تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,572 |
تعداد مقالات | 71,006 |
تعداد مشاهده مقاله | 125,494,469 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,755,494 |
بررسی ارتباط چندشکلی تک نوکلئوتیدی ژن STAT1 با صفات تولید شیر در گاوهای براون سوئیس | ||
تولیدات دامی | ||
مقاله 1، دوره 18، شماره 3، آبان 1395، صفحه 377-386 اصل مقاله (533.45 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jap.2016.59389 | ||
نویسندگان | ||
هنگامه وفایی1؛ مجتبی حسین پور مشهدی* 2 | ||
1دانشآموخته کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران | ||
2استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران | ||
چکیده | ||
چندشکلی تکنوکلئوتیدی ژن STAT1 با روش PCR-RFLP و ارتباط آن با صفات تولید شیر در گاوهای شیری نژاد براونسوئیس بررسی شد. تعداد ۹۸ رأس گاو شیری نژاد براونسوئیس به طور تصادفی از گاوداریهای صنعتی مشهد انتخاب و خونگیری ازورید دمی انجام شد. استخراج DNA با استفاده از کیت آماده انجام شد. یک قطعه دارای ۳۱۴ جفت باز در ناحیه 3'UTR ژن STAT1 با روش PCR تکثیر و سپس قطعه مورد نظر توسط آنزیم برشی Pag1 هضم شد. فراوانیهای ژنوتیپی و ژنی با نرمافزار POPGENE (نسخه 31/1) برآورد شد. برای تجزیه و تحلیل آماری از نرمافزار آماری SAS استفاده شد. میانگین صفات با روش دانکن مقایسه شد. فراوانی ژنوتیپهای TT، TC و CCبه ترتیب 23/0 ، 25/0 و 5۲/0 بود. فراوانی آللهای T و C به ترتیب 35۵/0 و 6۴۵/0 برآورد شد. هتروزیگوسیتی مورد انتظار معادل ۰/۴۵۸ برآورد شد. آزمون مربع کای نشان داد که جمعیت مورد مطالعه در تعادل هاردیوینبرگ نمیباشد (05/0P<). تفاوت میانگین الگوهای ژنوتیپی در جایگاه ژن STAT1 برای صفات شیر (شامل تولید شیر، درصد و مقدار چربی شیر و مقدار پروتئین شیر) معنیدار نبود، ولی برای صفت درصد پروتئین شیر معنیدار بود (05/0P<). میانگین تولید شیر و مقادیر چربی و پروتئین برای ژنوتیپ CC نسبت به دو ژنوتیپ دیگر بیشتر بود. با توجه به نتایج حاصل، آلل T به عنوان آلل با فراوانی کم شناخته میشود و وجود آلل C در ژنوتیپ گاو اثر مثبت بر صفات تولید شیر، مقدار چربی و پروتئین دارد. | ||
کلیدواژهها | ||
ژن؛ صفات تولید شیر؛ نژاد براون سوئیس؛ STAT1 | ||
عنوان مقاله [English] | ||
Association of single nucleotide polymorphism of STAT1 gene with milk production traits in Brown Swiss cattle | ||
نویسندگان [English] | ||
Hengameh Vafaee1؛ Mojtaba Hosseinpour Mashhadi22 | ||
1M.Sc. Graduate, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Mashhad Branch, Islamic Azad University, Mashhad - Iran | ||
2Assistant Professor, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Mashhad Branch, Islamic Azad University, Mashhad - Iran | ||
چکیده [English] | ||
This study was conducted to investigate the Single nucleotide polymorphism of STAT1 gene by PCR-RFLP technique and association of genotypes with milk production traits in Brown Swiss dairy cattle. The blood samples of ninety eight cows were collected randomly from tail vein. The DNA was extracted with Cinagene kit (PR881612C). Fragment of 314 bp of STAT1 gene was amplified by PCR and digested by Pag1 restriction enzyme. Genotype frequencies were calculated by PopGene software (version 1.31). The SAS 9.1 software was used for statistical analysis and the mean of traits was compared by Duncan test. The genotype frequencies of TT, TC and CC were 0.23, 0.25 and 0.52 respectively. The T and C allele frequency were 0.355 and 0.645 respectively. The expected heterozygosity was estimated 0.458. Result of Chi-square showed that the population was not in the Hardy Weinberg equilibrium (P<0.05). The means of traits for milk, percent and yield of fat and yield of protein were not significant but means of percent of protein was significant(P<0.05). The mean of milk, fat and protein yield traits for CC genotype were more than two other genotypes. The results of present study show that the T allele is minor frequency allele and C allele has positive effect on milk, fat and protein yield traits. | ||
کلیدواژهها [English] | ||
Brown Swiss breed, Gene, Milk production traits, STAT1 | ||
مراجع | ||
1 . Akira S (1999) Functional roles of STAT family proteins: Lessons from knockout mice. Stem Cells 17:138–146. 2 . Ashwell MS, Heyen DW, Sonstegard TS, Van Tassell CP, VanRaden PM, Ron M, Weller JI and Lewin HA (2004) Detection of quantitative trait loci affecting milk production, health and reproductive traits in Holstein cattle. Journal of Dairy Science. 87: 468-475. 3 . Band MR, Larson JH, Rebeiz M, Green CA, Heyen DW, Donovan J, Windish R, Steining C, Mahyuddin P, Womack JE and Lewin HA (2000) An ordered comparative map of the cattle and human genomes. Genome Research. 10: 1359-1368. 4 . Bole-Feysot C, GoffinV, Edery M, Binart N and Kelly PA (2005) Prolactin (PRL) and its receptor: Actions, signal transduction pathways and phenotypes observed in PRL receptor knockout mice. Endocrin Reviews. 19: 225-268. 5 . Boutinaud M and Jammes H (2004) Growth hormone increases Stat5 and Stat1 expression in lactating goat mammary gland: A specific effect compared to milking frequency. Domestic Animal Endocrinology. 27: 363-378. 6 . Brym P, Kaminski S and Ruoeæ A (2004) New SSCP polymorphism within bovine STAT5A gene and its associations with milk performance traits in Black and White and Jersey cattle. Journal of Applied Genetics. 45: 445-452. 7 . Cobanoglu O, Zaitoun I, Chang YM, Shook GE and Khatib H (2006) Effects of the signal transducer and activator of transcription1 (STAT1) gene on milk production traits in Holstein dairy cattle. Journal of Dairy Science. 89: 4433-4437. 8 . Darnell J E (1997) STATs and gene regulation. Science. 277: 1630-1635. 9 . De Koning D (2006) Conflicting candidates for cattle QTLs. Trends Genetic. 22: 301-305. 10 . Khatib H, Huang W, Mikheil D, Schutzkus V and.Monson L (2009) Effects of signal transducer and activator of transcription (STAT) genes STAT1and STAT3 genotypic combinations on fertilization and embryonic survival rates in Holstein cattle. Journal of Dairy Science. 92: 6186-6191. 11 . Khatkar MS, Thomson PC, Tammenand I and.Raadsma HW (2004) Quantitative trait loci mapping in dairy cattle: Review and meta-analysis. Genetic Selectin Evolution. 36: 163-190. 12 . Kumar M, Vohra V, Ratwan P and Chakravarty AK (2015) Exploring polymorphism in 3' UTR region of STAT1 gene in different Buffalo breeds. Indian Journal of Dairy Science. 68(5): 473-476. 13 . Li C, Sun D, Zhang S, Wang S, Wu X, Zhang Q, Li Y and Qiao L (2014) Genome Wide Association Study Identifies 20 Novel Promising Genes Associated with Milk Fatty Acid Traits in Chinese Holstein. PLoS ONE. 9(5): e96186. 14 . Mackinnon MJ and Georges MAJ (1998) Marker assisted pre selection of young dairy sires prior to progeny-testing. Livestock Production Science. 54: 229-250. 15 . Pollak EJ (2005) Application and impact of new genetic technologies on beef cattle breeding: a ‘real world’ perspective. Australian Journal of Experimental Agriculture. 45: 739-748. 16 . Rychtarova J, Sztankoova Z, Kyselova J, Zink V, Stipkova M, Vacek M and Stolc L (2014) Effect of DGAT1, BTN1A1, OLR1, and STAT1 genes on milk production and reproduction traits in the Czech Fleckvieh breed. Czech Journal of Animal Science. 59(2): 45-53. 17 . SAS (2005) Statistics analysis system user’s Guide. Release 9.1. SAS Institute Inc., Cary, North Carolina, USA. 18 . Soller M (1994) Marker assisted selection-An overview. Animal Biotechnology. 3: 193-201. 19 . Stewart WC, Morriso RF, Young SL and Stephens JM (1999) Regulation of signal transducers and activators of transcription (STATs) by effectors of adipogenesis: Coordinate regulation of STATs 1, 5A, and 5B with peroxisome proliferator-activated receptor- γ and C/AAAT enhancer binding protein-α. Biochimica et Biophysica Acta. 1452: 188–196. 20 . Tucker HA (2000) Hormones, mammary growth, and lactation: A 41-year perspective. Journal of Dairy Science. 83: 874-884 21 . Watson CJ (2001) STAT transcription factors in mammary gland development and tumor genesis. Journal of Mammary Gland Biology and Neoplasia. 6: 115-127. 22 . Yeh FC and Yong RC (1990) PopGene version 1.31. University of Alberta. 23 . Yonekura S, Miyazaki H and Tokutake Y (2015) Comparative Expression Profiling of Lactogenic Hormone Receptor and It’s Signaling Molecules of Bovine Mammary Glands during lactation. Open Journal of Animal Sciences. 5: 106-113 24 . Zimin AV, Delcher AL, Florea L, Kelley DR, Schatz MC, Puiu D, Hanrahan F, Pertea G, Van Tassell CP, Sonstegard TS, Marçais G, Roberts M, Subramanian P, Yorke JA and Salzberg SL (2009) A whole-genome assembly of the domestic cow, Bos Taurus. Genome Biology. 10(4): R42. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,396 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,164 |