پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 161 |
| تعداد شماره‌ها | 6,573 |
| تعداد مقالات | 71,037 |
| تعداد مشاهده مقاله | 125,520,963 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,780,528 |
استفاده از روش آماری بیز در شناسایی عوامل ژنتیکی موثر بر وزن بدن در سنین نهایی رشد در یک جمعیت از جوجه های گوشتی آمیخته | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 13 آذر 1403 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2024.379554.654021 | ||
| نویسندگان | ||
| زینب عسگری* 1؛ علیرضا احسانی1؛ علی اکبر مسعودی1؛ رسول واعظ ترشیزی2 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران | ||
| 2گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس تهران ایران | ||
| چکیده | ||
| صفت وزن بدن به‌عنوان یک صفت پلی‌ژنیک در اصلاح نژاد دام اثر بالایی بر سودآوری صنعت پرورش مرغ دارد. ازاین‌رو، شناسایی جایگاه‌های ژنتیکی مرتبط با این صفت حائز اهمیت است. در مطالعات پویش ژنوم معمولی، تجزیه‌وتحلیل‌ها بر اساس رگرسیون تک نوکلئوتیدی بر حسب فنوتیپهای مشاهده‌شده می‌باشد. در این روش‌ها، فرض بر این است که کل متغیرهای ژنتیکی، از یک توزیع آماری نرمال پیروی می‌کنند که با یافته‌های جدید در مورد نقش بیشتر برخی جایگاه‌های ژنومی و نقش کمتر برخی دیگر، همخوانی ندارد. برخلاف این روش‌ها، در روش‌های بیزی، امکان تعریف بیش از یک توزیع آماری برای اثرات متغیرها وجود دارد. ازاین‌رو، مطالعه‌ی حاضر باهدف شناسایی نشانگرهای تک مارکری مؤثر بر صفت وزن بدن مرغ در سنین پایانی رشد (9، 10، 11 و 12 هفتگی) و با استفاده از اطلاعات نسل دوم جوجه‌های آمیخته ایجاد شده از تلاقی دوطرفه بین لاین آرین و مرغ‌های بومی استان آذربایجان با استفاده از روش بیز Cpi انجام شد. در نهایت، 10 نشانگر معنی‌دار برای وزن بدن در سنین مختلف شناسایی شدند. این SNPها به‌صورت سببی و یا به‌واسطه وجود عدم تعادل پیوستگی با هشت ژن که بر روی شش کروموزوم توزیع‌شده‌اند، به‌طور معنی‌داری بر صفات مورد مطالعه اثرگذارند. از ژن‌های شناسایی شده، هفت ژن، کد کننده پروتئین و یک ژن ncRNA می-باشند. برای شناسایی ژن‌های مرتبط با هر SNP در مناطق کاندیدا، Mb 5/0 اطراف هر SNP معنی‌دار در نظر گرفته شد. نتایج مطالعه حاضر، در انتخاب ژنومی و انتخاب به کمک نشانگر یا ژن برای بهبود سرعت رشد در مرغ موثر می‌باشند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| روش بیزین؛ وزن بدن؛ ژن کاندیدا؛ مطالعه پویش کل ژنوم؛ چندشکلی تک نوکلئوتیدی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Using Bayes statistical method in identifying genetic factors affecting body weight at the final ages of growth in a population of mixed broiler chickens | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Zeinab Asgari1؛ Alireza Ehsani1؛ Ali Akbar Masoudi1؛ Rasoul Vaez Torshizi2 | ||
| 1Department of Animal Sciences, Agricultural Faculty, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran | ||
| 2Department of Animal Science, Agricultural Faculty, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Body weight trait as a polygenic trait in animal breeding has a high impact on the profitability of poultry industry. For this reason, identifying the genetic loci associated with this trait is important. In typical GWAS, the analyses are based on the regression of single nucleotides on the observed phenotypes. In these methods, it is assumed that all genetic variables follow a normal statistical distribution which this is inconsistent with new findings about the role of some genomic loci. In contrast to these methods, in the Bayesian method it is possible to define more than one statistical distribution for the effects of variables. Therefore, the present study was performed to identify causal single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with body weight in 9, 10, 11 and 12 weeks of age, in an F2 crossbred chicken population between Arian line and native chickens of Azerbaijan province using BayesCpi methodology. Finally, 10 significant markers for body weight at different ages were identified. These SNPs are close to or within 8 genes and are distributed on 6 chromosomes. Of the above genes, 7 genes encode proteins and 1 ncRNA gene. To identify genes associated with each SNP in candidate regions, 0.5 Mb around each SNP was considered significant. Results can be used in genomic selection and marker or gene assisted selection to improve growth rate in chicken. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Bayesian method, Body weight, Candidate gene, Genome-wide association study, Single nucleotide polymorphism | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 58 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب