0.17	48	0.66	18	-0.49	34
R59پدری	Karaj	11.52	1	2827.16	61	0.21	8	-1.71	60	0.55	41
W37A	Karaj	-9.69	70	-4921.37	8	-0.34	73	-1.31	52	1.41	46
R319	Karaj	-5.39	59	-1178.37	43	-0.19	54	2.02	8	-5.37	8
R59	Karaj	2.71	23	252.15	53	-0.03	27	-1.63	56	-5.98	6
W153R	Karaj	3.18	19	-3543.88	24	-0.18	51	-1.19	49	0.20	38
R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	Karaj	6.25	8	-2518.93	30	-0.24	65	-2.05	63	7.68	69
B73(RFCORCMS)	Karaj	-10.48	72	-4752.93	10	-0.23	60	-0.93	43	4.61	64
ZK472221	Karaj	-7.11	66	2279.68	59	-0.02	25	0.07	27	-6.48	4
K1263/1/1388	Mashhad	9.08	3	-1566.18	38	-0.20	58	-0.03	29	-5.21	10
4*/89	Mashhad	-3.31	55	-1755.30	37	-0.20	59	-1.37	53	-2.02	28
9/K19/1	Mashhad	-4.19	56	-443.57	48	-0.10	37	-1.13	47	0.16	37
25*/89	Mashhad	-5.59	60	-2931.57	27	-0.24	66	-1.44	54	-3.78	18
S2/QPM/SUKMAاندونزی	Mashhad	-0.41	40	-1545.37	39	-0.02	23	0.32	22	-7.55	1
66*/1388	Mashhad	2.86	22	-1186.20	42	-0.10	36	-2.60	72	-0.66	32
K166B/89&(14*k166B/1390)	Mashhad	-1.95	48	-4885.82	9	-0.26	71	-0.60	40	3.33	57
K18-B/1392ایزوله	Mashhad	1.66	27	-4456.66	13	-0.19	53	-2.37	67	6.98	68
7/K19/1	Mashhad	1.61	29	-2865.92	28	-0.17	50	-0.47	38	3.59	60
23*/89	Mashhad	-10.21	71	-4141.42	19	-0.13	41	-0.44	37	-2.56	24
70*/1388	Mashhad	-5.25	58	-584.94	47	-0.03	26	3.21	4	3.58	59
138*/89	Mashhad	8.12	4	-5840.66	2	-0.26	70	0.01	28	2.75	54
k19*/1392ایزوله	Mashhad	-2.97	53	-4504.05	12	-0.23	63	-1.69	58	0.99	43
1390/Popcorn-53or54خط	Mashhad	-2.30	50	-439.05	49	-0.07	34	6.50	1	9.98*	72
172*/89	Mashhad	0.51	35	-3749.31	22	-0.15	44	0.15	24	3.24	56
8/K19/1	Mashhad	-1.51	44	-2537.44	29	-0.15	43	-1.66	57	1.62	49
67*/88	Mashhad	-6.45	64	-2422.33	31	-0.16	45	-0.29	33	9.38*	71
36-N/88-K3653/2	Mashhad	6.70	7	-108.68	51	-0.06	33	3.34	3	-3.15	21
Line 1	-	1.45	30	8607.73**	73	0.39	1	-0.40	35	-6.93	3
Line 2	-	7.35	6	3638.62	64	0.25	3	0.69	17	-4.17	14
Line 3	-	5.15	12	5093.58	71	0.19	11	1.71	10	-3.64	19
Line 4	-	5.45	11	7859.01*	72	0.36	2	-0.10	30	-4.90	11
Line 6	-	2.19	26	-1042.91	45	-0.02	24	-2.59	70	-0.04	35
Line 7	-	5.52	9	275.15	54	0.00	21	0.40	20	1.54	48
Line 8	-	3.21	18	2945.67	62	0.21	9	0.70	16	-2.41	25
Line 9	-	-2.59	51	1770.57	56	0.11	13	1.00	13	5.91	66
Line 10	-	-2.22	49	-1080.75	44	-0.04	28	0.82	15	-6.32	5
Line 11	-	10.36	2	-1331.33	41	-0.04	29	-1.93	62	-2.84	23
Line 12	-	1.11	33	4012.79	65	0.11	14	-0.43	36	-4.07	16
Line 13	-	5.48	10	-4303.72	14	-0.17	47	-0.59	39	-5.28	9
Line 14	-	-1.48	43	4633.99	69	0.23	6	-1.10	46	3.04	55
Line 16	-	-1.75	45	-1379.57	40	-0.05	32	2.79	5	0.41	39
Line 17	-	3.15	20	4522.56	68	0.23	5	0.19	23	-4.32	13
Line 18	-	1.09	34	-3477.45	25	-0.19	57	-0.13	31	3.74	61
Line 19	-	3.89	15	4217.26	66	0.20	10	-0.70	41	-1.51	30
Line 20	-	1.42	31	5052.28	70	0.22	7	-0.95	45	-4.11	15

DTE: Days to tassel emergence, DEE: Days to ear emergence, Ch: Chlorophyll rate, Il: Ion leakage, TLS: Total leaf surface, RWC: Relative water content, APWP: Aerial part weight of plant, WETP: Weight of ear together with pods, NGRE: Number of grain rows per ear, GD: Grain diameter, GW: Grain width, GH: Grain height, CW: Cob's weight, CT: Canopy temperature, EDWG: Ear diameter without grain, DFLWT: Distance from the flag leaf width to the tassel, DWFL: Dry weight of flag leaf, LANG: Leaf angle, LFNT: Length of first node to tassel, LNE: Leaf number on ear, NGR: Number of grain per row, NBT: Number of Branches in Tassel, TL: Tassel length, WEWoutP: Weight of ear without pods, GWME: Grain weight in main ear. *and **: Not-significant and significant at 5% and 1% probability levels, respectively.

 

فایل تکمیلی 7- برآورد ارزش اصلاحی صفات بیوشیمیایی و مرتبط با دانه در ژنوتیپ­های ذرت (Zea mays L.) تحت شرایط نرمال بر اساس نشانگر مولکولی SNP

Supplementary file 7. Estimation of breeding value for studied biochemical and seed related traits in maize (Zea mays L.) genotypes based on SNP molecular marker under normal conditions

Name	DTE	Rank	LFNT	Rank	NBT	Rank	TL	Rank	LNE	Rank	NGRE	Rank	NGR	Rank
P3L2	2.06	47	2.80	12	1.03	17	2.49	12	0.13	12	-1.52	5	-6.00	61
P11L2	-2.40	18	-2.05	48	-1.95	66	-3.12	48	0.63	48	-0.28	20	-4.62	56
P15L16Kahriz	3.39	53	-0.10	28	-2.03	67	-9.16**	73	0.64	28	-2.28	1	-11.54*	73
P9L3Kahriz	6.29	68	1.85	16	-1.31	58	-1.81	38	0.61	16	0.16	30	2.98	16
P13L2	2.48	48	0.68	22	-1.21	54	-1.94	39	0.61	22	0.66	52	-1.70	42
P19L7Kahriz	10.51*	73	-7.26*	69	2.02	7	-8.65*	70	-1.99	69	-0.96	9	-7.62	64
P6L1	5.03	63	-5.49	66	-1.89	65	-4.10	57	-0.52	66	-2.04	2	-8.73*	68
P19L3Kahriz	-0.01	34	1.17	18	-0.45	35	-3.47	52	0.10	18	0.26	34	-0.08	33
P14L1Kahriz	3.65	56	-4.85	63	-2.11	68	-3.28	50	-1.51	63	-0.39	18	-5.78	60
P11L7	1.00	41	5.62	2	-0.87	43	6.52*	2	0.91	2	0.45	40	5.33	11
P14L2	1.59	43	4.51	6	1.46	12	-2.78	45	-0.21	6	0.37	35	6.49	9
P10L5	2.68	50	-1.44	43	0.23	21	2.48	13	0.43	43	-0.26	23	2.25	21
P1L4Kahriziدیالل کرج	-0.31	31	0.99	20	-0.31	31	1.82	15	2.01	20	-1.24	7	-5.51	58
P11L6	-0.28	32	-1.28	42	1.35	14	0.32	26	0.43	42	0.62	50	7.92	6
P13L3	-0.08	33	3.38	8	-0.05	28	0.25	27	0.21	8	0.57	46	7.14	7
P3L4Kahriz	2.49	49	-3.80	58	-1.49	60	-2.23	42	0.54	58	1.20	62	-1.45	39
p1L5kahriz	2.81	51	-4.00	60	-1.88	64	-8.82**	72	1.05	60	1.90	71	-2.89	45
P19L5Kahriz	-4.88	7	-0.59	35	3.50*	2	-3.07	47	-0.66	35	0.48	42	0.32	31
P15L14	5.59	66	-3.03	55	-1.29	56	-5.90	66	1.96	55	-0.78	14	-7.84	66
P16L6Kahriz	0.60	38	0.20	26	-2.36	71	-2.30	43	-0.05	26	-0.27	21	-4.04	53
P15L4	-4.66	8	-3.09	57	-1.14	51	-3.40	51	0.33	57	-0.95	11	-7.68	65
P11L9	-3.81	11	-2.69	54	-0.93	45	0.85	22	-0.63	54	0.09	28	-0.02	32
P13L1	-0.89	26	-1.60	44	-0.65	37	-2.35	44	0.03	44	-0.96	10	-2.20	43
P16L12Kahriz	-2.91	14	-4.57	62	0.21	23	3.43	6	-0.34	62	0.60	49	0.84	28
P10L9	-6.04	4	-10.14**	73	0.45	19	0.14	29	0.05	73	-0.84	13	2.17	23
Mo17	-6.20	3	-3.98	59	-0.26	30	-5.36	64	0.10	59	0.40	36	-1.05	37
OH43/1-42	3.84	61	0.20	25	-1.13	50	1.06	20	0.54	25	-0.77	15	-6.84	62
K615/1	3.65	55	8.43*	1	-0.87	42	-1.28	34	0.97	1	0.59	47	2.79	18
OH43/1-42پدری	1.98	45	-2.50	52	-1.21	53	-2.17	41	0.37	52	-0.37	19	-4.58	55
R59پدری	0.81	39	0.27	24	-0.82	40	-3.06	46	0.37	24	1.27	64	-0.52	35
W37A	-1.66	21	-9.34**	72	-2.45	73	-8.81**	71	-0.75	72	0.05	27	-4.36	54
R319	-8.45	2	1.14	19	-2.33	70	-6.99*	68	-1.18	19	0.22	33	-1.37	38
R59	0.06	35	-1.12	39	1.98	9	-4.52	58	-0.02	39	0.45	39	-0.42	34
W153R	-2.89	15	-8.70*	71	-0.67	38	0.55	23	0.96	71	0.83	56	0.42	30
R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	-4.22	10	-2.13	49	-0.43	34	-3.89	56	-0.19	49	-1.74	3	-9.44	72
B73(RFCORCMS)	4.50	62	-5.71	67	-1.30	57	-4.79	62	0.35	67	1.47	69	-3.50	49
ZK472221	-5.18	6	-4.50	61	1.74	10	1.63	16	-2.32	61	-0.11	25	-8.81*	69
K1263/1/1388	-4.40	9	-7.32*	70	1.11	16	-3.80	54	-0.92	70	2.13	73	0.49	29
4*/89	-3.53	13	-5.79	68	-0.89	44	-1.47	35	0.58	68	1.30	66	2.29	20
9/K19/1	-0.68	27	-1.98	46	-1.19	52	-3.19	49	-0.32	46	1.83	70	-2.97	46
25*/89	-3.54	12	-1.79	45	-2.38	72	-4.64	59	-0.19	45	1.29	65	-1.48	40
S2/QPM/SUKMAاندونزی	-41.57**	1	-1.18	40	-1.25	55	-3.79	53	-2.51	40	-1.73	4	-9.42*	71
66*/1388	1.45	42	-0.62	36	-0.31	32	3.08	9	-0.07	36	-0.66	16	-7.04	63
K166B/89&(14*k166B/1390)	6.87	70	2.22	13	-1.03	48	0.97	21	0.12	13	0.75	54	3.79	15
K18-B/1392ایزوله	6.11	67	-3.05	56	-1.67	63	-1.77	37	0.02	56	-0.02	26	-5.22	57
7/K19/1	3.79	60	-0.58	34	-1.51	61	-2.04	40	-0.88	34	1.17	61	1.38	26
23*/89	-2.47	17	0.80	21	-0.16	29	2.76	11	0.92	21	0.65	51	2.41	19
70*/1388	7.01	71	-2.42	51	-1.43	59	-3.88	55	0.95	51	1.40	67	-2.24	44
138*/89	3.03	52	-2.04	47	-1.61	62	-4.72	60	0.75	47	0.20	32	-3.50	50
k19*/1392ایزوله	-1.64	22	-2.40	50	0.22	22	-4.72	61	0.18	50	0.55	45	-0.66	36
1390/Popcorn-53or54خط	6.71	69	5.07	5	-0.39	33	1.51	17	-0.81	5	0.81	55	-3.20	48
172*/89	3.72	59	-2.62	53	-0.84	41	0.18	28	-0.63	53	-0.48	17	-7.90	67
8/K19/1	5.27	64	-5.20	65	-2.17	69	-7.36*	69	0.15	65	1.43	68	-3.63	51
67*/88	3.67	57	-0.74	37	-1.07	49	0.55	24	0.44	37	-1.29	6	-5.75	59
36-N/88-K3653/2	-2.04	20	5.49	3	2.20	3	-0.28	31	-0.07	3	-0.89	12	-8.91	70
Line 1	-0.41	30	0.18	27	1.23	15	6.42*	3	-0.41	27	0.10	29	-1.48	41
Line 2	-5.28	5	-0.18	29	5.00**	1	3.15	8	-0.19	29	0.84	57	2.81	17
Line 3	0.92	40	5.25	4	2.00	8	5.25	4	-0.26	4	0.45	41	3.80	14
Line 4	-1.40	23	3.26	10	2.16	4	4.27	5	-0.30	10	0.60	48	8.15*	4
Line 6	0.16	36	-1.10	38	1.72	11	-0.34	33	0.99	38	1.06	60	8.12	5
Line 7	3.67	58	2.08	15	1.39	13	3.01	10	0.33	15	0.41	38	6.69	8
Line 8	5.29	65	3.33	9	0.19	24	-1.51	36	-0.11	9	1.25	63	4.58	13
Line 9	3.62	54	-0.23	31	0.11	26	-4.96	63	-0.07	31	-0.13	24	1.39	25
Line 10	-0.57	28	-0.21	30	-0.63	36	1.39	18	-0.16	30	0.74	53	-3.67	52
Line 11	-1.09	25	-1.24	41	0.89	18	-0.05	30	-0.90	41	0.53	44	-3.11	47
Line 12	-2.64	16	2.87	11	-0.71	39	-0.32	32	0.13	11	-0.26	22	4.85	12
Line 13	-1.21	24	-0.36	32	0.11	25	-5.91	67	-0.93	32	0.41	37	6.31	10
Line 14	1.99	46	0.66	23	-0.03	27	1.35	19	-0.40	23	0.50	43	8.73*	3
Line 16	1.79	44	4.16	7	0.43	20	0.35	25	-0.16	7	-1.03	8	0.93	27
Line 17	-2.29	19	2.21	14	2.10	5	3.18	7	0.04	14	0.94	58	10.46*	2
Line 18	8.13	72	-4.86	64	-0.97	47	-5.85	65	0.39	64	2.05	72	2.22	22
Line 19	-0.48	29	1.84	17	-0.95	46	7.52*	1	-0.11	17	0.98	59	13.64**	1
Line 20	0.28	37	-0.47	33	2.07	6	2.23	14	-0.38	33	0.17	31	1.94	24

DTE: Days to tassel emergence, DEE: Days to ear emergence, Ch: Chlorophyll rate, Il: Ion leakage, TLS: Total leaf surface, RWC: Relative water content, APWP: Aerial part weight of plant, WETP: Weight of ear together with pods, NGRE: Number of grain rows per ear, GD: Grain diameter, GW: Grain width, GH: Grain height, CW: Cob's weight, CT: Canopy temperature, EDWG: Ear diameter without grain, DFLWT: Distance from the flag leaf width to the tassel, DWFL: Dry weight of flag leaf, LANG: Leaf angle, LFNT: Length of first node to tassel, LNE: Leaf number on ear, NGR: Number of grain per row, NBT: Number of Branches in Tassel, TL: Tassel length, WEWoutP: Weight of ear without pods, GWME: Grain weight in main ear. *and **: Not-significant and significant at 5% and 1% probability levels, respectively.

 

فایل تکمیلی 7- برآورد ارزش اصلاحی صفات بیوشیمیایی و مرتبط با دانه در ژنوتیپ­های ذرت (Zea mays L.) تحت شرایط نرمال بر اساس نشانگر مولکولی SNP

Supplementary file 7. Estimation of breeding value for studied biochemical and seed related traits in maize (Zea mays L.) genotypes based on SNP molecular marker under normal conditions

Name	Origin	GWME	Rank	APWP	Rank	WETP	Rank	WEWoutP	Rank	EDWG	Rank
P3L2	Kermanshah	-6.94	39	30.30	56	-20.23	28	-16.18	45	-2.38	62
P11L2	Kermanshah	-15.41	55	-232.98**	2	-34.10	8	-35.91	71	-1.50	43
P15L16Kahriz	Kermanshah	-26.10*	73	-91.62	31	-40.26	2	-36.72	72	-3.80	72
P9L3Kahriz	Kermanshah	2.09	19	16.68	50	-10.83	40	-9.38	33	-1.74	51
P13L2	Kermanshah	1.31	22	20.84	53	7.34	53	5.10	23	-0.03	24
P19L7Kahriz	Kermanshah	-19.79	64	-234.15**	1	-47.35*	1	-38.21	73	-5.86*	73
P6L1	Kermanshah	-22.58	69	-165.42*	8	-34.58	7	-29.55	64	-1.85	52
P19L3Kahriz	Kermanshah	-14.88	54	-151.08*	12	-21.80	24	-18.96	50	-2.93	64
P14L1Kahriz	Kermanshah	-12.47	50	-168.65*	7	-34.00	9	-27.28	62	-3.33	67
P11L7	Kermanshah	18.56	8	60.49	59	10.54	57	6.99	21	-0.08	25
P14L2	Kermanshah	12.67	11	28.97	55	20.19	63	20.99	10	-1.07	39
P10L5	Kermanshah	3.50	17	142.93	69	7.40	54	11.05	17	-2.05	57
P1L4Kahriziدیالل کرج	Kermanshah	-19.57	63	75.30	63	-33.11	11	-30.99	67	-2.29	59
P11L6	Kermanshah	18.90	7	-48.80	39	21.20	65	22.07	7	1.07	13
P13L3	Kermanshah	22.91	5	124.18	68	16.50	60	8.78	19	-0.19	29
P3L4Kahriz	Kermanshah	-12.45	49	-94.54	28	-16.61	31	-12.50	38	-0.94	35
p1L5kahriz	Kermanshah	-13.19	51	-146.82	14	-14.98	35	-12.92	40	0.52	21
P19L5Kahriz	Kermanshah	-6.56	38	-144.07	15	-19.37	30	-14.12	42	-0.40	31
P15L14	Kermanshah	-20.60	68	-23.92	45	-29.69	13	-28.66	63	-1.92	54
P16L6Kahriz	Kermanshah	-19.04	61	-43.10	40	-26.32	18	-22.19	57	-1.59	48
P15L4	Kermanshah	-19.99	66	-153.20*	11	-37.47	6	-29.94	65	-3.69	71
P11L9	Kermanshah	-3.16	32	-140.02	16	-27.25	16	-21.22	53	-3.32	66
P13L1	Kermanshah	-5.35	35	-84.37	34	-15.28	34	-12.40	37	-1.97	55
P16L12Kahriz	Kermanshah	-11.99	47	-117.60	20	-24.37	20	-20.34	52	-1.57	47
P10L9	Kermanshah	3.19	18	-80.35	36	-0.14	48	2.28	25	-0.15	28
Mo17	Kermanshah	-11.43	46	-137.83	18	-28.48	14	-22.64	58	-3.35	69
OH43/1-42	Kermanshah	-17.96	57	35.15	57	-16.22	32	-17.66	49	-2.27	58
K615/1	Kermanshah	0.75	24	-94.15	29	2.77	49	2.34	24	1.71	7
OH43/1-42پدری	Karaj	-10.30	43	-23.59	46	-10.83	41	-9.46	34	-1.51	44
R59پدری	Karaj	1.26	23	-98.04	26	7.62	56	10.04	18	2.35	5
W37A	Karaj	-14.71	53	-186.42*	5	-27.37	15	-24.09	59	-3.53	70
R319	Karaj	-5.76	36	-181.57*	6	-20.98	27	-16.92	48	-0.62	33
R59	Karaj	-0.69	26	-92.38	30	-8.27	42	-13.12	41	0.53	20
W153R	Karaj	-1.49	28	11.65	49	-0.84	47	0.85	26	1.27	11
R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	Karaj	-19.33	62	-113.39	21	-31.59	12	-31.22	68	-1.57	46
B73(RFCORCMS)	Karaj	-17.26	56	-155.16*	10	-21.56	25	-16.01	43	-0.97	36
ZK472221	Karaj	-18.78	59	-111.15	23	-13.32	37	-16.80	47	1.17	12
K1263/1/1388	Mashhad	-9.63	42	-191.92*	4	-21.45	26	-16.14	44	0.02	23
4*/89	Mashhad	-0.12	25	-81.32	35	4.23	50	6.19	22	2.27	6
9/K19/1	Mashhad	-1.63	29	-107.25	25	-6.47	43	-1.64	27	-1.18	40
25*/89	Mashhad	-5.96	37	-148.16	13	-15.63	33	-12.75	39	0.06	22
S2/QPM/SUKMAاندونزی	Mashhad	-24.40*	72	-201.45*	3	-39.91	3	-35.13	70	-2.36	61
66*/1388	Mashhad	-12.03	48	-31.48	42	-22.98	22	-20.07	51	-1.57	45
K166B/89&(14*k166B/1390)	Mashhad	-2.97	30	-97.70	27	-5.03	46	-6.82	30	-1.04	38
K18-B/1392ایزوله	Mashhad	-18.83	60	-135.19	19	-23.36	21	-21.91	56	-3.33	68
7/K19/1	Mashhad	-14.68	52	-108.26	24	-33.50	10	-27.03	61	-2.66	63
23*/89	Mashhad	-3.03	31	-78.57	37	-22.05	23	-16.40	46	-1.29	42
70*/1388	Mashhad	-3.68	33	-37.21	41	-5.39	45	-5.03	29	-0.97	37
138*/89	Mashhad	-20.32	67	-162.60*	9	-25.60	19	-24.21	60	-1.71	50
k19*/1392ایزوله	Mashhad	-4.07	34	6.50	48	-6.18	44	-4.93	28	-1.68	49
1390/Popcorn-53or54خط	Mashhad	-10.79	45	-137.95	17	-26.98	17	-21.30	54	-0.14	27
172*/89	Mashhad	-23.47	71	-88.79	32	-39.59	4	-33.47	69	-1.97	56
8/K19/1	Mashhad	-8.72	41	-87.04	33	-14.94	36	-9.59	35	-0.82	36
67*/88	Mashhad	-19.85	65	-112.76	22	-38.28	5	-30.21	66	-3.30	65
36-N/88-K3653/2	Mashhad	-22.65	70	16.88	51	-19.77	29	-21.37	55	1.46	9
Line 1	-	10.40	13	220.69**	72	26.16	67	21.90	8	0.92	15
Line 2	-	17.10	9	190.54*	71	30.21	68	17.30	12	1.44	10
Line 3	-	4.98	16	69.52	61	12.58	58	15.49	13	0.63	19
Line 4	-	13.38	10	161.64*	70	24.75	66	27.81	5	1.04	14
Line 6	-	25.59*	4	115.99	66	58.28**	72	56.58**	2	4.44	1
Line 7	-	1.47	20	72.51	62	7.48	55	11.33	16	-0.56	32
Line 8	-	22.89	6	226.37**	73	31.58	69	27.02	6	0.71	18
Line 9	-	-10.52	44	89.04	64	-11.23	39	-8.56	31	-2.35	60
Line 10	-	-0.92	27	64.03	60	20.82	64	18.98	11	3.14	2
Line 11	-	-18.37	58	-24.49	44	4.59	51	-8.77	32	-0.11	26
Line 12	-	6.63	15	-54.70	38	4.81	52	8.70	20	0.77	17
Line 13	-	28.55*	3	19.15	52	19.01	62	21.07	9	-1.26	41
Line 14	-	9.77	14	90.32	65	35.26	70	34.74	4	-0.33	30
Line 16	-	-7.36	40	49.36	58	-13.25	38	-10.50	36	-1.89	53
Line 17	-	29.65*	2	21.34	54	39.04*	71	39.01*	3	1.62	8
Line 18	-	1.38	21	-11.63	47	16.58	61	15.33	14	2.43	4
Line 19	-	39.09**	1	121.74	67	60.36**	73	62.49**	1	2.58	3
Line 20	-	10.97	12	-28.51	43	13.09	59	14.56	15	0.86	16

DTE: Days to tassel emergence, DEE: Days to ear emergence, Ch: Chlorophyll rate, Il: Ion leakage, TLS: Total leaf surface, RWC: Relative water content, APWP: Aerial part weight of plant, WETP: Weight of ear together with pods, NGRE: Number of grain rows per ear, GD: Grain diameter, GW: Grain width, GH: Grain height, CW: Cob's weight, CT: Canopy temperature, EDWG: Ear diameter without grain, DFLWT: Distance from the flag leaf width to the tassel, DWFL: Dry weight of flag leaf, LANG: Leaf angle, LFNT: Length of first node to tassel, LNE: Leaf number on ear, NGR: Number of grain per row, NBT: Number of Branches in Tassel, TL: Tassel length, WEWoutP: Weight of ear without pods, GWME: Grain weight in main ear. *and **: Not-significant and significant at 5% and 1% probability levels, respectively.

 

فایل تکمیلی 7- برآورد ارزش اصلاحی صفات بیوشیمیایی و مرتبط با دانه در ژنوتیپ­های ذرت (Zea mays L.) تحت شرایط نرمال بر اساس نشانگر مولکولی SNP

Supplementary file 7. Estimation of breeding value for studied biochemical and seed related traits in maize (Zea mays L.) genotypes based on SNP molecular marker under normal conditions

Name	GW	Rank	GD	Rank	GH	Rank	Chl	Rank	CT	Rank	RWC	Rank	IL	Rank	Sum of ranks
P3L2	0.00	37	0.92	71	0.70	52	-7.16	7	1.07	35	-2.62	7	18.85	56	485
P11L2	.00	38	-0.40	31	-0.79	18	-5.49	13	-0.41	45	-2.66	6	-1.70	41	244
P15L16Kahriz	0.30	58	-1.03	5	-2.02*	6	4.52	65	2.25	28	2.17	36	-31.23*	2	303
P9L3Kahriz	0.19	54	-0.07	41	-0.53	24	-2.24	33	2.75	20	-1.53	12	-19.50	17	487
P13L2	0.47	63	0.21	49	-0.23	30	-3.55	21	1.33	32	5.70	65	-23.06	14	485
P19L7Kahriz	-0.13	25	-1.02	6	-2.24	4	-18.94**	1	3.28	18	1.50	30	18.86	57	284
P6L1	0.57	67	-0.28	37	-1.30	9	-12.62*	2	6.03**	4	-2.35	10	-11.70	34	312
P19L3Kahriz	0.06	45	-0.91	9	-0.13	35	-1.05	39	5.78**	6	1.09	27	-9.00	37	369
P14L1Kahriz	-0.16	23	0.47	63	-0.30	27	-9.90	3	6.03**	3	4.32	57	-25.82	11	352
P11L7	-1.49*	1	0.16	47	0.93	60	-2.64	30	1.05	36	-7.14	2	3.14	45	419
P14L2	-0.31	13	-0.09	39	0.88	56	2.07	56	-0.77	48	2.78	40	7.22	48	485
P10L5	0.03	44	0.89	70	0.10	39	-2.96	25	-2.79	66	-5.88	3	7.46	50	544
P1L4Kahriziدیالل کرج	0.87	70	0.22	50	-0.76	19	1.17	51	-2.34	57	4.89	60	7.43	49	495
P11L6	-0.84	2	-0.33	35	0.52	48	2.80	57	-2.82	67	4.04	54	27.99	65	527
P13L3	-0.50	6	0.20	48	1.47	68	-1.38	37	-2.61	61	3.22	47	30.43*	68	584
P3L4Kahriz	-0.07	33	-1.44*	2	-0.45	25	1.60	54	-1.79	55	8.24*	70	-27.01	10	447
p1L5kahriz	0.68	68	-0.89	11	0.59	51	5.26	68	-2.39	59	0.16	21	-28.20	7	442
P19L5Kahriz	-0.61	4	-0.90	10	0.06	38	-2.08	36	-1.77	54	3.90	52	-16.09	26	334
P15L14	0.45	62	-0.50	21	-0.28	29	-9.81	4	-1.68	53	-1.48	13	-29.94*	5	348
P16L6Kahriz	0.47	64	-0.24	38	-1.15	13	-1.01	40	-1.45	52	2.21	37	-31.42*	1	398
P15L4	-0.09	30	-0.59	17	-1.35	8	-4.97	15	0.97	37	1.23	29	-8.08	38	239
P11L9	-0.49	8	-0.04	42	0.14	42	-7.42	6	1.75	31	-0.59	17	-19.23	18	239
P13L1	-0.36	11	0.02	44	-0.18	32	-2.22	34	0.93	38	-4.17	4	-17.70	21	313
P16L12Kahriz	0.23	57	-1.39*	3	-2.13*	5	3.48	60	-1.17	50	-0.40	18	-14.58	31	310
P10L9	0.01	41	0.35	56	1.07	66	-2.69	28	0.19	43	2.86	42	-12.36	33	441
Mo17	0.17	51	-0.44	27	-0.44	26	-5.80	10	1.94	30	6.83	67	-8.04	39	340
OH43/1-42	0.00	39	-1.37*	4	-0.86	17	0.80	48	0.25	42	9.70*	73	-23.13	13	460
K615/1	-0.52	5	0.37	59	0.80	54	5.01	67	0.29	41	5.52	63	2.37	44	542
OH43/1-42پدری	0.00	40	-0.97	7	0.16	43	-0.39	43	1.11	34	9.06*	72	-15.86	27	449
R59پدری	-0.17	22	-0.42	28	0.27	44	7.65	72	2.35	26	-0.07	20	-13.39	32	505
W37A	0.33	59	-0.60	16	-0.69	20	-4.97	16	4.93*	9	-3.01	5	-4.03	40	278
R319	0.06	46	-0.48	23	-0.02	36	1.07	50	2.26	27	0.24	22	3.23	46	342
R59	-0.14	24	-0.55	19	0.12	41	6.38	71	0.83	39	3.12	46	-17.49	22	428
W153R	0.18	52	0.03	45	0.95	61	0.68	46	3.13	19	3.35	49	-18.94	20	502
R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	0.44	60	-0.39	32	-2.49*	3	-3.16	24	6.42**	2	-9.15*	1	-24.22	12	277
B73(RFCORCMS)	-0.21	19	-1.56*	1	-1.26	10	-6.96	8	7.76**	1	3.11	45	-16.26	25	348
ZK472221	1.68*	73	0.35	57	-1.12	14	-4.27	19	2.64	24	3.08	44	21.72	59	420
K1263/1/1388	0.16	49	-0.88	12	0.55	49	4.45	64	1.14	33	5.68	64	-17.34	23	421
4*/89	-0.50	7	-0.61	14	-0.14	34	-1.22	38	2.64	23	2.84	41	-15.84	28	391
9/K19/1	0.06	47	-0.60	15	-0.19	31	-5.58	12	4.34*	11	1.17	28	7.71	51	434
25*/89	0.03	43	-0.55	18	-0.15	33	-2.62	31	2.12	29	1.80	31	-9.35	36	360
S2/QPM/SUKMAاندونزی	1.29*	72	0.73	67	-2.60*	2	1.66	55	5.95**	5	1.89	32	33.54*	70	349
66*/1388	-0.09	29	0.46	61	0.43	45	-0.25	45	5.20*	8	4.68	58	-19.19	19	453
K166B/89&(14*k166B/1390)	-0.19	20	-0.38	33	-0.30	28	-2.76	27	4.12*	13	5.99	66	-14.60	30	467
K18-B/1392ایزوله	0.44	61	-0.41	30	-1.19	11	-8.61	5	4.23*	12	3.31	48	-10.44	35	404
7/K19/1	-0.07	34	-0.94	8	-1.11	15	-3.50	23	3.60	17	8.14	69	19.69	58	450
23*/89	-0.28	16	0.46	62	1.03	65	10.41	73	2.43	25	5.13	62	-0.78	43	492
70*/1388	-0.08	32	-0.44	26	1.58	69	-3.51	22	2.70	21	3.63	50	-22.10	15	544
138*/89	0.19	53	-0.47	24	-1.18	12	-4.74	17	5.41**	7	5.06	61	-17.24	24	359
k19*/1392ایزوله	0.16	50	-0.67	13	0.45	46	1.35	52	3.85*	15	4.87	59	-27.35	8	442
1390/Popcorn-53or54خط	1.08	71	-0.49	22	-0.59	22	3.04	59	3.60	16	8.34	71	-30.65*	4	528
172*/89	0.57	66	-0.35	34	-3.85**	1	-3.99	20	2.69	22	3.82	51	-29.44	6	368
8/K19/1	-0.01	36	-0.46	25	0.12	40	-5.01	14	4.82*	10	0.84	26	-20.92	16	436
67*/88	-0.11	27	-0.31	36	-1.06	16	-4.28	18	4.07*	14	3.96	53	-27.15	9	351
36-N/88-K3653/2	0.03	42	-0.08	40	0.04	37	-0.29	44	0.53	40	4.08	55	10.77	53	455
Line 1	0.50	65	1.11	72	0.98	63	0.89	49	-0.64	47	-0.88	15	27.27	63	601
Line 2	0.09	48	0.25	53	1.75	72	5.71	69	-0.82	49	-2.36	9	28.81	67	597
Line 3	-0.28	15	0.59	66	0.90	58	5.76	70	-1.40	51	2.15	35	26.45	62	596
Line 4	-0.34	12	0.54	64	0.77	53	4.35	63	-0.04	44	2.14	34	23.74	61	577
Line 6	-0.68	3	0.89	69	0.97	62	-0.89	41	-0.53	46	-1.72	11	-1.29	42	542
Line 7	-0.38	10	0.30	54	0.81	55	-2.22	35	-1.93	56	2.32	38	41.72**	73	580
Line 8	-0.11	28	0.31	55	1.60	71	-2.88	26	-2.64	62	0.54	24	6.85	47	608
Line 9	-0.09	31	-0.42	29	-0.68	21	-2.66	29	-2.76	63	3.02	43	-31.12*	3	459
Line 10	0.21	56	0.56	65	0.91	59	-2.29	32	-2.48	60	-1.39	14	28.10	66	546
Line 11	0.82	69	0.88	68	-1.92	7	1.50	53	-3.14	71	4.14	56	8.29	52	533
Line 12	-0.18	21	0.23	51	0.56	50	3.63	61	-3.27	72	2.53	39	14.79	54	485
Line 13	-0.26	17	0.10	46	1.77	73	3.02	58	-2.99	69	-2.39	8	34.42*	72	472
Line 14	-0.31	14	0.00	43	0.89	57	-0.56	42	-2.77	64	-0.20	19	22.84	60	583
Line 16	-0.25	18	0.40	60	0.46	47	-5.80	11	-2.36	58	0.31	23	17.81	55	441
Line 17	-0.43	9	0.35	58	1.00	64	4.60	66	-2.79	65	1.96	33	27.58	64	577
Line 18	-0.12	26	-0.54	20	-0.54	23	-5.83	9	-2.94	68	7.69	68	-15.44	29	513
Line 19	-0.05	35	0.23	52	1.14	67	4.10	62	-3.61	73	-0.68	16	33.57*	71	627
Line 20	0.21	55	1.27	73	1.59	70	0.69	47	-3.05	70	0.61	25	31.84*	69	594

DTE: Days to tassel emergence, DEE: Days to ear emergence, Ch: Chlorophyll rate, Il: Ion leakage, TLS: Total leaf surface, RWC: Relative water content, APWP: Aerial part weight of plant, WETP: Weight of ear together with pods, NGRE: Number of grain rows per ear, GD: Grain diameter, GW: Grain width, GH: Grain height, CW: Cob's weight, CT: Canopy temperature, EDWG: Ear diameter without grain, DFLWT: Distance from the flag leaf width to the tassel, DWFL: Dry weight of flag leaf, LANG: Leaf angle, LFNT: Length of first node to tassel, LNE: Leaf number on ear, NGR: Number of grain per row, NBT: Number of Branches in Tassel, TL: Tassel length, WEWoutP: Weight of ear without pods, GWME: Grain weight in main ear. *and **: Not-significant and significant at 5% and 1% probability levels, respectively.

 

فایل تکمیلی 8- برآورد ارزش اصلاحی صفات بیوشیمیایی و مرتبط با دانه در ژنوتیپ­های ذرت (Zea mays L.) تحت شرایط تنش شوری بر اساس نشانگر مولکولی SNP

Supplementary file 8. Estimation of breeding value for studied biochemical and seed related traits in maize (Zea mays L.) genotypes based on SNP molecular marker under salt stress conditions

