پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 161 |
| تعداد شماره‌ها | 6,573 |
| تعداد مقالات | 71,036 |
| تعداد مشاهده مقاله | 125,507,025 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,770,908 |
فیلوژنی مولکولی و واگرایی عملکردی یوریدین دی فسفات گلیکوزیل ترانسفرازهای (UGT) موجود در جنس زعفران و همولوگ‌های آن در سایر گیاهان | ||
| علوم باغبانی ایران | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 22 مهر 1403 اصل مقاله (1.08 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijhs.2024.368681.2135 | ||
| نویسندگان | ||
| مریم فلاح؛ روح‌انگیز نادری؛ سید علیرضا سلامی* | ||
| گروه علوم باغبانی و مهندسی فضای سبز، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| چکیده | ||
| چکیده زعفران زراعی با نام علمی Crocus sativus L. یکی از منابع غنی از آپوکاروتنوئیدها شامل کروسین، پیکروکروسین و سافرانال است. آپوکاروتنوئیدها از شکست اکسیداتیو کاروتنوئیدها حاصل می‌گردند. در فرآیند بیوسنتز کروسین، مرحله نهایی گلیکوزیلاسیون است. این مرحله بسیار مهم است زیرا به رنگدانه خصوصیات حلالیت در آب را می‌بخشد و خواص شیمیایی و زیست فعالی مولکول را تغییر می‌دهد. در این مطالعه، توالی پروتئینی UGTهای موجود در زعفران، همراه با همولوگ‌های آنها در سایر گیاهان از دیدگاه‌های مختلف شامل آنالیز فیلوژنی و شناسایی موتیف، آنالیز واگرایی عملکردی و آنالیز ساختاری مورد بررسی قرار گرفت. تمرکز مطالعه روی UGT هایی بود که مسئول گلیکوزیلاسیون اولیه و ثانویه در تولید کروسین هستند. همچنین رابطه تکاملی خانواده پروتئین UGT در زعفران و گیاهان دیگر مورد بررسی قرار گرفت که واگرایی عملکردی نوع یک و نوع دو را شامل می‌شود. آنالیز فیلوژنی نشان داد که UGT که گلیکوزیلاسیون اولیه را برعهده دارند با UGT که گلیکوزیلاسیون ثانویه را انجام می دهند در دو گروه کاملا جداگانه قرار گرفتند. بیشترین تفاوت عملکردی را نیز این دو گروه داشتند. در هر گروه موتیف‌هایی یافت شد که اختصاصی همان گروه بوده است و در این موتیف‌های اختصاصی، اسید آمینه‌هایی با ضریب واگرایی عملکردی بالا شناسایی شده که می توان این واحدها را به تفاوت عملکردی این توالی‌ها نسبت داد. این یافته‌ها ممکن است تحقیقات آینده را با هدف مشخص کردن عملکرد این ژن‌ها تسهیل کند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| گلیکوزیل ترانسفراز؛ UGTs؛ فیلوژنی پروتئین؛ شناسایی موتیف | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Molecular Phylogeny and Functional Divergence of Uridine Diphosphate Glycosyltransferases (UGTs) in Crocus Genus and their Homologues in Other Plants | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Maryam Fallah؛ Roohangiz Naderi؛ Seyed Alireza Salami | ||
| Department of Horticultural sciences,, Faculty of Agriculture, University of Tehran, Karaj, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| ABSTRACT Crocus sativus L. is considered one of the richest sources of apocarotenoids, including crocin, picrocrocin, and safranal. The oxidative breakdown of carotenoids generates apocarotenoids. Glycosylation is the final step of crocin biosynthesis which is crucial due to its role in pigment solubility in water and changes the chemical properties and bioactivity of the molecule. In this study, the protein sequence of UGTs in saffron and their homologs in other plants were analyzed from different aspects, including phylogeny analysis and motif identification, functional divergence analysis, and structural analysis. The present study focused on UGTs responsible for primary and secondary glycosylation in crocin production and picrocrocin glycosylation in plants where crocin is found. Also, the evolutionary relationship of the UGT protein family in Crocus and other plants was investigated, including type I and type II functional divergence. Phylogeny analysis showed that UGTs that carry out primary glycosylation and UGTs that carry out secondary glycosylation were placed in two groups with the highest functional distance. Motifs were group-specific and amino acids with a high functional divergence coefficient were identified in those motifs, which can be attributed to the functional difference of these sequences. These findings may facilitate future research aimed at characterizing the function of these genes | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Glycosyltransferases, UGTs, Protein phylogeny, Motif identification | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 54 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 49 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب