شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب مثبت برای سازگاری با ارتفاع بالا در گوسفندان ایرانی | ||
| علوم دامی ایران | ||
| دوره 55، شماره 1، بهار 1403، صفحه 143-162 اصل مقاله (1.86 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2023.353223.653925 | ||
| نویسندگان | ||
| زهرا پتی آبادی1؛ محمد رزم کبیر* 1؛ علی اسمعیلی زاده کشکوئیه2؛ محمدحسین مرادی3؛ امیر رشیدی4 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران | ||
| 2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران | ||
| 3گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک، اراک، ایران | ||
| 4گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران. | ||
| چکیده | ||
| شناسایی نشانههای انتخاب، اطلاعاتی در مورد مراحل تکامل گونههای مختلف از جمله گوسفند، که منجر به تغییراتی در سطح ژنوم آنها در طی سالیان متمادی میشود، را فراهم میکند. هدف از این پژوهش شناسایی نشانههای ژنومی انتخاب در گوسفندان مناطق مرتفع کشور ایران بود. بدین منظور 58 رأس گوسفند از 4 نژاد که دو نژاد در مناطق مرتفع و دو نژاد در مناطق پست پراکندهاند، با استفاده از آرایههای گوسفندk 600 تعیین ژنوتیپ شدند. جهت شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب FST (تتا) و hapFLK استفاده شد. با استفاده از آزمون تتا، 22 منطقه ژنومی به عنوان مناطق تحت انتخاب شناسایی شدند. در آزمون hapFLK نیز 15 منطقه ژنومی شناسایی شد. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنومی با ژنهای موثر بر سازگاری با شرایط کم اکسیژنی (TXNDC5)، خونسازی (FANCA)، ایمنیزایی و مقابله با عفونت (LEF1، NMUR1، PTMA و COPS7B)، تنظیم فشار خون و پاسخ به درد و التهاب (NMUR1) و سرکوب سرطان (CD82، GAS8، PRMT1، B3GNT7 و ...) همپوشانی دارند. بررسی QTLهای گزارش شده نیز نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با میانگین غلظت هموگلوبین گلبولهای قرمز، هماتوکریت، مشخصات گوشت، لاشه، شیر، وزن بدن، تراکم استخوان و تعداد کل برههای متولد شده در ارتباط میباشند. با توجه به اینکه تحقیقات کمی در رابطه با سازگاری با ارتفاع در گوسفندان انجام شده است، لذا نتایج این تحقیق میتواند اطلاعات سودمندی در رابطه با ژنهایی که به سازگاری با ارتفاع پاسخ میدهند، ارایه دهد. به هر حال، به منظور شناسایی و بررسی دقیقتر جهشهای عامل در ژنها و QTLهای شناسایی شده ضروری است که پژوهشهای تکمیلی بیشتری صورت گیرد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| آزمون FST؛ آزمون hapFLK؛ ارتفاع از سطح دریا؛ پویش ژنومی؛ نشانههای انتخاب | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 947 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 550 |
||