Name	Origin	LAG	Rank	TLS	Rank	DWFL	Rank	DFLWT	Rank	DEE	Rank
P3L2	Kermanshah	1.68	53	-1282.65	50	-0.06	47	2.38	11	0.11	38
P11L2	Kermanshah	10.38	14	-1388.05	73	-0.05	43	1.48	14	-12.55*	1
P15L16Kahriz	Kermanshah	8.51	20	-123.42	56	0.00	27	0.42	25	5.70	67
P9L3Kahriz	Kermanshah	2.68	50	3517.26	68	0.18	5	-1.71	58	2.88	58
P13L2	Kermanshah	11.72	7	-1152.23	53	-0.07	48	-0.95	51	3.49	60
P19L7Kahriz	Kermanshah	-5.64	70	-2674.28	46	-0.20	72	-2.26	66	3.39	59
P6L1	Kermanshah	-1.62	61	-3202.38	49	-0.19	69	-0.61	43	1.78	50
P19L3Kahriz	Kermanshah	-2.43	64	-1783.56	52	-0.12	62	0.21	31	-1.95	26
P14L1Kahriz	Kermanshah	6.85	26	-1780.24	67	-0.19	70	-2.33	67	4.45	65
P11L7	Kermanshah	0.37	56	740.09	60	0.05	15	2.86	7	-3.17	23
P14L2	Kermanshah	5.17	42	510.60	70	0.02	22	0.12	35	1.17	48
P10L5	Kermanshah	-0.36	58	118.55	64	0.04	18	-1.17	53	3.56	62
P1L4Kahriziدیالل کرج	Kermanshah	6.64	28	-988.41	57	-0.10	57	-0.51	41	3.54	61
P11L6	Kermanshah	1.75	52	5098.63*	72	-0.07	50	0.74	18	0.34	39
P13L3	Kermanshah	-2.60	65	1345.01	66	0.10	8	0.15	33	1.83	51
P3L4Kahriz	Kermanshah	-6.11	71	-326.16	59	-0.01	32	0.29	28	-0.18	36
p1L5kahriz	Kermanshah	7.12	24	-1875.03	32	-0.09	52	-2.98	70	-0.49	32
P19L5Kahriz	Kermanshah	6.06	35	-339.64	61	-0.04	41	0.49	23	-4.72	17
P15L14	Kermanshah	5.74	39	-1023.25	55	-0.04	39	-0.02	38	10.55*	72
P16L6Kahriz	Kermanshah	-11.71	72	-20.50	63	0.10	9	0.11	36	-3.35	22
P15L4	Kermanshah	9.19	18	2037.91	69	0.08	12	3.62*	3	-12.36*	2
P11L9	Kermanshah	3.38	48	1309.22	71	0.05	16	0.68	19	-5.92	12
P13L1	Kermanshah	6.07	34	2193.33	54	0.11	6	-1.86	60	-9.64	6
P16L12Kahriz	Kermanshah	6.12	33	1633.57	62	0.29	1	-2.92	69	50.81**	73
P10L9	Kermanshah	7.68	22	1349.14	65	0.06	13	3.77*	2	-10.85*	4
Mo17	Kermanshah	10.22	17	-1549.92	44	-0.12	61	-0.66	46	-5.01	15
OH43/1-42	Kermanshah	5.97	36	-1718.88	11	-0.01	33	-0.72	48	2.43	54
K615/1	Kermanshah	10.65	12	-3416.47	2	-0.17	67	2.07	13	2.67	55
OH43/1-42پدری	Karaj	6.54	29	-1720.27	4	-0.04	40	0.16	32	-0.41	33
R59پدری	Karaj	17.41*	1	5985.58*	58	0.19	3	-0.82	50	-2.15	25
W37A	Karaj	1.91	51	-25.43	26	-0.05	45	-0.42	40	-4.94	16
R319	Karaj	5.09	43	103.98	34	-0.04	38	2.21	12	-10.04*	5
R59	Karaj	5.49	40	1531.52	47	0.01	25	-0.61	42	-7.65	7
W153R	Karaj	6.22	32	-484.31	30	0.02	21	0.98	17	-6.32	8
R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	Karaj	-25.62**	73	540.99	51	-0.04	42	0.24	30	-11.82*	3
B73(RFCORCMS)	Karaj	8.62	19	384.05	27	0.08	11	0.59	21	2.69	56
ZK472221	Karaj	-1.92	62	134.90	36	0.01	26	-3.53*	73	-6.11	9
K1263/1/1388	Mashhad	14.25*	3	-1698.62	8	-0.21	73	-1.45	55	-6.11	10
4*/89	Mashhad	6.35	31	-1787.91	5	-0.09	53	-1.44	54	-5.31	14
9/K19/1	Mashhad	11.69	8	-705.78	16	-0.06	46	0.40	26	-4.17	19
25*/89	Mashhad	10.24	16	-1593.22	13	-0.17	68	-3.07	72	-5.50	13
S2/QPM/SUKMAاندونزی	Mashhad	11.00	10	-1870.54	21	-0.10	55	-2.21	65	9.88	71
66*/1388	Mashhad	5.92	37	-1355.58	25	-0.12	63	-1.79	59	0.75	44
K166B/89&(14*k166B/1390)	Mashhad	4.20	46	-661.04	14	0.01	24	-0.38	39	4.21	63
K18-B/1392ایزوله	Mashhad	10.89	11	1453.31	38	0.23	2	-1.93	61	1.86	52
7/K19/1	Mashhad	10.46	13	-1525.32	17	-0.10	54	0.44	24	0.37	40
23*/89	Mashhad	5.39	41	-31.08	22	-0.03	36	-3.04	71	-4.67	18
70*/1388	Mashhad	5.87	38	-3412.02	1	-0.20	71	-1.60	57	0.71	43
138*/89	Mashhad	11.63	9	-1650.18	7	-0.02	34	-0.66	45	-0.86	29
k19*/1392ایزوله	Mashhad	7.12	23	547.73	40	0.05	17	0.27	29	-3.70	20
1390/Popcorn-53or54خط	Mashhad	-3.06	68	-1907.46	9	-0.10	56	-0.77	49	7.78	68
172*/89	Mashhad	6.36	30	-2794.21	3	-0.13	64	-2.13	63	-1.52	27
8/K19/1	Mashhad	13.92*	4	-899.42	12	-0.07	49	-0.65	44	2.72	57
67*/88	Mashhad	6.71	27	-1310.12	15	-0.15	65	-2.62	68	5.36	66
36-N/88-K3653/2	Mashhad	12.53	5	-1243.49	10	0.00	29	5.41**	1	0.11	37
Line 1	-	8.16	21	-419.24	28	0.19	4	-1.51	56	1.06	47
Line 2	-	-0.05	57	-752.24	33	-0.03	37	1.10	16	-5.95	11
Line 3	-	4.91	45	398.84	20	0.08	10	2.81	8	-0.61	31
Line 4	-	0.99	55	-495.64	18	0.03	19	3.06	6	0.77	45
Line 6	-	3.87	47	286.72	43	0.01	23	-2.15	64	-0.88	28
Line 7	-	4.98	44	-1676.52	6	-0.08	51	0.34	27	4.28	64
Line 8	-	-2.76	67	-1971.91	45	-0.11	60	0.57	22	2.09	53
Line 9	-	-0.49	60	1726.96	42	0.11	7	3.37	4	0.57	42
Line 10	-	10.37	15	1308.14	48	0.05	14	0.14	34	1.40	49
Line 11	-	14.69*	2	-1864.95	24	-0.11	58	-2.10	62	-2.63	24
Line 12	-	1.37	54	-2345.03	31	-0.15	66	-0.71	47	-0.41	34
Line 13	-	-0.41	59	-1156.65	35	-0.05	44	2.68	9	0.43	41
Line 14	-	-4.28	69	-51.53	23	0.00	28	0.04	37	-0.82	30
Line 16	-	-2.71	66	75.86	39	-0.01	31	-1.07	52	9.02	70
Line 17	-	-2.20	63	-356.18	19	0.03	20	2.44	10	-0.36	35
Line 18	-	3.11	49	-921.80	29	-0.03	35	1.11	15	8.07	69
Line 19	-	11.81	6	20.02	41	-0.01	30	3.21	5	0.77	46
Line 20	-	7.11	25	-1283.18	37	-0.11	59	0.63	20	-3.37	21

DTE: Days to tassel emergence, DEE: Days to ear emergence, Ch: Chlorophyll rate, Il: Ion leakage, TLS: Total leaf surface, RWC: Relative water content, APWP: Aerial part weight of plant, WETP: Weight of ear together with pods, NGRE: Number of grain rows per ear, GD: Grain diameter, GW: Grain width, GH: Grain height, CW: Cob's weight, CT: Canopy temperature, EDWG: Ear diameter without grain, DFLWT: Distance from the flag leaf width to the tassel, DWFL: Dry weight of flag leaf, LANG: Leaf angle, LFNT: Length of first node to tassel, LNE: Leaf number on ear, NGR: Number of grain per row, NBT: Number of Branches in Tassel, TL: Tassel length, WEWoutP: Weight of ear without pods, GWME: Grain weight in main ear. *and **: Not-significant and significant at 5% and 1% probability levels, respectively.

 

فایل تکمیلی 8- برآورد ارزش اصلاحی صفات بیوشیمیایی و مرتبط با دانه در ژنوتیپ­های ذرت (Zea mays L.) تحت شرایط تنش شوری بر اساس نشانگر مولکولی SNP

Supplementary file 8. Estimation of breeding value for studied biochemical and seed related traits in maize (Zea mays L.) genotypes based on SNP molecular marker under salt stress conditions

