پویش ژنومی نشانههای انتخاب در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقاله 3، دوره 46، شماره 2، 1394، صفحه 119-131 اصل مقاله (745.78 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2015.55643 | ||
| نویسندگان | ||
| مهدی مخبر1؛ محمد مرادی شهربابک* 2؛ مصطفی صادقی3؛ حسین مرادی شهربابک3؛ جان ویلیامز4 | ||
| 1دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد، گروه مهندسی علوم دامی دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 2استاد گروه مهندسی علوم دامی دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 3استادیار گروه مهندسی علوم دامی دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 4استاد و مدیر بخش ژنومیک مرکز تحقیقات Padano، ایتالیا | ||
| چکیده | ||
| شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب بودهاند، از بحثبرانگیزترین مباحث در حوزة تحقیقات ژنتیک حیوانی، بهخصوص در حیوانات اهلی است. در این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم که در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفتهاند، اجرا شده است. بدین منظور 148 رأس گاومیش رودخانهای شامل جمعیتهای خوزستانی (121 رأس) و مازندرانی (27 رأس)، به وسیلة آرایههای ژنومیکی Axiom® Buffalo Genotyping 90K تعیین ژنوتیپ شدند. جهت جستجوی نشانههای انتخاب از برآوردگر نااُریب FST (θ) استفاده شد. در مجموع 23 منطقه که نشانگرهای SNP آنها بالاتر از 1/0 درصد حد بالای توزیع تجربی FST بود، بهعنوان نشانههای انتخاب شناسایی شده و مورد بررسیهای بیشتر قرار گرفتند. بعد از انطباق مناطق ژنومی انتخابشده با مناطق ژنومی متناظر آن روی ژنوم گاو (UMD3.1 Bos Taurus Genome)، 64 ژن و 27 QTL شناسایی شد. تعدادی از این ژنها در مطالعات قبلی نیز بهعنوان نشانههای انتخاب گزارش شدهاند. برخی از این ژنها احتمالاً در مسیرهای بیولوژیکی که با اهلیشدن حیوانات (توسعة مغز و عملکردهای رفتاری، پیگماسیون و آداپتهشدن به محیط زندگی و شرایط جغرافیایی) و تولید شیر مرتبط میباشند، درگیرند. بررسیها همچنین نشان داد که QTLهای شناساییشده در این تحقیق با صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با راندمان تبدیل غذایی، وزن بدن، چربی زیرپوستی، افزایش وزن روزانه، تیپ، تردی گوشت، ترکیبات شیر، اتصالات پستانی، اندازة گوساله و گوسالهزایی آسان ارتباط دارند. به هرحال جهت شناسایی نقش دقیق این ژنها و QTLها لازم است مطالعات پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام گیرد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| پویش ژنوم؛ شاخص تمایز جمعیتی؛ گاومیش خوزستانی و مازندرانی؛ نشانههای انتخاب | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,665 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,696 |
||