Name	DTE	Rank	LFNT	Rank	NBT	Rank	TL	Rank	LLNE	Rank	NGRE	Rank	NGR	Rank	Sum of ranks
P3L2	26.12	70	1.96	19	-0.54	38	-1.42	34	-0.67	57	-0.74	1	-2.69	69	474
P11L2	-20.72	14	4.69	6	0.08	19	1.29	12	-1.12	69	0.11	20	0.36	31	422
P15L16Kahriz	12.00	57	-0.64	38	-1.57	64	-6.60*	70	0.84	8	-0.04	8	-2.18	66	472
P9L3Kahriz	8.71	52	-3.87	57	-0.30	31	-5.24	66	1.08	4	0.22	27	0.96	19	519
P13L2	-0.59	44	-2.99	53	-1.09	54	-2.57	46	-0.61	55	-0.08	11	-2.35	67	432
P19L7Kahriz	-42.71*	4	-6.94*	69	-1.76	66	-5.69	68	-0.14	43	0.12	17	-1.56	60	341
P6L1	-45.48**	3	-6.99*	70	-2.92*	72	-5.85*	69	-1.11	68	-0.78	2	-2.86	70	253
P19L3Kahriz	-3.02	40	-6.76*	68	0.02	22	-2.41	43	-0.31	46	0.04	9	-1.09	54	350
P14L1Kahriz	-51.25**	2	-5.38	63	-2.49*	70	-6.67*	71	-0.93	66	-0.07	19	-2.08	64	360
P11L7	45.61**	73	5.11	4	0.16	17	2.43	6	0.62	16	0.13	54	1.75	14	581
P14L2	-4.49	38	3.07	12	-0.92	48	-3.03	50	0.06	34	0.16	16	0.88	20	530
P10L5	17.22	62	-1.23	42	-0.22	29	1.88	8	0.43	20	0.10	23	-0.58	44	619
P1L4Kahriziدیالل کرج	-20.74	13	0.73	27	0.07	20	-4.22	59	0.27	25	0.26	25	-0.43	39	463
P11L6	-7.04	34	-0.37	34	0.39	14	-2.44	44	0.91	7	0.09	21	2.26	9	464
P13L3	4.19	50	0.03	32	-0.07	25	-0.11	24	0.65	15	0.15	48	2.04	11	543
P3L4Kahriz	-28.36	8	-9.04*	73	-1.08	53	-0.62	28	0.74	9	0.53	43	-0.48	42	375
p1L5kahriz	-11.14	26	-6.43	66	-1.33	58	-7.74*	73	0.74	10	0.58	67	-0.92	49	356
P19L5Kahriz	-8.48	30	2.66	14	2.72*	4	-1.84	38	-0.32	47	0.21	18	0.45	28	427
P15L14	-1.58	42	-2.68	51	-3.25*	73	-6.77*	72	2.08	2	0.02	13	-2.39	68	439
P16L6Kahriz	-7.58	32	-1.53	44	-2.77*	71	0.76	15	0.39	23	0.49	33	-0.68	46	489
P15L4	-8.62	29	0.33	30	-0.83	45	1.58	10	-0.11	41	0.35	28	1.77	12	497
P11L9	-2.45	41	1.44	24	-0.39	33	0.31	18	-0.68	58	0.17	30	0.71	22	567
P13L1	-0.28	45	-1.70	47	-0.52	37	2.55	5	-0.95	67	0.04	49	0.66	23	498
P16L12Kahriz	3.33	49	-3.67	56	-0.10	37	6.30*	1	-0.89	64	0.06	24	0.26	33	441
P10L9	9.07	53	4.34	9	-1.20	55	-1.75	37	-0.84	60	-0.09	10	-1.26	55	435
Mo17	-16.48	19	-1.64	46	-0.27	30	-4.57	63	0.02	36	0.56	41	-0.47	41	385
OH43/1-42	14.75	60	-0.71	39	0.46	13	-0.32	26	0.41	21	0.16	59	-0.95	50	495
K615/1	-3.64	39	5.01	5	-1.46	60	-5.41	67	0.97	6	0.30	52	-1.78	62	451
OH43/1-42پدری	11.02	54	1.72	20	1.06	8	-1.95	39	0.21	28	0.20	62	-1.00	53	494
R59پدری	-18.42	15	0.21	31	-0.07	26	-3.97	56	0.03	35	0.07	36	-0.13	36	386
W37A	-22.06	12	-5.83	64	-0.02	24	-4.11	57	0.46	18	0.88	71	-0.96	51	330
R319	-10.58	27	0.74	26	-2.49*	69	-4.89	64	-0.85	61	0.74	70	-0.91	48	334
R59	-0.21	46	-1.06	41	1.36	7	-5.13	65	-0.50	52	0.06	39	1.06	18	460
W153R	5.20	51	1.58	23	3.49**	3	2.93	4	0.22	27	0.37	61	0.46	27	494
R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	-10.24	28	3.28	11	4.02**	2	3.26	3	0.67	14	-0.05	37	-1.33	58	396
B73(RFCORCMS)	-25.63	11	-1.55	45	-1.51	61	-1.06	33	-0.90	65	-0.30	3	-0.32	38	312
ZK472221	-33.26*	6	-5.27	62	-1.02	52	1.72	9	-1.52	72	-0.74	4	-4.04	73	319
K1263/1/1388	-37.20*	5	-4.66	60	-0.56	39	-4.25	60	-0.65	56	0.61	72	0.51	26	374
4*/89	-11.85	25	-2.04	49	0.61	10	-1.70	36	0.35	24	0.45	66	0.61	24	444
9/K19/1	-6.27	35	0.76	25	-1.56	63	-2.47	45	-0.44	51	-0.30	7	0.31	32	303
25*/89	-29.07	7	-4.05	59	-1.23	56	-4.33	62	-0.73	59	0.18	31	0.55	25	291
S2/QPM/SUKMAاندونزی	-56.97**	1	-5.92	65	1.56	6	-3.31	51	-2.74	73	-0.06	26	-0.99	52	317
66*/1388	1.20	47	2.60	15	-0.96	50	0.29	19	0.44	19	0.23	45	-1.61	61	412
K166B/89&(14*k166B/1390)	-4.60	37	2.32	16	-2.03	68	1.26	13	-0.40	48	0.20	51	-1.38	59	388
K18-B/1392ایزوله	-0.80	43	-6.45	67	-1.92	67	-2.14	41	-0.28	45	0.38	44	-0.73	47	371
7/K19/1	-17.71	16	2.21	18	-1.01	51	-2.72	47	-0.88	62	0.61	69	0.01	35	357
23*/89	-16.72	18	-3.46	55	0.33	15	-1.00	32	0.71	11	0.23	56	2.54	7	510
70*/1388	24.53	69	-2.91	52	-0.70	42	-3.69	53	2.22	1	0.31	58	-2.13	65	419
138*/89	-12.53	23	-2.59	50	-1.28	57	-3.02	49	1.41	3	0.06	34	-1.31	57	322
k19*/1392ایزوله	16.48	61	-0.47	35	-0.83	46	-3.47	52	0.17	29	0.60	60	-0.55	43	420
1390/Popcorn-53or54خط	-28.32	9	-0.06	33	-1.53	62	0.15	20	-1.24	71	-0.38	15	-3.71	72	279
172*/89	-13.44	21	-5.09	61	-0.93	49	-1.53	35	-1.15	70	0.32	63	-2.05	63	328
8/K19/1	-7.96	31	-1.88	48	-1.39	59	-3.01	48	-0.11	40	-0.41	5	-0.68	45	288
67*/88	-14.89	20	-7.09*	71	-1.74	65	-4.18	58	0.69	13	0.26	40	0.82	21	396
36-N/88-K3653/2	32.87*	72	8.32*	1	0.21	16	-2.08	40	0.11	32	0.14	35	0.43	29	416
Line 1	-7.46	33	-3.45	54	-0.45	35	4.98	2	-0.41	50	0.03	38	1.14	17	486
Line 2	21.60	68	1.67	21	4.35**	1	1.92	7	-0.06	37	0.01	73	1.76	13	618
Line 3	21.35	67	4.46	8	2.14	5	0.83	14	-0.25	44	0.29	46	3.36	2	565
Line 4	31.51*	71	4.51	7	0.15	18	0.43	17	-0.54	53	0.31	47	2.37	8	554
Line 6	-12.51	24	6.42	3	0.46	12	-0.08	23	0.70	12	0.26	50	2.16	10	570
Line 7	18.67	64	3.03	13	-0.57	40	-0.80	29	0.16	31	0.28	55	3.76	1	618
Line 8	13.99	59	0.41	29	0.03	21	-0.89	31	-0.10	39	0.72	65	-3.22	71	498
Line 9	11.31	55	7.47*	2	-0.46	36	-0.85	30	0.16	30	-0.36	6	1.55	15	531
Line 10	-5.45	36	-0.60	37	-0.14	28	0.07	22	0.10	33	-0.31	14	0.24	34	503
Line 11	-12.91	22	-3.95	58	-0.37	32	-3.73	54	-0.55	54	0.49	68	-0.24	37	493
Line 12	-17.01	17	-1.51	43	-0.70	43	-2.25	42	-0.09	38	0.20	32	3.01	4	435
Line 13	18.49	63	1.66	22	-0.89	47	-3.75	55	0.40	22	-0.01	53	3.30	3	672
Line 14	11.34	56	0.48	28	-0.44	34	-0.28	25	-0.14	42	-0.10	22	1.50	16	483
Line 16	12.20	58	-0.74	40	-0.61	41	0.43	16	1.03	5	-0.17	64	-1.26	56	505
Line 17	19.90	65	3.48	10	0.71	9	0.07	21	0.23	26	0.33	57	2.69	5	577
Line 18	-27.89	10	-8.18*	72	-0.71	44	-4.30	61	0.54	17	-0.34	12	-0.46	40	420
Line 19	21.27	66	2.28	17	-0.01	23	1.32	11	-0.89	63	0.19	29	2.54	6	536
Line 20	2.79	48	-0.53	36	0.51	11	-0.52	27	-0.41	49	0.22	42	0.37	30	510

DTE: Days to tassel emergence, DEE: Days to ear emergence, Ch: Chlorophyll rate, Il: Ion leakage, TLS: Total leaf surface, RWC: Relative water content, APWP: Aerial part weight of plant, WETP: Weight of ear together with pods, NGRE: Number of grain rows per ear, GD: Grain diameter, GW: Grain width, GH: Grain height, CW: Cob's weight, CT: Canopy temperature, EDWG: Ear diameter without grain, DFLWT: Distance from the flag leaf width to the tassel, DWFL: Dry weight of flag leaf, LANG: Leaf angle, LFNT: Length of first node to tassel, LNE: Leaf number on ear, NGR: Number of grain per row, NBT: Number of Branches in Tassel, TL: Tassel length, WEWoutP: Weight of ear without pods, GWME: Grain weight in main ear. *and **: Not-significant and significant at 5% and 1% probability levels, respectively.

 

فایل تکمیلی 8- برآورد ارزش اصلاحی صفات بیوشیمیایی و مرتبط با دانه در ژنوتیپ­های ذرت (Zea mays L.) تحت شرایط تنش شوری بر اساس نشانگر مولکولی SNP

Supplementary file 8. Estimation of breeding value for studied biochemical and seed related traits in maize (Zea mays L.) genotypes based on SNP molecular marker under salt stress conditions

Name	Origin	GWME	Rank	APWP	Rank	WETP	Rank	WEoutPh	Rank	EDWG	Rank	Sum of ranks
P3L2	Kermanshah	-9.49	69	54.49	65	-9.38	21	-8.65	60	-0.92	55	474
P11L2	Kermanshah	-2.63	47	-95.21	9	-14.71	6	-10.42	65	-1.26	64	422
P15L16Kahriz	Kermanshah	-7.42	66	-13.89	43	-10.54	18	-9.75	62	-1.04	59	472
P9L3Kahriz	Kermanshah	5.82	18	31.62	58	-1.08	40	-1.34	37	-0.10	47	519
P13L2	Kermanshah	-6.35	61	-17.09	39	-11.63	14	-10.16	63	-0.48	53	432
P19L7Kahriz	Kermanshah	-6.84	62	-125.54*	3	-11.20	16	-7.96	57	0.19	43	341
P6L1	Kermanshah	-11.94	72	-114.31*	4	-17.21	3	-12.86	68	-0.08	45	253
P19L3Kahriz	Kermanshah	-5.95	60	-77.58	16	-12.27	12	-8.50	58	1.06	21	350
P14L1Kahriz	Kermanshah	-7.03	65	-132.50*	2	-21.46	1	-15.39	72	-3.73	73	360
P11L7	Kermanshah	11.56	7	58.76	67	4.18	55	4.63	19	-0.08	46	581
P14L2	Kermanshah	1.85	32	-18.44	36	1.36	48	2.76	24	0.66	33	530
P10L5	Kermanshah	-4.31	56	115.48*	72	-2.06	37	-4.60	49	-0.94	56	619
P1L4Kahriziدیالل کرج	Kermanshah	-5.70	58	-16.32	40	-6.62	23	-6.47	52	-1.78	66	463
P11L6	Kermanshah	0.87	35	-46.01	28	-5.21	25	-3.22	45	-0.32	52	464
P13L3	Kermanshah	7.19	12	53.17	62	3.67	53	-2.89	43	-2.28	69	543
P3L4Kahriz	Kermanshah	-7.45	67	-63.43	24	-15.35	4	-11.17	67	-2.15	68	375
p1L5kahriz	Kermanshah	-2.76	49	-87.25	12	-10.83	17	-8.54	59	-1.01	58	356
P19L5Kahriz	Kermanshah	0.21	39	-101.34	8	-3.91	31	-2.15	41	1.76	15	427
P15L14	Kermanshah	-8.73	68	-19.41	33	-13.22	9	-14.12	70	-2.43	71	439
P16L6Kahriz	Kermanshah	-1.22	43	-21.74	32	-2.96	34	-2.71	42	1.88	9	489
P15L4	Kermanshah	6.93	14	-66.32	22	2.23	51	3.64	23	1.42	19	497
P11L9	Kermanshah	4.61	23	-31.68	31	0.41	44	0.62	29	-0.13	49	567
P13L1	Kermanshah	0.42	36	21.04	55	-10.38	19	-7.65	55	-2.77	72	498
P16L12Kahriz	Kermanshah	-3.58	52	-45.74	29	-8.35	22	-5.40	50	0.52	34	441
P10L9	Kermanshah	-6.87	63	-69.45	21	-11.98	13	-10.72	66	-1.04	60	435
Mo17	Kermanshah	1.47	33	-74.42	17	-4.37	29	-1.70	40	1.02	25	385
OH43/1-42	Kermanshah	-2.37	46	24.08	56	1.82	50	2.44	25	0.39	38	495
K615/1	Kermanshah	-5.20	57	-46.70	27	0.79	45	-0.12	32	1.87	10	451
OH43/1-42پدری	Karaj	-0.36	40	11.31	52	4.08	54	4.55	20	0.81	30	494
R59پدری	Karaj	0.40	37	-86.29	13	-3.94	30	-0.13	33	1.31	20	386
W37A	Karaj	7.00	13	-69.80	20	0.33	42	1.03	27	1.85	12	330
R319	Karaj	4.11	25	-107.93*	7	-2.07	36	-1.16	35	2.49	8	334
R59	Karaj	7.20	11	-15.48	41	1.36	49	4.47	21	0.44	37	460
W153R	Karaj	4.64	22	85.04	71	14.43	65	12.28	10	2.92	6	494
R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	Karaj	-3.71	53	-18.26	37	-17.42	2	-13.90	69	-1.13	61	396
B73(RFCORCMS)	Karaj	-3.78	54	-85.27	14	-4.57	28	-3.24	46	-0.59	54	312
ZK472221	Karaj	-12.34	73	-72.90	18	-12.76	10	-14.16	71	-0.97	57	319
K1263/1/1388	Mashhad	0.93	34	-88.91	11	7.44	56	7.86	17	2.76	7	374
4*/89	Mashhad	7.63	9	3.85	50	12.03	62	10.29	11	3.35	2	444
9/K19/1	Mashhad	0.39	38	-4.58	46	-1.33	39	-0.34	34	0.49	35	303
25*/89	Mashhad	2.62	29	-78.57	15	-3.56	33	-6.86	53	-1.20	62	291
S2/QPM/SUKMAاندونزی	Mashhad	-4.15	55	-156.75**	1	-12.28	11	-7.22	54	0.45	36	317
66*/1388	Mashhad	-2.68	48	-3.78	47	-0.91	41	0.06	31	1.05	23	412
K166B/89&(14*k166B/1390)	Mashhad	-0.44	41	-13.74	44	1.09	46	1.66	26	1.60	17	388
K18-B/1392ایزوله	Mashhad	-0.81	42	-63.88	23	-11.41	15	-7.87	56	-1.54	65	371
7/K19/1	Mashhad	-1.35	44	-70.64	19	-3.79	32	-1.39	38	1.86	11	357
23*/89	Mashhad	7.29	10	-17.81	38	10.12	58	10.01	12	3.01	4	510
70*/1388	Mashhad	3.26	27	-2.59	48	1.30	47	0.64	28	1.79	13	419
138*/89	Mashhad	-7.02	64	-109.77*	6	-5.76	24	-4.01	47	0.99	27	322
k19*/1392ایزوله	Mashhad	4.94	20	53.57	64	-5.20	26	-3.03	44	0.22	41	420
1390/Popcorn-53or54خط	Mashhad	-11.39	71	-114.18*	5	-14.74	5	-15.48	73	-1.92	67	279
172*/89	Mashhad	-5.72	59	-91.56	10	-13.23	8	-10.41	64	0.78	31	328
8/K19/1	Mashhad	-3.10	50	0.35	49	-4.83	27	-4.16	48	-0.23	50	288
67*/88	Mashhad	2.93	28	-54.51	25	-1.37	38	0.32	30	0.32	40	396
36-N/88-K3653/2	Mashhad	6.20	16	-41.48	30	-2.15	35	-1.29	36	0.05	44	416
Line 1	-	2.52	30	20.12	54	3.32	52	3.93	22	-0.31	51	486
Line 2	-	16.20	2	117.31*	73	42.95**	73	37.30*	1	4.74	1	618
Line 3	-	15.16	3	30.85	57	20.24	70	16.49	6	1.04	24	565
Line 4	-	10.65	8	52.13	61	12.52	63	9.37	15	0.74	32	554
Line 6	-	4.90	21	34.40	59	19.32	68	16.67	5	3.01	5	570
Line 7	-	18.64*	1	53.47	63	31.04*	72	26.32*	2	1.77	14	618
Line 8	-	-9.62	70	48.31	60	-10.32	20	-5.60	51	-1.25	63	498
Line 9	-	4.51	24	64.42	68	13.34	64	13.28	8	-0.10	48	531
Line 10	-	11.99	6	68.54	70	20.15	69	18.90	3	0.94	28	503
Line 11	-	3.27	26	-14.73	42	11.81	61	9.91	13	3.34	3	493
Line 12	-	6.39	15	-48.48	26	9.34	57	8.36	16	1.54	18	435
Line 13	-	14.71	4	-13.20	45	18.61	66	18.40	4	1.05	22	672
Line 14	-	5.99	17	-18.78	35	11.64	60	6.53	18	0.88	29	483
Line 16	-	-3.28	51	66.26	69	-13.49	7	-9.38	61	-2.29	70	505
Line 17	-	12.73	5	19.54	53	20.56	71	14.15	7	1.02	26	577
Line 18	-	-1.88	45	-19.19	34	0.36	43	-1.60	39	0.19	42	420
Line 19	-	5.35	19	57.08	66	19.18	67	12.98	9	0.35	39	536
Line 20	-	1.92	31	8.61	51	11.60	59	9.43	14	1.61	16	510

DTE: Days to tassel emergence, DEE: Days to ear emergence, Ch: Chlorophyll rate, Il: Ion leakage, TLS: Total leaf surface, RWC: Relative water content, APWP: Aerial part weight of plant, WETP: Weight of ear together with pods, NGRE: Number of grain rows per ear, GD: Grain diameter, GW: Grain width, GH: Grain height, CW: Cob's weight, CT: Canopy temperature, EDWG: Ear diameter without grain, DFLWT: Distance from the flag leaf width to the tassel, DWFL: Dry weight of flag leaf, LANG: Leaf angle, LFNT: Length of first node to tassel, LNE: Leaf number on ear, NGR: Number of grain per row, NBT: Number of Branches in Tassel, TL: Tassel length, WEWoutP: Weight of ear without pods, GWME: Grain weight in main ear. *and **: Not-significant and significant at 5% and 1% probability levels, respectively.

 

فایل تکمیلی 8- برآورد ارزش اصلاحی صفات بیوشیمیایی و مرتبط با دانه در ژنوتیپ­های ذرت (Zea mays L.) تحت شرایط تنش شوری بر اساس نشانگر مولکولی SNP

Supplementary file 8. Estimation of breeding value for studied biochemical and seed related traits in maize (Zea mays L.) genotypes based on SNP molecular marker under salt stress conditions

Name	CW	Rank	GW	Rank	GD	Rank	GH	Rank	Chl	Rank	CT	Rank	RWC	Rank	IL	Rank	Sum of ranks
P3L2	-0.82	54	0.06**	62	0.06	53	-0.29	16	-5.48	20	1.66	4	2.62	61	-10.41	17	474
P11L2	-0.89	56	0.04**	57	-0.26	36	-0.43	12	3.35	66	0.74	14	1.94	57	33.29*	71	422
P15L16Kahriz	-1.45	64	0.08**	68	-0.92	9	-0.40	13	-0.15	49	-0.86	57	1.67	56	-6.32	28	472
P9L3Kahriz	-0.81	53	0.07**	65	-0.49	24	-0.18	21	-0.51	47	-1.30	66	1.66	58	-16.46	1	519
P13L2	-0.83	55	-0.01**	37	-0.49	26	-0.56	8	-6.24	17	0.32	23	8.05	72	10.46	51	432
P19L7Kahriz	-0.53	46	0.05**	60	-0.92	8	-0.01	33	-20.01**	1	1.17	9	0.56	45	5.29	49	341
P6L1	-1.08	59	0.04**	58	-0.52	21	-0.62	5	-12.82*	3	1.09	10	-3.16	23	-2.55	32	253
P19L3Kahriz	0.25	25	0.04**	55	-0.85	10	0.08	35	-7.07	12	-0.30	39	0.91	49	-1.43	34	350
P14L1Kahriz	-2.54	73	0.02**	49	-0.34	33	-0.59	6	-9.43	7	1.48	6	3.92	66	2.75	43	360
P11L7	-0.03	31	0.02	47	0.15	55	0.27	47	3.90	69	0.93	13	-5.36	11	-8.61	20	581
P14L2	1.86	8	0.09	71	-0.47	27	0.25	44	-3.59	32	0.00	31	2.77	62	1.04	38	530
P10L5	-1.20	60	0.06	61	-0.34	32	0.32	48	0.50	53	0.45	20	7.71	70	-0.42	35	619
P1L4Kahriziدیالل کرج	-0.73	50	0.06	63	-0.76	12	0.57	61	-3.05	34	-0.62	48	2.93	63	-11.86	11	463
P11L6	-1.51	66	0.14	73	-0.51	22	-0.02	30	-2.61	38	2.01	2	2.62	60	-7.55	22	464
P13L3	-0.90	57	0.04	53	0.24	60	0.15	38	-4.71	24	2.87	1	-0.91	35	-13.98	3	543
P3L4Kahriz	-2.52	72	0.09	70	-1.30*	3	0.25	43	-4.99	22	1.24	8	1.69	55	-12.92	8	375
p1L5kahriz	-1.60	67	0.04	56	-1.08	5	0.39	52	-3.72	31	-0.84	56	-2.80	22	-13.54	4	356
P19L5Kahriz	-0.12	35	0.12	72	-0.96	7	0.26	46	-6.90	13	0.52	16	1.71	52	34.08*	72	427
P15L14	-2.16	71	0.08	67	-1.32*	2	-0.08	27	-3.85	30	-0.79	52	5.43	68	-8.58	21	439
P16L6Kahriz	-0.68	49	0.04	54	-0.54	20	-0.35	15	0.96	58	-0.01	33	6.81	69	14.80	57	489
P15L4	-0.05	33	0.09	69	-1.12*	4	0.48	55	-0.78	45	-0.56	47	2.31	59	24.43	64	497
P11L9	0.77	17	0.08	66	-0.23	38	0.32	49	1.51	60	0.02	30	4.73	67	14.93	58	567
P13L1	-2.07	70	-0.02	32	0.09	54	0.05	34	3.11	65	-0.82	53	-0.56	37	4.52	48	498
P16L12Kahriz	0.61	20	0.01	44	-1.46*	1	-1.36	1	3.39	67	-1.70	69	-6.53	10	18.35	59	441
P10L9	0.04	29	0.07	64	-0.70	13	-0.55	9	-0.59	46	-0.83	54	8.41	71	25.10*	66	435
Mo17	-0.15	37	0.02	48	-1.04	6	0.49	56	-11.32*	5	-0.72	50	-0.09	43	20.25	62	385
OH43/1-42	-1.05	58	-0.05	18	-0.64	16	-0.05	28	0.56	54	-1.71	70	1.00	44	3.42	45	495
K615/1	-0.49	45	-0.09	4	0.17	57	-0.05	29	4.27	71	-1.12	63	-4.57	15	12.45	55	451
OH43/1-42پدری	-0.79	51	-0.05	17	-0.56	19	0.19	41	1.34	59	-1.93	71	1.47	47	10.56	52	494
R59پدری	-0.38	41	-0.02	31	-0.13	42	0.10	37	2.94	64	-1.54	68	-1.37	29	-13.11	6	386
W37A	0.66	19	-0.06	11	-0.20	39	0.74	65	-8.87	10	-1.05	62	-9.17	6	-11.72	12	330
R319	0.75	18	-0.06	14	-0.37	30	0.73	64	-2.44	39	-1.28	65	-13.12*	1	-12.98	7	334
R59	-0.64	48	-0.01	36	-0.44	28	0.16	39	5.53	73	-1.93	72	0.14	39	-10.72	16	460
W153R	1.81	10	-0.09	3	0.29	64	0.50	57	1.84	61	0.99	12	-3.37	18	-13.50	5	494
R59ₓR319 مادری دابل کراس370 (سینگل کراس)	-1.42	63	-0.02	29	0.46	70	0.45	54	-4.03	29	0.30	24	-1.73	25	-2.86	31	396
B73(RFCORCMS)	-0.23	39	-0.03	25	-0.57	18	-0.15	22	-2.85	35	-0.15	35	-3.01	19	11.30	54	312
ZK472221	-1.38	62	-0.12	1	0.26	62	-1.21	2	0.14	50	-0.49	46	1.60	51	31.34*	70	319
K1263/1/1388	0.56	21	-0.05	15	-0.65	15	-0.14	23	0.60	55	0.46	18	-0.28	36	26.19*	68	374
4*/89	3.59	4	-0.06	13	-0.30	35	0.33	50	3.65	68	0.22	26	-5.06	12	3.05	44	444
9/K19/1	0.55	22	-0.06	10	-0.32	34	-0.24	19	-7.20	11	0.22	25	-8.31	7	18.54	60	303
25*/89	-0.60	47	-0.03	28	-0.26	37	-0.12	24	-4.67	25	0.12	28	-12.48*	2	21.58	63	291
S2/QPM/SUKMAاندونزی	-0.45	43	-0.05	16	-0.09	46	-0.74	3	-1.20	43	0.19	27	-9.72	5	42.75**	73	317
66*/1388	0.17	27	-0.08	7	0.15	56	0.21	42	-6.46	14	1.00	11	-8.51	8	0.28	36	412
K166B/89&(14*k166B/1390)	1.48	13	-0.12	2	0.01	49	-0.36	14	-6.01	18	-0.48	45	-6.96	9	1.97	41	388
K18-B/1392ایزوله	-1.22	61	-0.04	21	-0.83	11	-0.10	25	-10.37*	6	-0.62	49	-4.87	40	10.86	53	371
7/K19/1	0.28	24	-0.04	20	-0.50	23	-0.28	17	-9.07	9	-0.84	55	-0.97	34	19.48	61	357
23*/89	3.63	3	-0.02	33	0.02	52	0.68	63	4.07	70	1.29	7	-4.39	13	28.81*	69	510
70*/1388	-0.41	42	-0.03	24	-0.58	17	0.99	70	-14.30**	2	0.47	17	-13.50*	3	0.82	37	419
138*/89	-0.12	34	-0.06	12	-0.39	29	-0.27	18	0.29	52	0.00	32	-2.80	21	26.05*	67	322
k19*/1392ایزوله	-0.47	44	-0.04	22	-0.69	14	-0.02	31	-5.44	21	-0.35	40	-2.08	28	-1.62	33	420
1390/Popcorn-53or54خط	-1.72	68	-0.07	9	-0.12	43	-0.65	4	-3.56	33	-0.43	44	4.20	65	-11.53	14	279
172*/89	-0.79	52	-0.09	5	-0.05	48	-0.54	10	0.61	56	0.46	19	-1.40	27	9.42	50	328
8/K19/1	-0.17	38	-0.07	8	-0.17	40	-0.58	7	-9.31	8	0.60	15	-9.59*	4	1.94	40	288
67*/88	-0.28	40	-0.02	30	-0.10	45	0.42	53	-12.16*	4	1.84	3	-4.21	14	3.73	46	396
36-N/88-K3653/2	-0.14	36	-0.05	19	0.02	51	0.18	40	-6.42	15	-0.26	37	2.25	54	-10.13	18	416
Line 1	0.17	26	0.03	52	-0.14	41	0.82	67	-5.89	19	-1.00	59	-4.43	16	1.90	39	486
Line 2	6.16**	1	0.00	39	0.75	72	0.52	58	2.66	63	-0.25	36	1.11	46	-12.85	9	618
Line 3	1.83	9	0.00	40	0.31	65	1.05	72	-2.20	41	-0.27	38	-1.19	31	-6.76	25	565
Line 4	1.16	15	-0.01	34	0.24	61	0.92	69	-4.35	26	0.05	29	-1.32	30	-5.30	29	554
Line 6	1.93	7	0.03	51	0.38	67	0.25	45	-0.95	44	-4.24*	73	3.77	64	-6.54	27	570
Line 7	3.12	5	0.01	45	0.23	59	0.89	68	-1.45	42	-1.03	61	0.20	38	2.06	42	618
Line 8	-1.46	65	-0.08	6	0.46	71	-0.22	20	-4.90	23	-0.37	41	1.39	50	-6.61	26	498
Line 9	0.03	30	0.00	41	0.26	63	0.54	60	0.21	51	0.36	21	-1.58	26	-11.58	13	531
Line 10	5.19*	2	0.00	42	0.80	73	0.53	59	-6.40	16	-0.42	43	-4.21	17	-12.69	10	503
Line 11	1.56	11	-0.04	23	-0.11	44	0.75	66	-2.66	36	-0.40	42	1.93	53	-4.22	30	493
Line 12	2.88	6	0.05	59	-0.36	31	-0.08	26	-4.23	27	-0.73	51	1.39	48	4.23	47	435
Line 13	0.48	23	0.03	50	0.40	68	1.36	73	4.34	72	-1.41	67	0.20	41	24.50	65	672
Line 14	1.35	14	-0.03	26	0.38	66	-0.01	32	0.79	57	-0.86	58	-2.79	20	14.05	56	483
Line 16	-1.80	69	-0.01	38	-0.49	25	-0.52	11	-4.14	28	1.55	5	9.29	73	-7.43	23	505
Line 17	1.56	12	0.00	43	0.18	58	1.01	71	-0.46	48	-0.11	34	-1.06	33	-6.96	24	577
Line 18	1.03	16	-0.03	27	-0.08	47	0.09	36	2.60	62	-1.22	64	-1.12	32	-9.31	19	420
Line 19	0.15	28	0.02	46	0.02	50	0.63	62	-2.61	37	-1.03	60	-2.39	24	-15.26	2	536
Line 20	-0.04	32	-0.01	35	0.43	69	0.38	51	-2.34	40	0.34	22	0.47	42	-10.87	15	510

DTE: Days to tassel emergence, DEE: Days to ear emergence, Ch: Chlorophyll rate, Il: Ion leakage, TLS: Total leaf surface, RWC: Relative water content, APWP: Aerial part weight of plant, WETP: Weight of ear together with pods, NGRE: Number of grain rows per ear, GD: Grain diameter, GW: Grain width, GH: Grain height, CW: Cob's weight, CT: Canopy temperature, EDWG: Ear diameter without grain, DFLWT: Distance from the flag leaf width to the tassel, DWFL: Dry weight of flag leaf, LANG: Leaf angle, LFNT: Length of first node to tassel, LNE: Leaf number on ear, NGR: Number of grain per row, NBT: Number of Branches in Tassel, TL: Tassel length, WEWoutP: Weight of ear without pods, GWME: Grain weight in main ear. *and **: Not-significant and significant at 5% and 1% probability levels, respectively.

 

 

[1]. Salt overly sensitive

2. Mitogen-activated protein kinase

[3]. Reactive oxygen species

[4]. Breeding value

5. General combining ability

[6]. Best liner unbiased prediction

[7]. Incidence matrices

[8]. Restricted maximum likelihood (REML)

[9]. Identity matrix